More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0932 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0932  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 327 aa  643    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  61.66 
 
 		 326 aa  385  1e-106  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.629074  normal  0.0111881 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1013  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  64.42 
 
 		 326 aa  383  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3195  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  62.04 
 
 		 326 aa  378  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421019  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0978  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  47.28 
 
 		 307 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2475  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  46.01 
 
 		 307 aa  264  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3085  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.54 
 
 		 307 aa  263  4e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.520498  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4455  O-acetylserine lyase  46.18 
 
 		 307 aa  259  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4453  O-acetylserine lyase  46.18 
 
 		 307 aa  259  4e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4269  O-acetylserine lyase  46.18 
 
 		 307 aa  259  4e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4106  cysteine synthase  46.18 
 
 		 307 aa  259  4e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4117  cysteine synthase  46.18 
 
 		 307 aa  259  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4601  O-acetylserine lyase  46.18 
 
 		 307 aa  259  4e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4506  O-acetylserine lyase  46.18 
 
 		 307 aa  259  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0207318  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0744  O-acetylserine lyase  46.18 
 
 		 307 aa  258  8e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4220  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  46.18 
 
 		 307 aa  258  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4492  O-acetylserine lyase  45.86 
 
 		 307 aa  256  5e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.986798  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0885  cysteine synthase  44.69 
 
 		 303 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  45.45 
 
 		 302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1287  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  44.23 
 
 		 304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.870324  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1759  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  46.79 
 
 		 303 aa  233  4.0000000000000004e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  39.68 
 
 		 302 aa  229  5e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  42.99 
 
 		 310 aa  222  7e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1228  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.21 
 
 		 302 aa  218  7.999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0481  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  44.3 
 
 		 318 aa  218  8.999999999999998e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000231361  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0494  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.3 
 
 		 318 aa  218  8.999999999999998e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00183291  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  40.58 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  41.3 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  41.3 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  40.85 
 
 		 312 aa  216  5e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0162  cysteine synthase  45.6 
 
 		 305 aa  215  7e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  38.78 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0166  cysteine synthase family protein  40.97 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  44.55 
 
 		 306 aa  210  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  38.89 
 
 		 298 aa  208  9e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0094  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  41.37 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  39.1 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  43.51 
 
 		 306 aa  206  6e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  43.13 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  37.3 
 
 		 304 aa  203  3e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1720  cysteine synthase  41.16 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0556189 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  42.12 
 
 		 307 aa  203  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  40.91 
 
 		 305 aa  202  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  40.32 
 
 		 311 aa  202  5e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  37.58 
 
 		 332 aa  202  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1476  cysteine synthase A  42.46 
 
 		 324 aa  202  7e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  39.03 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1553  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  45.57 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222613  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  37.27 
 
 		 461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  43.45 
 
 		 308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  42.81 
 
 		 323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  41.48 
 
 		 305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  38.02 
 
 		 315 aa  199  5e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  39.81 
 
 		 303 aa  199  6e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  37.42 
 
 		 307 aa  199  6e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  42.07 
 
 		 306 aa  198  7.999999999999999e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  39.87 
 
 		 304 aa  198  9e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  43.27 
 
 		 307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  39.42 
 
 		 302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0478  cysteine synthases  37.3 
 
 		 773 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00249553  hitchhiker  0.000140585 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  40.31 
 
 		 455 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0509  cysteine synthase  45.31 
 
 		 302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.445859  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.89 
 
 		 459 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  42.81 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.69 
 
 		 459 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  43.33 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  40.45 
 
 		 320 aa  196  3e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  41.21 
 
 		 310 aa  197  3e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2103  cysteine synthase  41.29 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0401259  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.39 
 
 		 459 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  41.85 
 
 		 308 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3068  cysteine synthase A  41.27 
 
 		 316 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145676  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  42.17 
 
 		 307 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  38.89 
 
 		 311 aa  196  6e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  39.54 
 
 		 302 aa  195  7e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  42.31 
 
 		 307 aa  195  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  39.94 
 
 		 305 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  39.61 
 
 		 305 aa  195  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  37.82 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1438  cysteine synthase A  38.41 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.412307  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  37.39 
 
 		 459 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  38.85 
 
 		 321 aa  193  4e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0149  cysteine synthase  37.94 
 
 		 306 aa  192  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1954  cysteine synthase A  38.98 
 
 		 305 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1653  cysteine synthase A  38.66 
 
 		 305 aa  192  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  37.25 
 
 		 306 aa  192  7e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  41.27 
 
 		 309 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  40.55 
 
 		 456 aa  192  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2712  cysteine synthase  45.19 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.470857  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1674  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.6 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  41.14 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  35.69 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  42.33 
 
 		 290 aa  191  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  38.51 
 
 		 320 aa  192  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1691  cysteine synthase A  39.3 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6440  cysteine synthase A  40.2 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  41.27 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1831  cysteine synthase A  38.66 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  40.95 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1694  cysteine synthase A  37.99 
 
 		 331 aa  190  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>