More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0509 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0509  cysteine synthase  100 
 
 
302 aa  595  1e-169  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.445859  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2995  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  69.42 
 
 
327 aa  421  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.511755  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1674  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  70.15 
 
 
324 aa  415  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1358  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  71.38 
 
 
305 aa  412  1e-114  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.695081  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2310  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  69.74 
 
 
308 aa  403  1e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.775083 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  51.79 
 
 
307 aa  260  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  46.89 
 
 
310 aa  258  8e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  49.51 
 
 
307 aa  255  8e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  45.42 
 
 
310 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  45.42 
 
 
310 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  47.06 
 
 
312 aa  249  4e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  47.87 
 
 
315 aa  248  8e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  50.51 
 
 
306 aa  242  5e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  45.87 
 
 
304 aa  241  9e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1657  cysteine synthase A  53.2 
 
 
322 aa  241  1e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  45.87 
 
 
321 aa  240  2e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  51.19 
 
 
291 aa  240  2e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  43.41 
 
 
304 aa  241  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  45.6 
 
 
302 aa  240  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  48.32 
 
 
303 aa  239  2.9999999999999997e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  44.88 
 
 
301 aa  239  4e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  46.41 
 
 
312 aa  238  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  49.83 
 
 
290 aa  236  4e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  47.52 
 
 
306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  51.23 
 
 
306 aa  233  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  43.83 
 
 
304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  46.73 
 
 
307 aa  232  5e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  45.25 
 
 
306 aa  232  5e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  46.73 
 
 
307 aa  229  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  46.73 
 
 
307 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  44.66 
 
 
302 aa  229  5e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  46.86 
 
 
305 aa  228  7e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  46.86 
 
 
305 aa  228  9e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  46.41 
 
 
307 aa  228  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1734  cysteine synthase  46.18 
 
 
301 aa  228  1e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.30022  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  46.73 
 
 
307 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  47.06 
 
 
307 aa  227  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  46.73 
 
 
307 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  46.73 
 
 
307 aa  226  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  46.73 
 
 
307 aa  226  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  46.41 
 
 
307 aa  226  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  46.73 
 
 
307 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1210  cysteine synthase  47.52 
 
 
305 aa  226  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.473529  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  46 
 
 
311 aa  226  4e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  45.75 
 
 
307 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  47.08 
 
 
307 aa  226  5.0000000000000005e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  49.01 
 
 
323 aa  226  5.0000000000000005e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3006  cysteine synthase A  49.17 
 
 
305 aa  225  9e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.599463  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3723  cysteine synthase  49.17 
 
 
305 aa  225  9e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  49.82 
 
 
309 aa  223  3e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  46.91 
 
 
305 aa  223  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2103  cysteine synthase  44.19 
 
 
305 aa  222  7e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0401259  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6147  cysteine synthase A  46.53 
 
 
305 aa  222  8e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2712  cysteine synthase  50.82 
 
 
304 aa  221  9e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.470857  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  51.79 
 
 
314 aa  221  9e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  46.58 
 
 
309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  46.2 
 
 
305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  44.19 
 
 
311 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6440  cysteine synthase A  46.2 
 
 
305 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4297  cysteine synthase  48.51 
 
 
321 aa  219  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2304  cysteine synthase  46.18 
 
 
310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  46.58 
 
 
309 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  46.58 
 
 
309 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  47.08 
 
 
310 aa  219  6e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  46.91 
 
 
309 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  49.35 
 
 
308 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  47.57 
 
 
310 aa  217  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  46.03 
 
 
306 aa  217  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0858  cysteine synthase B  41.88 
 
 
300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.947605 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  46.25 
 
 
311 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0865  cysteine synthase  44.41 
 
 
306 aa  216  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26961  O-acetylserinethiol lyase/cysteine synthase  48.96 
 
 
305 aa  216  4e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  48.69 
 
 
308 aa  216  5e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1337  cysteine synthase A  51.69 
 
 
310 aa  216  5e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.241539  normal  0.869018 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  46.86 
 
 
320 aa  216  5e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  47.54 
 
 
305 aa  215  7e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0380  cysteine synthase B  42.14 
 
 
318 aa  215  7e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  42.67 
 
 
306 aa  215  7e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0346  cysteine synthase B  42.14 
 
 
318 aa  215  8e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  47.56 
 
 
309 aa  215  9e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  45.93 
 
 
311 aa  215  9e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  46.53 
 
 
320 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  45.51 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1529  cysteine synthase A  43.75 
 
 
300 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000033727  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1720  cysteine synthase  43.93 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0556189 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0787  cysteine synthase B  41.23 
 
 
300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.280782 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  46.53 
 
 
309 aa  213  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  46.58 
 
 
318 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  46.93 
 
 
328 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1322  cysteine synthase A  43.42 
 
 
300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353191  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0917  cysteine synthase B  41.88 
 
 
300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0822  cysteine synthase A  44.87 
 
 
308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.326455 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02140  cysteine synthase  44.94 
 
 
317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.445604  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3031  cysteine synthase B  43.77 
 
 
296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  46.41 
 
 
308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0731  cysteine synthase B  41.75 
 
 
311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  46.1 
 
 
309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  47.23 
 
 
311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  47.71 
 
 
308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  46.08 
 
 
306 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>