More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2310 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2310  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 
308 aa  610  9.999999999999999e-175  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.775083 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1358  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  75.57 
 
 
305 aa  427  1e-118  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.695081  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0509  cysteine synthase  69.74 
 
 
302 aa  414  1e-114  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.445859  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2995  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  65.05 
 
 
327 aa  377  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.511755  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1674  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  63.3 
 
 
324 aa  374  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  50.34 
 
 
310 aa  257  2e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  48.66 
 
 
310 aa  256  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  48.66 
 
 
310 aa  256  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  50.68 
 
 
315 aa  256  3e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  52.27 
 
 
307 aa  246  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  49.66 
 
 
303 aa  245  6.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  47.1 
 
 
312 aa  241  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  50 
 
 
307 aa  235  7e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  46.13 
 
 
312 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  46.25 
 
 
306 aa  233  3e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  49.84 
 
 
307 aa  232  5e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  50.67 
 
 
306 aa  230  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  45.39 
 
 
301 aa  229  3e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  49.19 
 
 
307 aa  228  7e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  51.08 
 
 
291 aa  228  7e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  47.54 
 
 
306 aa  228  8e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  48.86 
 
 
307 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  48.53 
 
 
307 aa  228  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  49.51 
 
 
307 aa  228  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  48.53 
 
 
307 aa  227  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  48.86 
 
 
307 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  48.86 
 
 
307 aa  227  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  48.86 
 
 
307 aa  227  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2712  cysteine synthase  54.88 
 
 
304 aa  227  2e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.470857  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  48.86 
 
 
307 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  48.53 
 
 
307 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  44.63 
 
 
302 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  43.42 
 
 
321 aa  225  7e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  41.29 
 
 
304 aa  224  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  52.96 
 
 
306 aa  223  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  48.05 
 
 
307 aa  223  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  50 
 
 
290 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  51.97 
 
 
308 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  50.7 
 
 
309 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1210  cysteine synthase  45.72 
 
 
305 aa  220  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.473529  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  45.42 
 
 
302 aa  220  3e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1529  cysteine synthase A  46.85 
 
 
300 aa  220  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000033727  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  51.32 
 
 
308 aa  219  6e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1322  cysteine synthase A  47.55 
 
 
300 aa  218  8.999999999999998e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353191  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02140  cysteine synthase  47.59 
 
 
317 aa  218  1e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.445604  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  47.4 
 
 
306 aa  217  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  42.57 
 
 
304 aa  216  5e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1720  cysteine synthase  43 
 
 
302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0556189 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  45.42 
 
 
305 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  45.33 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1734  cysteine synthase  46.62 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.30022  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  43.73 
 
 
302 aa  213  1.9999999999999998e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0822  cysteine synthase A  45.31 
 
 
308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.326455 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1657  cysteine synthase A  50.5 
 
 
322 aa  213  3.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  49.68 
 
 
323 aa  212  5.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0865  cysteine synthase  43.65 
 
 
306 aa  212  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  44.44 
 
 
305 aa  211  9e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  45.07 
 
 
307 aa  211  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  45.95 
 
 
307 aa  211  1e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  44.41 
 
 
320 aa  211  1e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  45.28 
 
 
305 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  43.33 
 
 
304 aa  210  2e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1287  cysteine synthase B  44.23 
 
 
299 aa  210  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.257463 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  42.11 
 
 
298 aa  210  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1861  cysteine synthase B  42.53 
 
 
295 aa  211  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1987  cysteine synthase B  44.01 
 
 
306 aa  211  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121319 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  47.57 
 
 
318 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  45.48 
 
 
304 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  41.1 
 
 
307 aa  210  3e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0964  cysteine synthase B  44.12 
 
 
297 aa  209  4e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  48.44 
 
 
309 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3726  cysteine synthase B  42.07 
 
 
300 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  45.34 
 
 
311 aa  209  5e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1438  cysteine synthase A  41.42 
 
 
305 aa  209  6e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1692  cysteine synthase B  43.32 
 
 
300 aa  208  7e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0917  cysteine synthase B  43.87 
 
 
300 aa  208  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  48.44 
 
 
309 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0858  cysteine synthase B  43.55 
 
 
300 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.947605 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0731  cysteine synthase B  43.73 
 
 
311 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  48.6 
 
 
311 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  48.6 
 
 
311 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  47.16 
 
 
305 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  50.49 
 
 
314 aa  207  2e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  39.09 
 
 
307 aa  207  2e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  48.44 
 
 
309 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2900  cysteine synthase B  43.37 
 
 
301 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3006  cysteine synthase A  46.73 
 
 
305 aa  206  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.599463  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3723  cysteine synthase  46.73 
 
 
305 aa  206  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3031  cysteine synthase B  43.1 
 
 
296 aa  206  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0787  cysteine synthase B  43.55 
 
 
300 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.280782 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1636  cysteine synthase B  44.11 
 
 
298 aa  206  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2103  cysteine synthase  42.81 
 
 
305 aa  206  5e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0401259  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3005  cysteine synthase B  44.91 
 
 
308 aa  205  6e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.951108  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0162  cysteine synthase  46.51 
 
 
305 aa  205  6e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3172  cysteine synthase B  41.61 
 
 
300 aa  206  6e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2560  cysteine synthase B  44.05 
 
 
300 aa  205  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2386  cysteine synthase B  43.04 
 
 
301 aa  205  8e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2212  cysteine synthase B  44.72 
 
 
307 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.199065 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  48.23 
 
 
309 aa  205  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  44.04 
 
 
306 aa  204  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.865285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>