More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1657 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1657  cysteine synthase A  100 
 
 		 322 aa  645    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  69.28 
 
 		 315 aa  434  1e-121  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  66.89 
 
 		 303 aa  420  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  55.03 
 
 		 310 aa  335  7e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  56 
 
 		 312 aa  335  9e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  55.03 
 
 		 310 aa  328  7e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  55.03 
 
 		 310 aa  328  7e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  54.33 
 
 		 312 aa  325  6e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  57.34 
 
 		 306 aa  322  7e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  57.82 
 
 		 307 aa  308  6.999999999999999e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  55.59 
 
 		 291 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  55.1 
 
 		 290 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  51.52 
 
 		 304 aa  306  4.0000000000000004e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  54.67 
 
 		 307 aa  305  6e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  57.53 
 
 		 308 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  54.15 
 
 		 310 aa  302  5.000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  55.78 
 
 		 307 aa  301  9e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  58.39 
 
 		 309 aa  300  3e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  57.53 
 
 		 306 aa  299  4e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  54.73 
 
 		 307 aa  298  6e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  53 
 
 		 310 aa  295  1e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  50.5 
 
 		 315 aa  294  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  52.81 
 
 		 309 aa  291  9e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  49.32 
 
 		 304 aa  291  1e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  54.67 
 
 		 307 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  54.67 
 
 		 307 aa  290  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  54.67 
 
 		 307 aa  290  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  54.67 
 
 		 307 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  54.67 
 
 		 307 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  48.84 
 
 		 311 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  54.33 
 
 		 307 aa  288  6e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  54.67 
 
 		 307 aa  288  7e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  48.31 
 
 		 304 aa  288  9e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  55 
 
 		 307 aa  287  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  50.17 
 
 		 311 aa  288  1e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  54 
 
 		 307 aa  288  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  55.81 
 
 		 308 aa  286  4e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  53.36 
 
 		 308 aa  286  5e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  54.33 
 
 		 307 aa  285  9e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1438  cysteine synthase A  51.01 
 
 		 305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.412307  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  52 
 
 		 302 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  51.49 
 
 		 309 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  52.7 
 
 		 307 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  53.36 
 
 		 308 aa  281  8.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1653  cysteine synthase A  51.34 
 
 		 305 aa  281  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2658  cysteine synthase  57.38 
 
 		 310 aa  281  1e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.556672 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1691  cysteine synthase A  51.01 
 
 		 305 aa  280  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1697  cysteine synthase A  51.01 
 
 		 305 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1831  cysteine synthase A  51.01 
 
 		 305 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  53.14 
 
 		 309 aa  280  3e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1954  cysteine synthase A  51.01 
 
 		 305 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  54.08 
 
 		 305 aa  279  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  52.84 
 
 		 323 aa  279  5e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1837  cysteine synthase A  50.67 
 
 		 305 aa  279  5e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1678  cysteine synthase A  50.34 
 
 		 305 aa  279  6e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.423565  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3506  cysteine synthase A  50.67 
 
 		 305 aa  279  6e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1875  cysteine synthase A  50.34 
 
 		 305 aa  279  6e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101872 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1919  cysteine synthase A  50.67 
 
 		 305 aa  278  7e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468327  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  51.99 
 
 		 308 aa  278  8e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0484  cysteine synthase A  49.67 
 
 		 324 aa  278  9e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.261567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2623  cysteine synthase A  47.83 
 
 		 329 aa  277  1e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  49.83 
 
 		 301 aa  278  1e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  54.18 
 
 		 309 aa  276  2e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  49.49 
 
 		 321 aa  277  2e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1480  cysteine synthase A  51.01 
 
 		 296 aa  276  3e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1476  cysteine synthase A  49.34 
 
 		 324 aa  276  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  50.83 
 
 		 311 aa  276  4e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  52.13 
 
 		 317 aa  275  5e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1734  cysteine synthase  51.37 
 
 		 301 aa  276  5e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.30022  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  53.02 
 
 		 305 aa  275  6e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  50.17 
 
 		 304 aa  275  6e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  54.21 
 
 		 309 aa  275  6e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  51.83 
 
 		 310 aa  275  6e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  51.5 
 
 		 309 aa  275  7e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  55.33 
 
 		 308 aa  275  7e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  51.83 
 
 		 309 aa  275  8e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  45.7 
 
 		 307 aa  275  9e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  51.5 
 
 		 310 aa  275  9e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  51.5 
 
 		 309 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0149  cysteine synthase  50.17 
 
 		 306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  55 
 
 		 308 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  48.63 
 
 		 302 aa  273  2.0000000000000002e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  50.33 
 
 		 306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  53.49 
 
 		 309 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  52.51 
 
 		 309 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3068  cysteine synthase A  51.8 
 
 		 316 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145676  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  52.35 
 
 		 306 aa  272  6e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  51.32 
 
 		 309 aa  271  8.000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  51.35 
 
 		 320 aa  271  9e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  50.68 
 
 		 305 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  56.44 
 
 		 314 aa  271  1e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  51.48 
 
 		 317 aa  271  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  49.83 
 
 		 304 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2286  cysteine synthase A  53.49 
 
 		 309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  50.34 
 
 		 305 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  50.5 
 
 		 309 aa  269  4e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  52.51 
 
 		 309 aa  269  4e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  52.16 
 
 		 311 aa  269  4e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  52.01 
 
 		 311 aa  269  5e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  47.1 
 
 		 461 aa  268  7e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>