More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1480 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1480  cysteine synthase A  100 
 
 
296 aa  597  1e-170  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  62.5 
 
 
291 aa  374  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  63.57 
 
 
290 aa  374  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  54.61 
 
 
312 aa  315  5e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  54.11 
 
 
315 aa  310  2e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  52.05 
 
 
303 aa  308  6.999999999999999e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  53.92 
 
 
312 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1231  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  57.73 
 
 
285 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  50 
 
 
310 aa  302  4.0000000000000003e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  50.34 
 
 
310 aa  302  5.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  50.34 
 
 
310 aa  302  5.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  52.86 
 
 
304 aa  298  6e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1734  cysteine synthase  52.22 
 
 
301 aa  297  2e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.30022  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  53.9 
 
 
311 aa  293  3e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  53.08 
 
 
306 aa  292  4e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  55.67 
 
 
306 aa  291  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0464  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  56.01 
 
 
294 aa  289  3e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000032783  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  52.19 
 
 
311 aa  289  4e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  52.04 
 
 
304 aa  288  5.0000000000000004e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  50.67 
 
 
301 aa  286  2.9999999999999996e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  51.89 
 
 
307 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  54.3 
 
 
302 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  52.88 
 
 
320 aa  282  5.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  49.32 
 
 
323 aa  280  3e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  52.88 
 
 
320 aa  278  5e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  55.7 
 
 
317 aa  278  8e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  53.08 
 
 
308 aa  278  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  54.05 
 
 
306 aa  276  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  48.8 
 
 
304 aa  276  2e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  48.66 
 
 
321 aa  276  3e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  52.16 
 
 
317 aa  276  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  49.48 
 
 
304 aa  276  3e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  52.22 
 
 
309 aa  275  5e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  53.58 
 
 
309 aa  275  5e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  51.86 
 
 
320 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  52.03 
 
 
307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  46.96 
 
 
306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1438  cysteine synthase A  48.63 
 
 
305 aa  273  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  52.58 
 
 
307 aa  273  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  53.54 
 
 
313 aa  272  4.0000000000000004e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  55.14 
 
 
305 aa  272  6e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  54.24 
 
 
311 aa  271  7e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  52.58 
 
 
307 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  52.23 
 
 
307 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  52.23 
 
 
307 aa  271  9e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  50.83 
 
 
310 aa  271  9e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  48.12 
 
 
311 aa  271  1e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  51.35 
 
 
307 aa  271  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  50.83 
 
 
307 aa  271  1e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  46.84 
 
 
302 aa  271  1e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  52.58 
 
 
307 aa  270  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  51.89 
 
 
307 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  51.89 
 
 
307 aa  270  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  51.89 
 
 
307 aa  270  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  51.55 
 
 
307 aa  270  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  51.89 
 
 
307 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0902  cysteine synthase A  52.76 
 
 
299 aa  270  2e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000036612  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2776  cysteine synthase A  55.41 
 
 
312 aa  270  2e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  52.88 
 
 
310 aa  268  5.9999999999999995e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  47.46 
 
 
302 aa  268  5.9999999999999995e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  47.3 
 
 
307 aa  268  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1476  cysteine synthase A  50.17 
 
 
324 aa  267  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  52.86 
 
 
308 aa  268  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  50.34 
 
 
307 aa  267  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0162  cysteine synthase  51.37 
 
 
305 aa  267  2e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3068  cysteine synthase A  49.5 
 
 
316 aa  267  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145676  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  47.81 
 
 
305 aa  267  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  53.06 
 
 
311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  46.62 
 
 
305 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1091  cysteine synthase  53.24 
 
 
303 aa  265  5e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000826995  decreased coverage  0.00308217 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1529  cysteine synthase A  52.51 
 
 
300 aa  265  5.999999999999999e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000033727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1322  cysteine synthase A  51.01 
 
 
300 aa  265  8e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353191  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  45.95 
 
 
305 aa  264  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  50 
 
 
307 aa  264  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0149  cysteine synthase  48.65 
 
 
306 aa  264  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  52.56 
 
 
309 aa  264  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6147  cysteine synthase A  46.28 
 
 
305 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  51.84 
 
 
327 aa  263  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2103  cysteine synthase  48.31 
 
 
305 aa  263  3e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0401259  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  48.48 
 
 
306 aa  263  3e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6440  cysteine synthase A  46.28 
 
 
305 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  52.2 
 
 
310 aa  263  4e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1657  cysteine synthase A  51.01 
 
 
322 aa  263  4e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1832  cysteine synthase A  48.5 
 
 
317 aa  263  4e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.118091  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02140  cysteine synthase  44.74 
 
 
317 aa  261  8e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.445604  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0822  cysteine synthase A  46.28 
 
 
308 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.326455 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1653  cysteine synthase A  50.85 
 
 
305 aa  261  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  50.67 
 
 
308 aa  261  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  46.1 
 
 
306 aa  261  1e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  50.85 
 
 
308 aa  261  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  51.01 
 
 
316 aa  261  1e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4297  cysteine synthase  48.31 
 
 
321 aa  261  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0990  cysteine synthase A  51.38 
 
 
299 aa  260  2e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.0058381  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1697  cysteine synthase A  50.51 
 
 
305 aa  260  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  52.84 
 
 
324 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1831  cysteine synthase A  50.51 
 
 
305 aa  260  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1438  cysteine synthase A  50.17 
 
 
305 aa  260  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.412307  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  51.86 
 
 
320 aa  259  3e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  47.26 
 
 
307 aa  259  3e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1875  cysteine synthase A  50.17 
 
 
305 aa  259  4e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>