More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1231 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1231  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  100 
 
 		 285 aa  566  1e-160  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  59.93 
 
 		 291 aa  335  2.9999999999999997e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  58.89 
 
 		 290 aa  330  2e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1480  cysteine synthase A  57.73 
 
 		 296 aa  304  1.0000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0464  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  57.34 
 
 		 294 aa  290  3e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000032783  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  52.56 
 
 		 312 aa  266  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1734  cysteine synthase  50.68 
 
 		 301 aa  264  1e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.30022  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0162  cysteine synthase  52.74 
 
 		 305 aa  264  1e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  50.34 
 
 		 304 aa  261  6.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  49.15 
 
 		 310 aa  261  8e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  51.88 
 
 		 312 aa  261  8.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  50.87 
 
 		 301 aa  259  4e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  48.29 
 
 		 307 aa  257  1e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  47.44 
 
 		 310 aa  255  7e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  47.44 
 
 		 310 aa  255  7e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  48.79 
 
 		 321 aa  251  1e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  48.98 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  50.68 
 
 		 311 aa  250  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0902  cysteine synthase A  48.96 
 
 		 299 aa  249  5e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000036612  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  48.97 
 
 		 304 aa  247  1e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  44.79 
 
 		 298 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  52.68 
 
 		 317 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  50.68 
 
 		 302 aa  244  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  46.76 
 
 		 315 aa  242  6e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  45.92 
 
 		 303 aa  242  7e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0990  cysteine synthase A  47.95 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.0058381  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  51.19 
 
 		 309 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1529  cysteine synthase A  52.92 
 
 		 300 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000033727  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  48.99 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  47.26 
 
 		 304 aa  236  3e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  46.36 
 
 		 317 aa  235  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1322  cysteine synthase A  51.89 
 
 		 300 aa  235  6e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353191  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  51.02 
 
 		 305 aa  235  6e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  48.45 
 
 		 307 aa  235  6e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  47.67 
 
 		 311 aa  234  9e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  51.36 
 
 		 311 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  48.97 
 
 		 307 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  43.69 
 
 		 304 aa  233  3e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  52.9 
 
 		 308 aa  233  3e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  49.32 
 
 		 307 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  51.71 
 
 		 306 aa  231  7.000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  48.63 
 
 		 307 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  50.56 
 
 		 307 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  48.8 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  48.45 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  48.45 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  48.45 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  48.81 
 
 		 309 aa  231  2e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  48.45 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  48.82 
 
 		 311 aa  230  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  47.96 
 
 		 306 aa  229  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  44.83 
 
 		 302 aa  229  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  45.39 
 
 		 311 aa  228  6e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  46.1 
 
 		 320 aa  228  8e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1091  cysteine synthase  47.65 
 
 		 303 aa  228  9e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000826995  decreased coverage  0.00308217 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  47.96 
 
 		 307 aa  228  9e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  48.45 
 
 		 307 aa  227  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  46.42 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  48.29 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1224  cysteine synthase A  45.64 
 
 		 300 aa  226  3e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.47956e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  45.27 
 
 		 320 aa  225  6e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  50.17 
 
 		 317 aa  225  6e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0149  cysteine synthase  44.9 
 
 		 306 aa  225  6e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  49.15 
 
 		 309 aa  225  6e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  50.17 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  45.76 
 
 		 320 aa  224  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1832  cysteine synthase A  43 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.118091  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  50.17 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3068  cysteine synthase A  43 
 
 		 316 aa  223  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145676  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  47.44 
 
 		 307 aa  223  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  45.64 
 
 		 307 aa  223  3e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0369  cysteine synthase  45.3 
 
 		 316 aa  223  3e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.425105  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  49.66 
 
 		 308 aa  222  4e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3085  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.21 
 
 		 307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.520498  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  45.08 
 
 		 306 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  45.42 
 
 		 305 aa  222  6e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  50 
 
 		 308 aa  222  7e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1476  cysteine synthase A  45.48 
 
 		 324 aa  221  8e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  42.95 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  45.82 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  49.83 
 
 		 317 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  41.69 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  45.42 
 
 		 323 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3006  cysteine synthase A  43.39 
 
 		 305 aa  219  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.599463  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3723  cysteine synthase  43.39 
 
 		 305 aa  219  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  49.32 
 
 		 309 aa  219  5e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  49.16 
 
 		 313 aa  219  6e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  47.44 
 
 		 307 aa  217  1e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  48.29 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  43.05 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  44.33 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  48.31 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  43.05 
 
 		 305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0822  cysteine synthase A  45.36 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.326455 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  49.16 
 
 		 327 aa  216  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  47.47 
 
 		 308 aa  216  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1438  cysteine synthase A  41.78 
 
 		 305 aa  216  4e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  47.32 
 
 		 320 aa  215  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  41.89 
 
 		 306 aa  216  5e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  47.32 
 
 		 328 aa  215  8e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>