More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0464 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0464  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 294 aa  593  1e-168  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000032783  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  55.21 
 
 		 291 aa  299  5e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  54.86 
 
 		 290 aa  296  3e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1480  cysteine synthase A  56.01 
 
 		 296 aa  287  1e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1231  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  57.34 
 
 		 285 aa  286  2e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0902  cysteine synthase A  48.11 
 
 		 299 aa  261  1e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000036612  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0990  cysteine synthase A  47.42 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.0058381  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  48.62 
 
 		 304 aa  249  3e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  47.26 
 
 		 315 aa  249  5e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  48.98 
 
 		 311 aa  248  6e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  46.21 
 
 		 304 aa  248  8e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1734  cysteine synthase  49.66 
 
 		 301 aa  246  4e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.30022  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  45.7 
 
 		 310 aa  245  6e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  46.92 
 
 		 312 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  45.36 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  45.36 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0162  cysteine synthase  50.17 
 
 		 305 aa  238  6.999999999999999e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  45.55 
 
 		 303 aa  237  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  46.23 
 
 		 312 aa  235  6e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  44.55 
 
 		 304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  43.64 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0149  cysteine synthase  42.21 
 
 		 306 aa  229  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  44.04 
 
 		 307 aa  229  4e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  45.73 
 
 		 304 aa  229  6e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  44.18 
 
 		 311 aa  229  6e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  47.47 
 
 		 309 aa  228  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1224  cysteine synthase A  45.61 
 
 		 300 aa  228  1e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.47956e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  45.61 
 
 		 307 aa  226  3e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  44.44 
 
 		 301 aa  224  9e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  47.42 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  48.11 
 
 		 302 aa  223  3e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  44.83 
 
 		 302 aa  221  9e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  48.65 
 
 		 311 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  48.98 
 
 		 309 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  42.47 
 
 		 311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  47.59 
 
 		 307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  44.86 
 
 		 306 aa  219  6e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  44.18 
 
 		 320 aa  218  7e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0920  cysteine synthase A  47.79 
 
 		 253 aa  218  1e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000222574  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1476  cysteine synthase A  42.58 
 
 		 324 aa  218  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0484  cysteine synthase A  43.23 
 
 		 324 aa  218  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.261567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  47.96 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  44.1 
 
 		 321 aa  217  2e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  44.55 
 
 		 317 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2286  cysteine synthase A  47.28 
 
 		 309 aa  216  4e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  46.96 
 
 		 317 aa  215  8e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  43.49 
 
 		 320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  50.34 
 
 		 308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1413  cysteine synthase  45.3 
 
 		 324 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  47.78 
 
 		 311 aa  212  5.999999999999999e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3068  cysteine synthase A  40.26 
 
 		 316 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145676  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2776  cysteine synthase A  47.42 
 
 		 312 aa  212  7e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  45.73 
 
 		 316 aa  212  7e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  47.59 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1322  cysteine synthase A  49.31 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353191  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  46.58 
 
 		 308 aa  210  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  46.9 
 
 		 307 aa  209  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  46.9 
 
 		 307 aa  210  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  46.58 
 
 		 309 aa  210  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  47.24 
 
 		 307 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  44.18 
 
 		 318 aa  209  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  42.81 
 
 		 320 aa  209  5e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  46.9 
 
 		 307 aa  209  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  46.9 
 
 		 307 aa  209  5e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  46.9 
 
 		 307 aa  209  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  46.9 
 
 		 307 aa  209  5e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  46.9 
 
 		 307 aa  209  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1301  cysteine synthase A  44.9 
 
 		 309 aa  209  5e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.568697 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1832  cysteine synthase A  40 
 
 		 317 aa  209  5e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.118091  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3871  cysteine synthase A  45.64 
 
 		 324 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.674292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6147  cysteine synthase A  43.3 
 
 		 305 aa  209  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1438  cysteine synthase A  46.23 
 
 		 305 aa  208  7e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.412307  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  46.55 
 
 		 307 aa  207  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  45.02 
 
 		 308 aa  208  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1529  cysteine synthase A  48.61 
 
 		 300 aa  208  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000033727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  46.55 
 
 		 307 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1790  cysteine synthase  43.18 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.475157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  46.26 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  47.42 
 
 		 306 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4092  cysteine synthase A  45.64 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  47.3 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  45.58 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3986  cysteine synthase A  44.97 
 
 		 335 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  45.24 
 
 		 309 aa  206  4e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  42.42 
 
 		 323 aa  206  5e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32850  Cysteine synthase K/M:Cysteine synthase K  45.48 
 
 		 325 aa  206  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  41.32 
 
 		 298 aa  206  5e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  42.96 
 
 		 306 aa  206  5e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29110  cysteine synthase A  45.64 
 
 		 324 aa  205  6e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0015278 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1919  cysteine synthase A  45.21 
 
 		 305 aa  205  7e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468327  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  46.39 
 
 		 305 aa  205  8e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1697  cysteine synthase A  45.21 
 
 		 305 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1653  cysteine synthase A  45.55 
 
 		 305 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1954  cysteine synthase A  45.55 
 
 		 305 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  42.07 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0664  cysteine synthase K/M/A  43.27 
 
 		 328 aa  204  1e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2520  cysteine synthase A  43.29 
 
 		 341 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1831  cysteine synthase A  45.21 
 
 		 305 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1691  cysteine synthase A  45.55 
 
 		 305 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6440  cysteine synthase A  42.61 
 
 		 305 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.796756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>