More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0162 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0162  cysteine synthase  100 
 
 
305 aa  605  9.999999999999999e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  59.59 
 
 
320 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  58.9 
 
 
320 aa  323  3e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  51.83 
 
 
304 aa  322  5e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  53.09 
 
 
311 aa  319  5e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  51.33 
 
 
307 aa  316  3e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  57.77 
 
 
308 aa  314  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  50 
 
 
304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  55.22 
 
 
304 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  52.16 
 
 
310 aa  309  4e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  52.79 
 
 
317 aa  305  7e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  56.38 
 
 
320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  54.88 
 
 
318 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  53.29 
 
 
310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  55.63 
 
 
310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  56.29 
 
 
308 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  55.37 
 
 
309 aa  304  2.0000000000000002e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  55.08 
 
 
311 aa  301  1e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  51.52 
 
 
312 aa  298  6e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  53.92 
 
 
311 aa  298  8e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1301  cysteine synthase A  54.85 
 
 
309 aa  298  1e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.568697 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  49.32 
 
 
304 aa  296  2e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  54.1 
 
 
308 aa  296  2e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  55.41 
 
 
311 aa  296  2e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  55.22 
 
 
311 aa  296  2e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  50.33 
 
 
311 aa  296  4e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  54.64 
 
 
309 aa  295  5e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  54.67 
 
 
310 aa  295  5e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  54.88 
 
 
309 aa  295  5e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  55.33 
 
 
309 aa  294  1e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  56.21 
 
 
320 aa  294  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  53.44 
 
 
317 aa  294  1e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  51.15 
 
 
309 aa  293  2e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  53.59 
 
 
320 aa  293  3e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  54.39 
 
 
308 aa  293  3e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  52.77 
 
 
320 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  53.09 
 
 
330 aa  292  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  56.9 
 
 
309 aa  292  5e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  53.8 
 
 
309 aa  292  6e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  52.35 
 
 
310 aa  291  7e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  52.13 
 
 
317 aa  291  9e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  56.95 
 
 
306 aa  291  9e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  55.07 
 
 
308 aa  291  9e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  56.52 
 
 
305 aa  290  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  55.74 
 
 
308 aa  289  4e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  50.85 
 
 
312 aa  289  4e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2623  cysteine synthase A  50.17 
 
 
329 aa  288  7e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  52.13 
 
 
323 aa  288  8e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  55.63 
 
 
310 aa  287  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  52.61 
 
 
320 aa  287  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  50.67 
 
 
310 aa  287  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  53.27 
 
 
309 aa  288  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  50.67 
 
 
310 aa  287  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  52.73 
 
 
339 aa  288  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  56.04 
 
 
309 aa  288  1e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  54.18 
 
 
316 aa  287  1e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0902  cysteine synthase A  48.81 
 
 
299 aa  287  1e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000036612  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  56.95 
 
 
314 aa  286  2e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  54.55 
 
 
327 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  53.57 
 
 
320 aa  286  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  53.27 
 
 
320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  53.44 
 
 
311 aa  286  4e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  55.41 
 
 
309 aa  285  8e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0149  cysteine synthase  51.35 
 
 
306 aa  285  8e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  54.67 
 
 
311 aa  285  8e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2286  cysteine synthase A  56.38 
 
 
309 aa  285  9e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  53.77 
 
 
327 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  54.55 
 
 
311 aa  284  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  52.32 
 
 
309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  54.61 
 
 
310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  53.31 
 
 
309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1111  cysteine synthase A  54.1 
 
 
311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0492008  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1502  cysteine synthase A  53.42 
 
 
321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18267e-17 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  52.75 
 
 
329 aa  283  4.0000000000000003e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2658  cysteine synthase  55.3 
 
 
310 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.556672 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  54.49 
 
 
309 aa  282  6.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  51.47 
 
 
313 aa  281  1e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  52.17 
 
 
328 aa  281  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  47.7 
 
 
304 aa  281  1e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  51.33 
 
 
303 aa  281  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  53.77 
 
 
311 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  51.8 
 
 
309 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1476  cysteine synthase A  51.49 
 
 
324 aa  281  1e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  54.08 
 
 
308 aa  280  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  52.88 
 
 
311 aa  281  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  53.87 
 
 
327 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  53.44 
 
 
311 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  53.27 
 
 
319 aa  280  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  52.86 
 
 
311 aa  280  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09450  cysteine synthase  52.19 
 
 
311 aa  280  3e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.424611  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  53.29 
 
 
309 aa  280  3e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0444  cysteine synthase A  54.9 
 
 
320 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00894315 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0433  cysteine synthase A  54.9 
 
 
320 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  52.61 
 
 
309 aa  279  4e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  55.08 
 
 
311 aa  279  5e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3593  cysteine synthase  52.84 
 
 
309 aa  277  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471921  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  52.63 
 
 
316 aa  278  1e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  46.6 
 
 
298 aa  277  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  51.16 
 
 
302 aa  277  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  52.54 
 
 
308 aa  277  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>