More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1655 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  100 
 
 
315 aa  645    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  80.86 
 
 
303 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1657  cysteine synthase A  69.28 
 
 
322 aa  387  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  52.16 
 
 
310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  50.99 
 
 
310 aa  316  3e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  50.99 
 
 
310 aa  316  3e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  55.59 
 
 
306 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  57.52 
 
 
306 aa  301  9e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  51.32 
 
 
312 aa  300  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  48.69 
 
 
304 aa  297  1e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1438  cysteine synthase A  52.29 
 
 
305 aa  296  3e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.412307  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  47.88 
 
 
304 aa  296  4e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  53.42 
 
 
308 aa  295  5e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  52.13 
 
 
307 aa  295  6e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  52.7 
 
 
290 aa  295  8e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  53.04 
 
 
291 aa  293  2e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2361  cysteine synthase A  52.6 
 
 
307 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  49.67 
 
 
312 aa  291  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1691  cysteine synthase A  52.49 
 
 
305 aa  290  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1653  cysteine synthase A  51.63 
 
 
305 aa  290  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3506  cysteine synthase A  52.16 
 
 
305 aa  290  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1697  cysteine synthase A  51.31 
 
 
305 aa  289  4e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1831  cysteine synthase A  51.31 
 
 
305 aa  289  4e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1954  cysteine synthase A  51.31 
 
 
305 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1480  cysteine synthase A  54.11 
 
 
296 aa  289  5.0000000000000004e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1678  cysteine synthase A  51.31 
 
 
305 aa  288  6e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.423565  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1837  cysteine synthase A  52.16 
 
 
305 aa  288  6e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1875  cysteine synthase A  51.31 
 
 
305 aa  288  6e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101872 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1919  cysteine synthase A  52.16 
 
 
305 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468327  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  52.61 
 
 
305 aa  286  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  52.84 
 
 
323 aa  286  2.9999999999999996e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0149  cysteine synthase  49.01 
 
 
306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1301  cysteine synthase A  52.58 
 
 
309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.568697 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  52.29 
 
 
307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  53.11 
 
 
307 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  50.99 
 
 
307 aa  282  6.000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  52.7 
 
 
307 aa  281  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  47.23 
 
 
304 aa  279  4e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  52.13 
 
 
307 aa  278  6e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  52.13 
 
 
307 aa  278  6e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  52.13 
 
 
307 aa  278  6e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  52.13 
 
 
307 aa  278  6e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  52.46 
 
 
307 aa  278  6e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  49.84 
 
 
310 aa  279  6e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  52.13 
 
 
307 aa  278  7e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  51.8 
 
 
307 aa  277  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  52.13 
 
 
307 aa  277  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  52.13 
 
 
307 aa  276  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  49.19 
 
 
310 aa  276  5e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1438  cysteine synthase A  47.06 
 
 
305 aa  275  7e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  51.13 
 
 
309 aa  275  1.0000000000000001e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2362  cysteine synthase  49.02 
 
 
307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306184  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  54.67 
 
 
308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  54.67 
 
 
308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1922  cysteine synthase A  50 
 
 
307 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  50.65 
 
 
308 aa  273  3e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  49.51 
 
 
302 aa  272  5.000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  47.9 
 
 
311 aa  272  7e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  52.46 
 
 
309 aa  271  9e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  51.3 
 
 
309 aa  270  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  52.46 
 
 
306 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  47.19 
 
 
306 aa  270  2.9999999999999997e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  47.04 
 
 
321 aa  269  4e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  49.19 
 
 
308 aa  269  5e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  50 
 
 
307 aa  267  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  48.81 
 
 
302 aa  267  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0822  cysteine synthase A  47.19 
 
 
308 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.326455 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  49.03 
 
 
310 aa  266  4e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  48.54 
 
 
308 aa  265  5e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  47.88 
 
 
320 aa  265  7e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  46.71 
 
 
301 aa  264  1e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  44.88 
 
 
302 aa  264  1e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  48.84 
 
 
305 aa  264  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  47.84 
 
 
305 aa  264  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  48.99 
 
 
305 aa  263  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1734  cysteine synthase  47.35 
 
 
301 aa  264  2e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.30022  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  49.02 
 
 
307 aa  264  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  45.97 
 
 
304 aa  264  2e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1529  cysteine synthase A  49.66 
 
 
300 aa  263  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000033727  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0865  cysteine synthase  48.84 
 
 
306 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  46.3 
 
 
307 aa  263  3e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  44.09 
 
 
311 aa  263  3e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  46.6 
 
 
310 aa  263  3e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  50.16 
 
 
309 aa  263  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0955  cysteine synthase A  48.87 
 
 
305 aa  262  4.999999999999999e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2658  cysteine synthase  51.94 
 
 
310 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.556672 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  47.56 
 
 
320 aa  262  6e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  48.23 
 
 
309 aa  262  6e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  44.44 
 
 
315 aa  262  6.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1322  cysteine synthase A  49.32 
 
 
300 aa  262  6.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353191  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  48.17 
 
 
306 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  47.06 
 
 
308 aa  261  8e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  46.98 
 
 
318 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  44.12 
 
 
307 aa  261  1e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  46.23 
 
 
311 aa  261  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  50.48 
 
 
310 aa  260  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  48.04 
 
 
309 aa  260  2e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  48.23 
 
 
320 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  48.21 
 
 
309 aa  260  2e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26961  O-acetylserinethiol lyase/cysteine synthase  50.52 
 
 
305 aa  260  2e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>