More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3445 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  100 
 
 		 305 aa  615  1e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  87.21 
 
 		 305 aa  548  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  85.57 
 
 		 305 aa  543  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  87.21 
 
 		 305 aa  542  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0865  cysteine synthase  84.97 
 
 		 306 aa  535  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  83.93 
 
 		 306 aa  533  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  83.88 
 
 		 307 aa  531  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4297  cysteine synthase  83.61 
 
 		 321 aa  510  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3006  cysteine synthase A  83.28 
 
 		 305 aa  509  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.599463  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3723  cysteine synthase  83.28 
 
 		 305 aa  509  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  78.69 
 
 		 306 aa  494  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1210  cysteine synthase  79.61 
 
 		 305 aa  480  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.473529  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2103  cysteine synthase  75.74 
 
 		 305 aa  476  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0401259  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6440  cysteine synthase A  76.32 
 
 		 305 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6147  cysteine synthase A  76.32 
 
 		 305 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  72.94 
 
 		 302 aa  456  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  60.07 
 
 		 306 aa  393  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  61.72 
 
 		 302 aa  387  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  56.15 
 
 		 312 aa  335  5.999999999999999e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  54.49 
 
 		 312 aa  324  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  58.67 
 
 		 306 aa  315  5e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  52.86 
 
 		 310 aa  306  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  53.02 
 
 		 310 aa  306  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  53.02 
 
 		 310 aa  306  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  58.05 
 
 		 306 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1091  cysteine synthase  54.33 
 
 		 303 aa  304  1.0000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000826995  decreased coverage  0.00308217 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  56.9 
 
 		 307 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  59.46 
 
 		 308 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  58.78 
 
 		 308 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  52.33 
 
 		 302 aa  296  3e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  54.82 
 
 		 307 aa  295  7e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  58.14 
 
 		 308 aa  295  9e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  55.52 
 
 		 324 aa  292  5e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  49.17 
 
 		 304 aa  292  5e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  56.19 
 
 		 309 aa  292  6e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  56.44 
 
 		 309 aa  292  6e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  56.9 
 
 		 307 aa  291  7e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  56.19 
 
 		 309 aa  291  8e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  54.97 
 
 		 307 aa  291  8e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  54.1 
 
 		 308 aa  291  9e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  56.9 
 
 		 307 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  56.19 
 
 		 309 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  54.46 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  56.57 
 
 		 307 aa  290  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  56.9 
 
 		 307 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  56.9 
 
 		 307 aa  290  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  56.9 
 
 		 307 aa  290  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  56.9 
 
 		 307 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  54.1 
 
 		 311 aa  290  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  56.9 
 
 		 307 aa  289  3e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  55.85 
 
 		 326 aa  289  4e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  55.85 
 
 		 326 aa  289  4e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  51.67 
 
 		 321 aa  289  4e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  53.47 
 
 		 306 aa  289  4e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  54.28 
 
 		 307 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  54.42 
 
 		 305 aa  289  5.0000000000000004e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  54.61 
 
 		 307 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  51.33 
 
 		 301 aa  288  6e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  56.23 
 
 		 307 aa  288  6e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  53.14 
 
 		 311 aa  288  9e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  56.23 
 
 		 307 aa  287  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0913  cysteine synthase A  55.18 
 
 		 325 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  53.97 
 
 		 308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  55.45 
 
 		 309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  55.15 
 
 		 309 aa  281  7.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  53.29 
 
 		 339 aa  279  4e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  54.52 
 
 		 320 aa  279  4e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  54.64 
 
 		 318 aa  279  5e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1529  cysteine synthase A  52.68 
 
 		 300 aa  279  5e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000033727  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  55 
 
 		 308 aa  278  9e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  53.85 
 
 		 327 aa  278  9e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  49.18 
 
 		 311 aa  278  1e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1322  cysteine synthase A  52.35 
 
 		 300 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353191  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  54.46 
 
 		 310 aa  276  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1557  cysteine synthase  51.72 
 
 		 349 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0822  cysteine synthase A  52.51 
 
 		 308 aa  276  4e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.326455 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  55.37 
 
 		 311 aa  275  6e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  53.36 
 
 		 311 aa  275  7e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  52.84 
 
 		 327 aa  275  8e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  55.22 
 
 		 309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  52.1 
 
 		 322 aa  274  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  52.92 
 
 		 316 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  50 
 
 		 323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  47.67 
 
 		 306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  52.68 
 
 		 320 aa  273  3e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  54.7 
 
 		 309 aa  273  3e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  54.13 
 
 		 309 aa  272  4.0000000000000004e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  54.49 
 
 		 309 aa  272  4.0000000000000004e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  49.34 
 
 		 307 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2316  cysteine synthase  50.78 
 
 		 349 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  53.8 
 
 		 309 aa  272  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1922  cysteine synthase A  50.17 
 
 		 307 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  51.31 
 
 		 330 aa  272  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  48.68 
 
 		 310 aa  272  5.000000000000001e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0149  cysteine synthase  49.5 
 
 		 306 aa  272  6e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  49.17 
 
 		 311 aa  272  6e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2362  cysteine synthase  50.83 
 
 		 307 aa  272  6e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306184  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  56.11 
 
 		 311 aa  271  7e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1632  cysteine synthase A  50.78 
 
 		 349 aa  272  7e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  53.02 
 
 		 320 aa  271  8.000000000000001e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>