More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0832 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  100 
 
 
306 aa  620  1e-176  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0537  cysteine synthase  67.32 
 
 
321 aa  371  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00106309  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  58.31 
 
 
307 aa  353  2.9999999999999997e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  53.77 
 
 
310 aa  345  5e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  53.44 
 
 
310 aa  342  4e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  53.44 
 
 
310 aa  342  4e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0334  cysteine synthase A  59.93 
 
 
308 aa  334  1e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  54.75 
 
 
307 aa  328  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  54.87 
 
 
312 aa  328  8e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  58.31 
 
 
308 aa  323  3e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  55.48 
 
 
301 aa  322  4e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  57.65 
 
 
308 aa  322  4e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0404  cysteine synthase  59.87 
 
 
308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  53.57 
 
 
312 aa  318  5e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  53.82 
 
 
321 aa  318  9e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  54.61 
 
 
306 aa  318  9e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  56.39 
 
 
307 aa  317  1e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  55.41 
 
 
307 aa  310  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  55.74 
 
 
307 aa  311  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  55.74 
 
 
307 aa  311  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  55.08 
 
 
307 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  55.08 
 
 
307 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  55.08 
 
 
307 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  55.08 
 
 
307 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  55.08 
 
 
307 aa  308  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  51.16 
 
 
307 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  54.1 
 
 
307 aa  305  6e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  52.16 
 
 
307 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  54.28 
 
 
305 aa  295  7e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  51.63 
 
 
308 aa  295  9e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  56.77 
 
 
306 aa  293  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  50.98 
 
 
306 aa  291  6e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  49.5 
 
 
307 aa  290  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  49.33 
 
 
305 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  52.27 
 
 
310 aa  287  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  52.26 
 
 
310 aa  287  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  50.49 
 
 
311 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  47.19 
 
 
315 aa  286  2.9999999999999996e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  49.68 
 
 
304 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  48.52 
 
 
304 aa  283  3.0000000000000004e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  46.82 
 
 
306 aa  280  3e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  46.18 
 
 
303 aa  279  3e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  48.82 
 
 
307 aa  279  4e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  45.72 
 
 
304 aa  279  4e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  47.67 
 
 
305 aa  278  6e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  47.33 
 
 
305 aa  278  8e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  49.84 
 
 
310 aa  278  1e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1697  cysteine synthase A  50.16 
 
 
305 aa  275  6e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1653  cysteine synthase A  50.16 
 
 
305 aa  275  6e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1831  cysteine synthase A  50.16 
 
 
305 aa  275  6e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  48.06 
 
 
307 aa  275  6e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1691  cysteine synthase A  50.16 
 
 
305 aa  275  6e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0865  cysteine synthase  48.17 
 
 
306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3006  cysteine synthase A  48.84 
 
 
305 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.599463  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3723  cysteine synthase  48.84 
 
 
305 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  48.85 
 
 
318 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1954  cysteine synthase A  49.51 
 
 
305 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1678  cysteine synthase A  49.51 
 
 
305 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.423565  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1837  cysteine synthase A  49.51 
 
 
305 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1875  cysteine synthase A  49.51 
 
 
305 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101872 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  47.32 
 
 
305 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  49.66 
 
 
306 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  46.41 
 
 
304 aa  273  2.0000000000000002e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  47.51 
 
 
302 aa  273  4.0000000000000004e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1438  cysteine synthase A  49.35 
 
 
305 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.412307  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2103  cysteine synthase  47.81 
 
 
305 aa  271  7e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0401259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3506  cysteine synthase A  49.18 
 
 
305 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1922  cysteine synthase A  50.49 
 
 
307 aa  271  9e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1919  cysteine synthase A  49.18 
 
 
305 aa  271  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468327  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6440  cysteine synthase A  47.32 
 
 
305 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  49.35 
 
 
311 aa  270  2e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6147  cysteine synthase A  47.65 
 
 
305 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  50.83 
 
 
309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  51.14 
 
 
311 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  49.51 
 
 
310 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  50.32 
 
 
309 aa  269  4e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1529  cysteine synthase A  49.01 
 
 
300 aa  269  4e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000033727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1322  cysteine synthase A  49.34 
 
 
300 aa  269  5e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353191  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  50.66 
 
 
309 aa  268  8e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  50 
 
 
310 aa  267  2e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  48.86 
 
 
309 aa  266  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  48.55 
 
 
317 aa  267  2e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1438  cysteine synthase A  46.23 
 
 
305 aa  267  2e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1210  cysteine synthase  48.15 
 
 
305 aa  265  5.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.473529  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  51.16 
 
 
302 aa  265  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  47.74 
 
 
309 aa  264  1e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4297  cysteine synthase  46.18 
 
 
321 aa  264  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09450  cysteine synthase  47.57 
 
 
311 aa  263  2e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.424611  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  47.62 
 
 
291 aa  263  3e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  48.53 
 
 
309 aa  263  4e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  46.79 
 
 
317 aa  262  4.999999999999999e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  49.35 
 
 
309 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  45.79 
 
 
302 aa  261  8e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02140  cysteine synthase  47.76 
 
 
317 aa  261  1e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.445604  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  47.73 
 
 
324 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  47.28 
 
 
290 aa  260  2e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2361  cysteine synthase A  49.18 
 
 
307 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  47.23 
 
 
311 aa  260  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  49.34 
 
 
308 aa  260  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  45.1 
 
 
307 aa  259  3e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>