More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1632 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2316  cysteine synthase  99.14 
 
 
349 aa  701    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1557  cysteine synthase  95.13 
 
 
349 aa  676    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1632  cysteine synthase A  100 
 
 
349 aa  706    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2921  cysteine synthase A  64.12 
 
 
358 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.328533  normal  0.359999 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0891  cysteine synthase A  63.82 
 
 
360 aa  427  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.680164 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_94354  predicted protein  57.06 
 
 
387 aa  419  1e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.25713  hitchhiker  0.00194835 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1109  cysteine synthase  62.06 
 
 
358 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0380662  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2771  cysteine synthase A  62.06 
 
 
358 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2901  cysteine synthase  56.67 
 
 
317 aa  363  3e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3210  cysteine synthase A  59.44 
 
 
319 aa  362  7.0000000000000005e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112501  normal  0.950187 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1942  cysteine synthase A  56.97 
 
 
319 aa  352  5e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2019  cysteine synthase  56.66 
 
 
319 aa  350  2e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02123  cysteine synthase A  58.2 
 
 
319 aa  347  2e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1086  cysteine synthase  48.79 
 
 
319 aa  294  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  50.78 
 
 
305 aa  272  8.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  49.7 
 
 
308 aa  270  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  43.89 
 
 
310 aa  269  5.9999999999999995e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  44.06 
 
 
310 aa  268  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  44.06 
 
 
310 aa  268  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  45.96 
 
 
312 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  45.65 
 
 
312 aa  266  4e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  48.76 
 
 
305 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  48.28 
 
 
305 aa  263  4e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3006  cysteine synthase A  49.38 
 
 
305 aa  262  8e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.599463  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3723  cysteine synthase  49.38 
 
 
305 aa  262  8e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  45.54 
 
 
307 aa  261  2e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  45.62 
 
 
302 aa  259  4e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0024  cysteine synthase A  47.08 
 
 
307 aa  259  4e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  48.17 
 
 
307 aa  258  8e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  46.23 
 
 
307 aa  257  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  44.72 
 
 
307 aa  252  6e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0865  cysteine synthase  47.68 
 
 
306 aa  252  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  45.6 
 
 
307 aa  252  7e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  47.02 
 
 
306 aa  250  2e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  46.5 
 
 
308 aa  249  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  45.03 
 
 
305 aa  250  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  46.46 
 
 
308 aa  249  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  47.22 
 
 
320 aa  249  4e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  45.85 
 
 
308 aa  249  5e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  47.11 
 
 
320 aa  249  7e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4297  cysteine synthase  47.2 
 
 
321 aa  248  8e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  46.39 
 
 
305 aa  248  9e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  42.81 
 
 
306 aa  248  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  44.89 
 
 
307 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  45.67 
 
 
316 aa  248  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  46.37 
 
 
306 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  43.5 
 
 
311 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6147  cysteine synthase A  45.65 
 
 
305 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  41.88 
 
 
321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  44.21 
 
 
316 aa  243  3e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  45.15 
 
 
311 aa  243  3e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1210  cysteine synthase  47.2 
 
 
305 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.473529  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  44.58 
 
 
307 aa  242  6e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  41.39 
 
 
315 aa  242  7e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  46.13 
 
 
309 aa  242  7e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2103  cysteine synthase  45.34 
 
 
305 aa  242  7.999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0401259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  44.27 
 
 
307 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6440  cysteine synthase A  45.03 
 
 
305 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  44.92 
 
 
306 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  44.58 
 
 
307 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  44.58 
 
 
307 aa  241  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  44.72 
 
 
309 aa  241  1e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  44.27 
 
 
307 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  44.27 
 
 
307 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  44.27 
 
 
307 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  44.27 
 
 
307 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0537  cysteine synthase  44.55 
 
 
321 aa  241  2e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00106309  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  44.58 
 
 
307 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  45.77 
 
 
306 aa  239  4e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  44.27 
 
 
308 aa  239  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  44.89 
 
 
307 aa  239  5e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  39.63 
 
 
304 aa  239  5e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1224  cysteine synthase A  41.98 
 
 
300 aa  239  5e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.47956e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  41.25 
 
 
301 aa  239  5e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  44 
 
 
310 aa  239  5e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  45.71 
 
 
308 aa  239  5.999999999999999e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  44.01 
 
 
311 aa  239  6.999999999999999e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  43.33 
 
 
311 aa  239  6.999999999999999e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  44.21 
 
 
339 aa  238  8e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  45.06 
 
 
310 aa  237  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0241  cysteine synthase  46.04 
 
 
315 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3068  cysteine synthase A  43.81 
 
 
316 aa  236  4e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145676  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  41.41 
 
 
307 aa  236  4e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  45.96 
 
 
309 aa  236  4e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  43.9 
 
 
309 aa  235  9e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  42.73 
 
 
311 aa  235  9e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  47.04 
 
 
309 aa  235  1.0000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  41.88 
 
 
303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  43.48 
 
 
309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  45.37 
 
 
309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1922  cysteine synthase A  43.73 
 
 
307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  42.73 
 
 
311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2362  cysteine synthase  46.3 
 
 
307 aa  233  3e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306184  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  44.72 
 
 
320 aa  233  3e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  45.59 
 
 
329 aa  233  3e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  43.71 
 
 
302 aa  233  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  43.6 
 
 
311 aa  233  5e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  45.06 
 
 
309 aa  232  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  46.32 
 
 
311 aa  232  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  44.95 
 
 
309 aa  232  8.000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>