More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02123 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02123  cysteine synthase A  100 
 
 
319 aa  645    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1942  cysteine synthase A  85.53 
 
 
319 aa  540  1e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3210  cysteine synthase A  87.15 
 
 
319 aa  540  9.999999999999999e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112501  normal  0.950187 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2019  cysteine synthase  85.53 
 
 
319 aa  539  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2901  cysteine synthase  68.15 
 
 
317 aa  434  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1086  cysteine synthase  63.21 
 
 
319 aa  397  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_94354  predicted protein  57.58 
 
 
387 aa  376  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.25713  hitchhiker  0.00194835 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1632  cysteine synthase A  58.2 
 
 
349 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1557  cysteine synthase  57.89 
 
 
349 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2316  cysteine synthase  57.28 
 
 
349 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0891  cysteine synthase A  59.09 
 
 
360 aa  350  1e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.680164 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2921  cysteine synthase A  57.7 
 
 
358 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.328533  normal  0.359999 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1109  cysteine synthase  57.1 
 
 
358 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0380662  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2771  cysteine synthase A  57.1 
 
 
358 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  51.16 
 
 
310 aa  312  3.9999999999999997e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  51.16 
 
 
310 aa  312  3.9999999999999997e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  50.83 
 
 
310 aa  308  5.9999999999999995e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  48.84 
 
 
312 aa  293  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  48.51 
 
 
312 aa  291  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  55.59 
 
 
306 aa  291  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  54.55 
 
 
308 aa  288  9e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  50.99 
 
 
307 aa  285  7e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  52.32 
 
 
306 aa  281  7.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  52.3 
 
 
307 aa  281  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  50.49 
 
 
305 aa  279  4e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  50.99 
 
 
307 aa  278  9e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  50.66 
 
 
307 aa  276  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  50.66 
 
 
307 aa  276  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  50.66 
 
 
307 aa  276  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  51.66 
 
 
307 aa  277  2e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  50.66 
 
 
307 aa  276  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  50.99 
 
 
307 aa  277  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2362  cysteine synthase  51.96 
 
 
307 aa  276  3e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306184  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  52 
 
 
307 aa  276  3e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  51.78 
 
 
310 aa  276  4e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  50.99 
 
 
307 aa  275  7e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  50.33 
 
 
307 aa  275  8e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  48.85 
 
 
311 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1922  cysteine synthase A  50.65 
 
 
307 aa  273  3e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  48.67 
 
 
307 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  50.67 
 
 
307 aa  272  7e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  50.33 
 
 
308 aa  271  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0537  cysteine synthase  50.5 
 
 
321 aa  271  1e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00106309  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  47.19 
 
 
306 aa  270  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  49.34 
 
 
307 aa  270  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2361  cysteine synthase A  51.3 
 
 
307 aa  268  8e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  47.51 
 
 
301 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  52.63 
 
 
309 aa  266  4e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  51.79 
 
 
309 aa  266  5e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0024  cysteine synthase A  48.04 
 
 
307 aa  265  8e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  47.51 
 
 
321 aa  265  8.999999999999999e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  52.43 
 
 
311 aa  265  8.999999999999999e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  45.81 
 
 
315 aa  265  1e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  49.02 
 
 
308 aa  264  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  49.83 
 
 
323 aa  263  3e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  51.8 
 
 
309 aa  262  4.999999999999999e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  52 
 
 
308 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  49.33 
 
 
305 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1224  cysteine synthase A  45.93 
 
 
300 aa  260  2e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.47956e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  50.49 
 
 
309 aa  260  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  51.33 
 
 
308 aa  259  4e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  46.15 
 
 
302 aa  259  4e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0822  cysteine synthase A  49.34 
 
 
308 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.326455 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  48.87 
 
 
311 aa  259  5.0000000000000005e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  46.98 
 
 
320 aa  258  7e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  46.82 
 
 
303 aa  258  7e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1438  cysteine synthase A  47.54 
 
 
305 aa  258  8e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  51.31 
 
 
309 aa  258  9e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  51.31 
 
 
309 aa  258  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  50.65 
 
 
309 aa  258  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1438  cysteine synthase A  47.21 
 
 
305 aa  256  4e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.412307  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1678  cysteine synthase A  47.87 
 
 
305 aa  255  7e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.423565  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  42.11 
 
 
304 aa  255  7e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1875  cysteine synthase A  47.87 
 
 
305 aa  255  7e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101872 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  50.16 
 
 
308 aa  255  7e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1837  cysteine synthase A  47.87 
 
 
305 aa  255  7e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1691  cysteine synthase A  47.87 
 
 
305 aa  255  7e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3506  cysteine synthase A  47.87 
 
 
305 aa  255  7e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1653  cysteine synthase A  47.87 
 
 
305 aa  255  8e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1954  cysteine synthase A  47.54 
 
 
305 aa  255  8e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  46.67 
 
 
305 aa  255  9e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0334  cysteine synthase A  49.17 
 
 
308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1697  cysteine synthase A  47.87 
 
 
305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1831  cysteine synthase A  47.87 
 
 
305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6147  cysteine synthase A  47.04 
 
 
305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0404  cysteine synthase  48.52 
 
 
308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  44.59 
 
 
304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  45.6 
 
 
311 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  47.59 
 
 
290 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  43.52 
 
 
306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  49.03 
 
 
310 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  46.73 
 
 
304 aa  253  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  47.88 
 
 
309 aa  253  3e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  47.73 
 
 
310 aa  253  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  50.16 
 
 
309 aa  253  3e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1919  cysteine synthase A  47.54 
 
 
305 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468327  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  49.17 
 
 
306 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  46.67 
 
 
305 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  47.93 
 
 
291 aa  252  6e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  47 
 
 
305 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>