More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2901 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2901  cysteine synthase  100 
 
 		 317 aa  650    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3210  cysteine synthase A  71.97 
 
 		 319 aa  449  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112501  normal  0.950187 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2019  cysteine synthase  67.83 
 
 		 319 aa  442  1e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1942  cysteine synthase A  67.52 
 
 		 319 aa  441  1e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02123  cysteine synthase A  68.15 
 
 		 319 aa  433  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_94354  predicted protein  58.86 
 
 		 387 aa  401  1e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.25713  hitchhiker  0.00194835 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1086  cysteine synthase  63.26 
 
 		 319 aa  393  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1557  cysteine synthase  57.27 
 
 		 349 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1632  cysteine synthase A  56.67 
 
 		 349 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2316  cysteine synthase  56.67 
 
 		 349 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0891  cysteine synthase A  58.48 
 
 		 360 aa  361  8e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.680164 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2921  cysteine synthase A  56.19 
 
 		 358 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.328533  normal  0.359999 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1109  cysteine synthase  55.59 
 
 		 358 aa  348  6e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0380662  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2771  cysteine synthase A  55.59 
 
 		 358 aa  348  6e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  50.5 
 
 		 310 aa  311  7.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  50.5 
 
 		 310 aa  311  7.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  51.16 
 
 		 310 aa  311  1e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  49.83 
 
 		 312 aa  294  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  49.5 
 
 		 312 aa  292  4e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  51.33 
 
 		 307 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  51.61 
 
 		 310 aa  285  5.999999999999999e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  52.12 
 
 		 311 aa  285  9e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  51 
 
 		 307 aa  280  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  51 
 
 		 307 aa  280  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  51.02 
 
 		 307 aa  278  7e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  52.61 
 
 		 308 aa  278  9e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  50.82 
 
 		 309 aa  278  1e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  53.4 
 
 		 314 aa  278  1e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  50.99 
 
 		 307 aa  278  1e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  51.62 
 
 		 309 aa  277  2e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  51.15 
 
 		 308 aa  276  3e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  50.49 
 
 		 309 aa  276  3e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  50.17 
 
 		 305 aa  276  3e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  49.84 
 
 		 311 aa  276  3e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  48.2 
 
 		 311 aa  276  4e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0024  cysteine synthase A  50 
 
 		 307 aa  276  4e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  51.14 
 
 		 316 aa  275  5e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  50.65 
 
 		 309 aa  275  6e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  51.13 
 
 		 311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  49.35 
 
 		 308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  51.17 
 
 		 306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  51.7 
 
 		 307 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  51.36 
 
 		 307 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  51.36 
 
 		 307 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  51.36 
 
 		 307 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  51.36 
 
 		 307 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  51.36 
 
 		 307 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  51.36 
 
 		 307 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  49.67 
 
 		 311 aa  271  1e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  48.18 
 
 		 306 aa  270  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  47.21 
 
 		 306 aa  270  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  50.33 
 
 		 308 aa  270  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  51.02 
 
 		 307 aa  269  4e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  51.02 
 
 		 307 aa  269  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  49.19 
 
 		 308 aa  269  5.9999999999999995e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  50.33 
 
 		 339 aa  268  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  47.18 
 
 		 302 aa  267  2e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  49.51 
 
 		 309 aa  266  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  48.87 
 
 		 310 aa  267  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  44.59 
 
 		 304 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  47.02 
 
 		 321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  48.71 
 
 		 316 aa  266  4e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  50.33 
 
 		 306 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  49.51 
 
 		 308 aa  265  5.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  49.19 
 
 		 309 aa  265  8e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0537  cysteine synthase  49.17 
 
 		 321 aa  265  1e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00106309  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  47.02 
 
 		 301 aa  264  1e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  48.86 
 
 		 328 aa  263  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  48.17 
 
 		 307 aa  264  2e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0241  cysteine synthase  50 
 
 		 315 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1322  cysteine synthase A  47.02 
 
 		 300 aa  263  3e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353191  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  45.87 
 
 		 304 aa  263  3e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0902  cysteine synthase A  47.19 
 
 		 299 aa  263  4e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000036612  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  45 
 
 		 307 aa  262  4.999999999999999e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0990  cysteine synthase A  47.19 
 
 		 299 aa  262  6e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.0058381  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  50 
 
 		 308 aa  262  6e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  49.67 
 
 		 308 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  49.84 
 
 		 311 aa  261  8.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0334  cysteine synthase A  48.01 
 
 		 308 aa  261  1e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  49.66 
 
 		 307 aa  261  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  49.36 
 
 		 327 aa  261  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  47.19 
 
 		 305 aa  260  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  49.02 
 
 		 309 aa  260  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  49.17 
 
 		 309 aa  260  2e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1922  cysteine synthase A  48.37 
 
 		 307 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  50.49 
 
 		 311 aa  259  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1529  cysteine synthase A  46.03 
 
 		 300 aa  259  4e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000033727  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  42.31 
 
 		 315 aa  259  5.0000000000000005e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  50.33 
 
 		 322 aa  259  5.0000000000000005e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  46.91 
 
 		 320 aa  259  5.0000000000000005e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6147  cysteine synthase A  46.08 
 
 		 305 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2361  cysteine synthase A  49.35 
 
 		 307 aa  259  6e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  48.7 
 
 		 311 aa  258  6e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  50.33 
 
 		 310 aa  258  7e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  50.34 
 
 		 327 aa  258  8e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  46.86 
 
 		 307 aa  258  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0404  cysteine synthase  48.84 
 
 		 308 aa  258  1e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1224  cysteine synthase A  45.9 
 
 		 300 aa  257  2e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.47956e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  45.48 
 
 		 311 aa  257  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  47.04 
 
 		 309 aa  257  2e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>