More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1109 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1109  cysteine synthase  100 
 
 		 358 aa  727    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0380662  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2771  cysteine synthase A  100 
 
 		 358 aa  727    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2921  cysteine synthase A  94.97 
 
 		 358 aa  666    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.328533  normal  0.359999 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0891  cysteine synthase A  77.34 
 
 		 360 aa  547  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.680164 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_94354  predicted protein  62.43 
 
 		 387 aa  464  9.999999999999999e-131  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.25713  hitchhiker  0.00194835 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1632  cysteine synthase A  62.06 
 
 		 349 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1557  cysteine synthase  62.65 
 
 		 349 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2316  cysteine synthase  61.47 
 
 		 349 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2901  cysteine synthase  55.59 
 
 		 317 aa  353  2.9999999999999997e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02123  cysteine synthase A  57.1 
 
 		 319 aa  336  3.9999999999999995e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2019  cysteine synthase  53.64 
 
 		 319 aa  333  3e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1942  cysteine synthase A  53.33 
 
 		 319 aa  330  2e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3210  cysteine synthase A  55.59 
 
 		 319 aa  330  3e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112501  normal  0.950187 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1086  cysteine synthase  48.64 
 
 		 319 aa  296  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  45.31 
 
 		 310 aa  271  1e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  43.75 
 
 		 310 aa  267  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  43.75 
 
 		 310 aa  267  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  44.85 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  44.95 
 
 		 312 aa  258  9e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  45.31 
 
 		 305 aa  255  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  45.62 
 
 		 305 aa  252  7e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  46.23 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  47.69 
 
 		 306 aa  249  4e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  44.44 
 
 		 307 aa  249  4e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  44.06 
 
 		 305 aa  249  6e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  46.11 
 
 		 307 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  46.73 
 
 		 307 aa  247  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  44.38 
 
 		 306 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  44.62 
 
 		 307 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3723  cysteine synthase  44.69 
 
 		 305 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3006  cysteine synthase A  44.69 
 
 		 305 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.599463  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  42.2 
 
 		 304 aa  243  5e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  44.06 
 
 		 305 aa  242  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  40.69 
 
 		 306 aa  242  7e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  40.87 
 
 		 301 aa  241  1e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0537  cysteine synthase  45.34 
 
 		 321 aa  241  1e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00106309  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4297  cysteine synthase  44.38 
 
 		 321 aa  240  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  41.16 
 
 		 321 aa  240  2e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2362  cysteine synthase  46.01 
 
 		 307 aa  239  4e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306184  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  45.26 
 
 		 309 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  43.61 
 
 		 307 aa  239  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1224  cysteine synthase A  41.49 
 
 		 300 aa  239  5e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.47956e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  47.11 
 
 		 311 aa  239  5.999999999999999e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0024  cysteine synthase A  45.06 
 
 		 307 aa  239  5.999999999999999e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  45.54 
 
 		 308 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  44.38 
 
 		 306 aa  239  6.999999999999999e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  43.98 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  46.32 
 
 		 311 aa  238  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  45.23 
 
 		 308 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  43.69 
 
 		 305 aa  237  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  43.71 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  44.92 
 
 		 307 aa  238  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0865  cysteine synthase  43.44 
 
 		 306 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1210  cysteine synthase  45.03 
 
 		 305 aa  236  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.473529  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  46.2 
 
 		 308 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  44.31 
 
 		 307 aa  235  7e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  44.62 
 
 		 307 aa  235  7e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  45.28 
 
 		 306 aa  235  8e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  45.15 
 
 		 309 aa  235  8e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  44.62 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2103  cysteine synthase  43.12 
 
 		 305 aa  235  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0401259  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  45.26 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  43.65 
 
 		 316 aa  233  3e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  44.31 
 
 		 307 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  44.31 
 
 		 307 aa  233  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  44.31 
 
 		 307 aa  233  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  44.31 
 
 		 307 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  44 
 
 		 307 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  40.75 
 
 		 302 aa  233  4.0000000000000004e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  41.77 
 
 		 311 aa  232  8.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  44.31 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  44.07 
 
 		 309 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0902  cysteine synthase A  40.87 
 
 		 299 aa  232  1e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000036612  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1922  cysteine synthase A  43.08 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  44 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  44.07 
 
 		 309 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  45.76 
 
 		 311 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  43.87 
 
 		 309 aa  230  3e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  44.38 
 
 		 317 aa  230  3e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  43.25 
 
 		 304 aa  230  3e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  44.95 
 
 		 311 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6147  cysteine synthase A  43.08 
 
 		 305 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6440  cysteine synthase A  43.08 
 
 		 305 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2361  cysteine synthase A  44.31 
 
 		 307 aa  229  6e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  44.07 
 
 		 309 aa  229  7e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  44.65 
 
 		 311 aa  229  7e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  46.58 
 
 		 306 aa  229  7e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0990  cysteine synthase A  40.25 
 
 		 299 aa  228  9e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.0058381  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  40.06 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  42.2 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  38.04 
 
 		 304 aa  227  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  41.39 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  45.09 
 
 		 311 aa  227  3e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  43.69 
 
 		 309 aa  227  3e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  45.09 
 
 		 309 aa  226  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1720  cysteine synthase  42.86 
 
 		 302 aa  226  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0556189 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  42.64 
 
 		 310 aa  226  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  39.75 
 
 		 306 aa  226  4e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0334  cysteine synthase A  44 
 
 		 308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  40.18 
 
 		 307 aa  226  7e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>