More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1086 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1086  cysteine synthase  100 
 
 		 319 aa  653    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2019  cysteine synthase  63.52 
 
 		 319 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1942  cysteine synthase A  63.21 
 
 		 319 aa  415  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3210  cysteine synthase A  64.47 
 
 		 319 aa  410  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112501  normal  0.950187 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02123  cysteine synthase A  63.21 
 
 		 319 aa  402  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2901  cysteine synthase  63.26 
 
 		 317 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_94354  predicted protein  52.4 
 
 		 387 aa  346  3e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.25713  hitchhiker  0.00194835 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1557  cysteine synthase  49.39 
 
 		 349 aa  325  9e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1632  cysteine synthase A  48.79 
 
 		 349 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2316  cysteine synthase  48.48 
 
 		 349 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0891  cysteine synthase A  52.12 
 
 		 360 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.680164 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1109  cysteine synthase  48.64 
 
 		 358 aa  299  4e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0380662  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2771  cysteine synthase A  48.64 
 
 		 358 aa  299  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2921  cysteine synthase A  48.04 
 
 		 358 aa  298  7e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.328533  normal  0.359999 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  50.5 
 
 		 312 aa  296  4e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  52.48 
 
 		 306 aa  295  5e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  48.49 
 
 		 310 aa  295  8e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  48.49 
 
 		 310 aa  295  8e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  49.16 
 
 		 310 aa  293  4e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  49.83 
 
 		 312 aa  290  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  51.8 
 
 		 305 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  50.83 
 
 		 307 aa  279  5e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  51.48 
 
 		 308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  49.51 
 
 		 308 aa  270  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  49.17 
 
 		 307 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  49.51 
 
 		 308 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  51.82 
 
 		 306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2362  cysteine synthase  49.51 
 
 		 307 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306184  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  46.82 
 
 		 302 aa  265  7e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  49.83 
 
 		 307 aa  264  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  49.83 
 
 		 307 aa  262  4e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  46.75 
 
 		 311 aa  262  6e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  49.17 
 
 		 307 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  49.17 
 
 		 307 aa  261  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  49.17 
 
 		 307 aa  261  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  49.17 
 
 		 307 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0822  cysteine synthase A  50 
 
 		 308 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.326455 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0404  cysteine synthase  51.48 
 
 		 308 aa  260  2e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  49.17 
 
 		 307 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  49.2 
 
 		 310 aa  260  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  46.67 
 
 		 321 aa  260  3e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  47 
 
 		 307 aa  260  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0537  cysteine synthase  49.01 
 
 		 321 aa  259  3e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00106309  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  49.35 
 
 		 308 aa  259  4e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  49.17 
 
 		 307 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  46.84 
 
 		 307 aa  258  6e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  47.18 
 
 		 307 aa  258  8e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  46.08 
 
 		 306 aa  258  8e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  48.84 
 
 		 307 aa  258  9e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  45.21 
 
 		 306 aa  258  9e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  47.93 
 
 		 290 aa  258  9e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  47.77 
 
 		 322 aa  258  1e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  50.17 
 
 		 308 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  48.51 
 
 		 307 aa  257  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  49.83 
 
 		 308 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  47.27 
 
 		 310 aa  257  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  48.54 
 
 		 309 aa  257  2e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  47.62 
 
 		 291 aa  256  3e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  45.03 
 
 		 306 aa  256  3e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0334  cysteine synthase A  48.18 
 
 		 308 aa  255  7e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  42.57 
 
 		 304 aa  255  8e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  43.09 
 
 		 461 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  50.82 
 
 		 309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  46.05 
 
 		 309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  46.96 
 
 		 305 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  45.45 
 
 		 311 aa  253  3e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  46.28 
 
 		 309 aa  253  4.0000000000000004e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  45.57 
 
 		 304 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  45.83 
 
 		 320 aa  252  6e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  46.96 
 
 		 305 aa  252  7e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  45.78 
 
 		 309 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  48.7 
 
 		 314 aa  251  1e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  48.34 
 
 		 316 aa  251  1e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  47.71 
 
 		 309 aa  251  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  46.79 
 
 		 330 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  45.81 
 
 		 309 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  47.51 
 
 		 311 aa  249  3e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  42.17 
 
 		 315 aa  249  3e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1922  cysteine synthase A  46.73 
 
 		 307 aa  249  4e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  50.65 
 
 		 309 aa  249  4e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  45.31 
 
 		 309 aa  249  4e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0865  cysteine synthase  46.67 
 
 		 306 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  48.53 
 
 		 309 aa  248  1e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  48.2 
 
 		 309 aa  248  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  45.61 
 
 		 305 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  45.48 
 
 		 309 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  46.82 
 
 		 320 aa  248  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0902  cysteine synthase A  44.74 
 
 		 299 aa  248  1e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000036612  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  45.63 
 
 		 309 aa  247  2e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  45.95 
 
 		 307 aa  247  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  43.67 
 
 		 301 aa  247  2e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  44.93 
 
 		 306 aa  247  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6147  cysteine synthase A  46.33 
 
 		 305 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  44.84 
 
 		 309 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  47.23 
 
 		 309 aa  246  4e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  44.41 
 
 		 313 aa  246  4.9999999999999997e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  45.69 
 
 		 320 aa  246  4.9999999999999997e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1720  cysteine synthase  46.38 
 
 		 302 aa  245  6e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0556189 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  46.62 
 
 		 306 aa  245  6e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2361  cysteine synthase A  46.93 
 
 		 307 aa  245  6e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>