More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2019 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_2019  cysteine synthase  100 
 
 
319 aa  650    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1942  cysteine synthase A  99.06 
 
 
319 aa  645    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02123  cysteine synthase A  85.53 
 
 
319 aa  536  1e-151  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3210  cysteine synthase A  80.82 
 
 
319 aa  509  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112501  normal  0.950187 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2901  cysteine synthase  67.83 
 
 
317 aa  442  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1086  cysteine synthase  63.52 
 
 
319 aa  409  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_94354  predicted protein  56.19 
 
 
387 aa  377  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.25713  hitchhiker  0.00194835 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1632  cysteine synthase A  56.97 
 
 
349 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2316  cysteine synthase  56.35 
 
 
349 aa  368  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1557  cysteine synthase  56.35 
 
 
349 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0891  cysteine synthase A  56.84 
 
 
360 aa  345  6e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.680164 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2921  cysteine synthase A  54.24 
 
 
358 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.328533  normal  0.359999 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1109  cysteine synthase  53.94 
 
 
358 aa  328  7e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0380662  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2771  cysteine synthase A  53.94 
 
 
358 aa  328  7e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  51.51 
 
 
310 aa  317  2e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  50.83 
 
 
310 aa  314  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  50.83 
 
 
310 aa  314  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  55.26 
 
 
306 aa  295  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  48.51 
 
 
312 aa  294  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  48.51 
 
 
312 aa  291  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  51.64 
 
 
307 aa  290  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  53.59 
 
 
308 aa  288  1e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  51.32 
 
 
307 aa  287  2e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  53.29 
 
 
307 aa  287  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  52.3 
 
 
307 aa  285  7e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  50.32 
 
 
311 aa  284  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  51.97 
 
 
307 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  51.64 
 
 
307 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  51.64 
 
 
307 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  51.64 
 
 
307 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  51.64 
 
 
307 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  51.97 
 
 
307 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  51.97 
 
 
307 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  51.78 
 
 
310 aa  280  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2362  cysteine synthase  53.42 
 
 
307 aa  280  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306184  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  52.13 
 
 
308 aa  278  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  51.14 
 
 
308 aa  277  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  50.49 
 
 
305 aa  278  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  50.66 
 
 
307 aa  276  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1922  cysteine synthase A  51.3 
 
 
307 aa  276  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  52.26 
 
 
309 aa  275  9e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  52.94 
 
 
309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  48.66 
 
 
307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  50.33 
 
 
306 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  50 
 
 
307 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  50.33 
 
 
308 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0024  cysteine synthase A  50.65 
 
 
307 aa  275  1.0000000000000001e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0334  cysteine synthase A  50.83 
 
 
308 aa  273  3e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  52 
 
 
308 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  51.48 
 
 
309 aa  271  1e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  48.24 
 
 
320 aa  271  1e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  52.33 
 
 
308 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  50.49 
 
 
309 aa  271  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  51.79 
 
 
311 aa  270  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  47.57 
 
 
311 aa  270  2e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  48.67 
 
 
307 aa  269  4e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0404  cysteine synthase  49.84 
 
 
308 aa  269  4e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0537  cysteine synthase  49.83 
 
 
321 aa  268  7e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00106309  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  49.05 
 
 
319 aa  267  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  44.41 
 
 
304 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0822  cysteine synthase A  50.16 
 
 
308 aa  266  4e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.326455 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2361  cysteine synthase A  50.65 
 
 
307 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  51.97 
 
 
309 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  49.84 
 
 
306 aa  265  7e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  46.84 
 
 
301 aa  264  1e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  49.19 
 
 
309 aa  263  2e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  49.36 
 
 
310 aa  263  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  45.87 
 
 
306 aa  263  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  49.84 
 
 
309 aa  263  3e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  43.51 
 
 
315 aa  263  3e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  46.15 
 
 
302 aa  262  6e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  51.31 
 
 
309 aa  261  8e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  46.51 
 
 
321 aa  261  8.999999999999999e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  49.19 
 
 
311 aa  261  1e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1224  cysteine synthase A  46.25 
 
 
300 aa  261  1e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.47956e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  46.01 
 
 
320 aa  261  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  47.06 
 
 
320 aa  259  3e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  47.73 
 
 
309 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  49.51 
 
 
311 aa  260  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  48.15 
 
 
323 aa  259  4e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  49.84 
 
 
310 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  46.5 
 
 
320 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  48.39 
 
 
310 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  44.59 
 
 
304 aa  259  5.0000000000000005e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  46.91 
 
 
316 aa  258  6e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  49.84 
 
 
309 aa  259  6e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  45.57 
 
 
307 aa  259  6e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  49.84 
 
 
309 aa  258  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1438  cysteine synthase A  47.87 
 
 
305 aa  258  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  49.35 
 
 
322 aa  257  2e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  49.2 
 
 
320 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  50.98 
 
 
317 aa  256  2e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1438  cysteine synthase A  47.54 
 
 
305 aa  257  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.412307  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  47.42 
 
 
309 aa  255  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  49.02 
 
 
327 aa  255  7e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  47.73 
 
 
310 aa  255  7e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  49.84 
 
 
317 aa  255  7e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  48 
 
 
305 aa  255  8e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1322  cysteine synthase A  46.18 
 
 
300 aa  255  8e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353191  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  47.39 
 
 
309 aa  254  9e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>