More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3210 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3210  cysteine synthase A  100 
 
 		 319 aa  639    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112501  normal  0.950187 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02123  cysteine synthase A  87.15 
 
 		 319 aa  537  9.999999999999999e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1942  cysteine synthase A  80.82 
 
 		 319 aa  511  1e-144  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2019  cysteine synthase  80.82 
 
 		 319 aa  510  1e-143  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2901  cysteine synthase  71.97 
 
 		 317 aa  449  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1086  cysteine synthase  64.47 
 
 		 319 aa  403  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1632  cysteine synthase A  59.44 
 
 		 349 aa  384  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1557  cysteine synthase  60.06 
 
 		 349 aa  381  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_94354  predicted protein  59.09 
 
 		 387 aa  382  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.25713  hitchhiker  0.00194835 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2316  cysteine synthase  58.82 
 
 		 349 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0891  cysteine synthase A  59.09 
 
 		 360 aa  347  1e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.680164 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2921  cysteine synthase A  56.8 
 
 		 358 aa  334  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.328533  normal  0.359999 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1109  cysteine synthase  55.89 
 
 		 358 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0380662  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2771  cysteine synthase A  55.89 
 
 		 358 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  50.83 
 
 		 310 aa  314  9.999999999999999e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  50.17 
 
 		 310 aa  311  7.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  50.17 
 
 		 310 aa  311  7.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  56.21 
 
 		 308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  57.57 
 
 		 306 aa  301  1e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  49.5 
 
 		 312 aa  298  6e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  49.17 
 
 		 312 aa  296  5e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  53.27 
 
 		 307 aa  293  3e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  53 
 
 		 307 aa  292  6e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  51.15 
 
 		 311 aa  291  1e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  52.3 
 
 		 307 aa  290  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  53.64 
 
 		 307 aa  289  6e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  53.72 
 
 		 310 aa  287  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  53.29 
 
 		 307 aa  287  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  51.63 
 
 		 308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  51.48 
 
 		 305 aa  285  5.999999999999999e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  52.63 
 
 		 307 aa  285  8e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  52.3 
 
 		 307 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  52.3 
 
 		 307 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  52.3 
 
 		 307 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  52.3 
 
 		 307 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  51.97 
 
 		 307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  49.33 
 
 		 307 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  54.43 
 
 		 308 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  51.97 
 
 		 308 aa  282  5.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  51.97 
 
 		 307 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  53.44 
 
 		 309 aa  281  7.000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  51.64 
 
 		 307 aa  281  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  53.75 
 
 		 311 aa  281  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  51.85 
 
 		 306 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  54.58 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0024  cysteine synthase A  50.65 
 
 		 307 aa  278  1e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  51.79 
 
 		 311 aa  277  2e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1922  cysteine synthase A  52.27 
 
 		 307 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  46.89 
 
 		 304 aa  276  3e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  53.92 
 
 		 309 aa  276  4e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  50.66 
 
 		 307 aa  276  4e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  48.5 
 
 		 301 aa  275  6e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  53.95 
 
 		 309 aa  275  7e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2362  cysteine synthase  52.77 
 
 		 307 aa  275  8e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306184  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  51.92 
 
 		 310 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  50.65 
 
 		 310 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  52.15 
 
 		 327 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  50.33 
 
 		 328 aa  273  3e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  48.86 
 
 		 311 aa  272  5.000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2361  cysteine synthase A  53.25 
 
 		 307 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  53.11 
 
 		 309 aa  271  8.000000000000001e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  47.84 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  51.8 
 
 		 309 aa  271  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  49.68 
 
 		 310 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1224  cysteine synthase A  46.58 
 
 		 300 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.47956e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  47.85 
 
 		 306 aa  270  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  51.18 
 
 		 323 aa  269  4e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  52.12 
 
 		 309 aa  269  5e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  51.13 
 
 		 309 aa  268  7e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0537  cysteine synthase  50.17 
 
 		 321 aa  268  8.999999999999999e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00106309  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  51.6 
 
 		 309 aa  268  1e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  51.13 
 
 		 317 aa  267  2e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  48.89 
 
 		 320 aa  267  2e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0404  cysteine synthase  51.48 
 
 		 308 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  46.98 
 
 		 302 aa  266  4e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  43.09 
 
 		 304 aa  265  7e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  49.68 
 
 		 319 aa  265  8.999999999999999e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  51.13 
 
 		 309 aa  265  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  49.19 
 
 		 309 aa  264  1e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  50.49 
 
 		 308 aa  265  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  44.52 
 
 		 315 aa  264  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  50 
 
 		 309 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1438  cysteine synthase A  47.54 
 
 		 305 aa  263  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.412307  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  53 
 
 		 308 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  50.8 
 
 		 310 aa  263  4e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  49.03 
 
 		 318 aa  263  4e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0902  cysteine synthase A  45.9 
 
 		 299 aa  263  4e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000036612  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  52.33 
 
 		 308 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  48.7 
 
 		 317 aa  262  4.999999999999999e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  51.97 
 
 		 309 aa  262  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  48.67 
 
 		 305 aa  262  4.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  45.98 
 
 		 311 aa  262  6e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  50.81 
 
 		 309 aa  262  6e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  49 
 
 		 305 aa  262  6.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1438  cysteine synthase A  47.87 
 
 		 305 aa  262  6.999999999999999e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  47.92 
 
 		 320 aa  261  8e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  49.03 
 
 		 316 aa  261  8.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0990  cysteine synthase A  45.9 
 
 		 299 aa  261  1e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.0058381  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  50.5 
 
 		 317 aa  261  1e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  46 
 
 		 303 aa  261  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>