More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2657 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  100 
 
 		 309 aa  621  1e-177  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  99.03 
 
 		 309 aa  615  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  82.74 
 
 		 309 aa  476  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  75.66 
 
 		 309 aa  432  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  68.93 
 
 		 311 aa  419  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  70.26 
 
 		 309 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  67.87 
 
 		 311 aa  403  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  68.51 
 
 		 309 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  70.26 
 
 		 310 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  67.53 
 
 		 309 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  67.86 
 
 		 309 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  72.22 
 
 		 310 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  66.45 
 
 		 330 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  67.86 
 
 		 310 aa  397  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  69.28 
 
 		 311 aa  391  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  64.84 
 
 		 319 aa  393  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  67.43 
 
 		 308 aa  392  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  65.48 
 
 		 320 aa  391  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  69.61 
 
 		 309 aa  391  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  69.28 
 
 		 311 aa  391  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  67.1 
 
 		 317 aa  393  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  67.32 
 
 		 308 aa  390  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  64.84 
 
 		 320 aa  388  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  66.78 
 
 		 317 aa  391  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  67.11 
 
 		 308 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  69.48 
 
 		 311 aa  385  1e-106  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  67.65 
 
 		 310 aa  385  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  65.36 
 
 		 309 aa  382  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  64.4 
 
 		 310 aa  382  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  64.19 
 
 		 313 aa  381  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  64.84 
 
 		 320 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  65.47 
 
 		 311 aa  381  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  63.23 
 
 		 310 aa  384  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  64.63 
 
 		 320 aa  382  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  65.47 
 
 		 322 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2647  cysteine synthase A  70.13 
 
 		 310 aa  381  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.100926  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1502  cysteine synthase A  66.13 
 
 		 321 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18267e-17 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  65.81 
 
 		 320 aa  378  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  65.69 
 
 		 308 aa  378  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  67.86 
 
 		 309 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  64.52 
 
 		 320 aa  380  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  68.95 
 
 		 311 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  64.36 
 
 		 309 aa  379  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  65.36 
 
 		 323 aa  378  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  66.45 
 
 		 322 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  62.5 
 
 		 310 aa  375  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  66.45 
 
 		 309 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  66.99 
 
 		 309 aa  376  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  65.37 
 
 		 316 aa  374  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  64.72 
 
 		 311 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  59.87 
 
 		 311 aa  373  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  66.89 
 
 		 308 aa  373  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  65.8 
 
 		 311 aa  370  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  61.81 
 
 		 327 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  63.19 
 
 		 324 aa  368  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  61.31 
 
 		 311 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0452  cysteine synthases  67.32 
 
 		 308 aa  370  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  64.5 
 
 		 329 aa  368  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  63.19 
 
 		 311 aa  367  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0075  cysteine synthase A  65.8 
 
 		 328 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  60.98 
 
 		 310 aa  367  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  65.03 
 
 		 327 aa  366  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  60.98 
 
 		 310 aa  367  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0477  cysteine synthase  66.45 
 
 		 332 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4407  cysteine synthase A  64.08 
 
 		 328 aa  365  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119856 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4605  cysteine synthase A  64.5 
 
 		 320 aa  364  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  61.29 
 
 		 318 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  63.84 
 
 		 327 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  64.38 
 
 		 309 aa  364  1e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  65.36 
 
 		 309 aa  364  1e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  63.19 
 
 		 311 aa  363  2e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  65.47 
 
 		 311 aa  363  2e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  61.94 
 
 		 309 aa  362  3e-99  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  61.56 
 
 		 339 aa  363  3e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0433  cysteine synthase A  64.52 
 
 		 320 aa  362  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0444  cysteine synthase A  64.52 
 
 		 320 aa  362  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00894315 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  62.87 
 
 		 327 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1015  cysteine synthase A  69.38 
 
 		 328 aa  361  7.0000000000000005e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  61.81 
 
 		 308 aa  361  8e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4340  cysteine synthase A  64.5 
 
 		 320 aa  361  9e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.899822 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1893  cysteine synthase A  69.06 
 
 		 327 aa  361  9e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.480284  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  61.49 
 
 		 308 aa  361  1e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0178  cysteine synthase A  64.17 
 
 		 331 aa  360  1e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  62.21 
 
 		 317 aa  360  2e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  62.87 
 
 		 328 aa  360  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  60.33 
 
 		 312 aa  360  2e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  59.55 
 
 		 311 aa  360  2e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0559  cysteine synthase A  65.47 
 
 		 332 aa  359  3e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.770107  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  61.89 
 
 		 311 aa  359  3e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0343  cysteine synthase A  66.12 
 
 		 332 aa  358  6e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.516891  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1466  cysteine synthase  65.48 
 
 		 334 aa  358  9e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00108529  normal  0.10478 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  59.8 
 
 		 312 aa  357  9.999999999999999e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  61.04 
 
 		 322 aa  357  1.9999999999999998e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  57.47 
 
 		 307 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  62.21 
 
 		 326 aa  354  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  62.21 
 
 		 326 aa  354  1e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  56.86 
 
 		 304 aa  352  2.9999999999999997e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  59.8 
 
 		 320 aa  352  4e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  60.77 
 
 		 316 aa  351  7e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  57.19 
 
 		 304 aa  351  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>