More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0891 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0891  cysteine synthase A  100 
 
 		 360 aa  735    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.680164 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2921  cysteine synthase A  77.62 
 
 		 358 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.328533  normal  0.359999 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2771  cysteine synthase A  77.34 
 
 		 358 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1109  cysteine synthase  77.34 
 
 		 358 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0380662  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1632  cysteine synthase A  63.82 
 
 		 349 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2316  cysteine synthase  63.53 
 
 		 349 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1557  cysteine synthase  62.68 
 
 		 349 aa  444  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_94354  predicted protein  60.11 
 
 		 387 aa  442  1e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.25713  hitchhiker  0.00194835 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2901  cysteine synthase  58.48 
 
 		 317 aa  363  2e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02123  cysteine synthase A  59.09 
 
 		 319 aa  351  1e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3210  cysteine synthase A  59.09 
 
 		 319 aa  349  3e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112501  normal  0.950187 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2019  cysteine synthase  56.84 
 
 		 319 aa  347  1e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1942  cysteine synthase A  56.53 
 
 		 319 aa  346  3e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1086  cysteine synthase  52.12 
 
 		 319 aa  305  6e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  44.58 
 
 		 310 aa  268  1e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  44.27 
 
 		 310 aa  265  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  44.27 
 
 		 310 aa  265  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  45.37 
 
 		 312 aa  256  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  45.34 
 
 		 312 aa  253  3e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  47.34 
 
 		 307 aa  252  6e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  46.44 
 
 		 307 aa  252  8.000000000000001e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  44.65 
 
 		 306 aa  252  8.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  45.31 
 
 		 305 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  45.65 
 
 		 305 aa  248  8e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  43.08 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  46.65 
 
 		 309 aa  246  6e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  45.48 
 
 		 305 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  44.69 
 
 		 306 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  43.12 
 
 		 321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  44.55 
 
 		 305 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  46.6 
 
 		 306 aa  242  7e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  46.5 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2362  cysteine synthase  48.15 
 
 		 307 aa  241  1e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306184  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1210  cysteine synthase  43.65 
 
 		 305 aa  239  6.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.473529  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  43.4 
 
 		 302 aa  239  6.999999999999999e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  43.75 
 
 		 306 aa  239  8e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  44.38 
 
 		 328 aa  238  9e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  42.5 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  45.45 
 
 		 339 aa  237  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  44.27 
 
 		 307 aa  236  4e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3006  cysteine synthase A  45.79 
 
 		 305 aa  236  6e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.599463  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3723  cysteine synthase  45.79 
 
 		 305 aa  236  6e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  44.86 
 
 		 307 aa  236  7e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  43.75 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  43.61 
 
 		 307 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  45.23 
 
 		 308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  43.77 
 
 		 309 aa  233  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1922  cysteine synthase A  44.62 
 
 		 307 aa  234  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  46.3 
 
 		 308 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2103  cysteine synthase  44.55 
 
 		 305 aa  233  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0401259  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  45.4 
 
 		 310 aa  233  5e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  45.48 
 
 		 311 aa  232  8.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  44.69 
 
 		 307 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  44.34 
 
 		 309 aa  232  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4297  cysteine synthase  44.21 
 
 		 321 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  45 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  44.75 
 
 		 305 aa  231  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  45.68 
 
 		 308 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  44.79 
 
 		 302 aa  230  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  44.75 
 
 		 307 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  45.29 
 
 		 309 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0865  cysteine synthase  42.81 
 
 		 306 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  42.68 
 
 		 310 aa  230  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0537  cysteine synthase  45.2 
 
 		 321 aa  229  4e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00106309  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  44.69 
 
 		 307 aa  229  5e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0024  cysteine synthase A  45.23 
 
 		 307 aa  229  6e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1224  cysteine synthase A  41.72 
 
 		 300 aa  229  6e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.47956e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  45.43 
 
 		 311 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  44.38 
 
 		 307 aa  229  6e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  44.98 
 
 		 309 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  42.2 
 
 		 311 aa  229  6e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  44.79 
 
 		 309 aa  228  9e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  44.06 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  44.06 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  44.06 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6147  cysteine synthase A  43.48 
 
 		 305 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  44.06 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  45.12 
 
 		 311 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  44.04 
 
 		 309 aa  228  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  41.23 
 
 		 307 aa  228  2e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  43.73 
 
 		 309 aa  227  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6440  cysteine synthase A  43.48 
 
 		 305 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  45.4 
 
 		 320 aa  227  3e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  41.27 
 
 		 311 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  43.83 
 
 		 307 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  43.6 
 
 		 311 aa  225  8e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2361  cysteine synthase A  44.62 
 
 		 307 aa  225  9e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0334  cysteine synthase A  44.62 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  44.24 
 
 		 316 aa  224  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  44.21 
 
 		 309 aa  225  1e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  43.92 
 
 		 329 aa  224  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  41.14 
 
 		 311 aa  224  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  44.07 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  45.73 
 
 		 311 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  45.09 
 
 		 309 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  43.77 
 
 		 311 aa  223  6e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  43.11 
 
 		 316 aa  222  7e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  44.85 
 
 		 311 aa  222  7e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  42.42 
 
 		 310 aa  222  7e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  44.58 
 
 		 311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>