More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1210 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1210  cysteine synthase  100 
 
 		 305 aa  617  1e-176  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.473529  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  80.92 
 
 		 306 aa  500  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  81.06 
 
 		 305 aa  489  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2103  cysteine synthase  79.4 
 
 		 305 aa  487  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0401259  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  80.26 
 
 		 305 aa  488  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  79.61 
 
 		 305 aa  480  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  76.32 
 
 		 306 aa  474  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  78.62 
 
 		 305 aa  477  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0865  cysteine synthase  78.36 
 
 		 306 aa  474  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4297  cysteine synthase  80.33 
 
 		 321 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  76.32 
 
 		 307 aa  462  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3006  cysteine synthase A  78.07 
 
 		 305 aa  448  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.599463  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3723  cysteine synthase  78.07 
 
 		 305 aa  448  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  73.83 
 
 		 302 aa  441  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6147  cysteine synthase A  74.34 
 
 		 305 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6440  cysteine synthase A  74.01 
 
 		 305 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  60.86 
 
 		 306 aa  377  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  61.95 
 
 		 302 aa  367  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  54.43 
 
 		 312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  54 
 
 		 310 aa  313  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  54 
 
 		 310 aa  313  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  53.51 
 
 		 310 aa  310  1e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  60.73 
 
 		 308 aa  307  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  53.44 
 
 		 312 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  57.81 
 
 		 326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  57.81 
 
 		 326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  56.39 
 
 		 324 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  58.05 
 
 		 306 aa  301  9e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0913  cysteine synthase A  57.48 
 
 		 325 aa  299  4e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  57.43 
 
 		 309 aa  297  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1091  cysteine synthase  55.81 
 
 		 303 aa  297  1e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000826995  decreased coverage  0.00308217 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  56.77 
 
 		 308 aa  298  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  56.11 
 
 		 308 aa  296  4e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  53.8 
 
 		 311 aa  295  6e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  57.98 
 
 		 309 aa  293  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  56.42 
 
 		 309 aa  291  7e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  56.76 
 
 		 309 aa  291  7e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  56.76 
 
 		 309 aa  291  9e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  56.62 
 
 		 307 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  57.52 
 
 		 309 aa  289  4e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  56.86 
 
 		 309 aa  287  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  52.09 
 
 		 311 aa  286  4e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  49.34 
 
 		 304 aa  285  7e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  55.85 
 
 		 307 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  56.58 
 
 		 308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  54.1 
 
 		 305 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  54.36 
 
 		 320 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3653  cysteine synthase A  54.1 
 
 		 319 aa  282  4.0000000000000003e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528018  hitchhiker  1.6930700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  53.21 
 
 		 316 aa  281  6.000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  55.88 
 
 		 309 aa  281  7.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  54.46 
 
 		 319 aa  281  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  55.26 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  56.38 
 
 		 306 aa  280  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  56.33 
 
 		 307 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  51.34 
 
 		 321 aa  280  3e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  51.01 
 
 		 301 aa  280  3e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  56.33 
 
 		 307 aa  279  4e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  56.33 
 
 		 307 aa  279  4e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  56.33 
 
 		 307 aa  279  4e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  56.67 
 
 		 307 aa  279  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  56.33 
 
 		 307 aa  279  4e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  53.59 
 
 		 328 aa  279  5e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  54.33 
 
 		 307 aa  279  5e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  52.65 
 
 		 311 aa  279  5e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  56 
 
 		 307 aa  278  6e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  52.79 
 
 		 339 aa  278  6e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2658  cysteine synthase  55.33 
 
 		 310 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.556672 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  52.44 
 
 		 309 aa  278  1e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  55.67 
 
 		 307 aa  276  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  53.85 
 
 		 307 aa  276  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  54.36 
 
 		 320 aa  277  2e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  53.77 
 
 		 327 aa  276  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  56.11 
 
 		 309 aa  275  5e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  54.64 
 
 		 314 aa  275  8e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  52.13 
 
 		 320 aa  275  1.0000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  53.62 
 
 		 309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  55.41 
 
 		 311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  54.1 
 
 		 310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  53.72 
 
 		 318 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  53.25 
 
 		 330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  53.72 
 
 		 308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  55.41 
 
 		 311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  53.4 
 
 		 308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  54.15 
 
 		 310 aa  273  3e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  54.4 
 
 		 322 aa  273  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  53.47 
 
 		 310 aa  273  3e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  47.46 
 
 		 304 aa  273  3e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  55.33 
 
 		 307 aa  273  3e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  55.33 
 
 		 309 aa  273  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  53.77 
 
 		 320 aa  272  6e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  53.04 
 
 		 320 aa  271  8.000000000000001e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  50.84 
 
 		 302 aa  271  8.000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  54.79 
 
 		 327 aa  271  9e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  52.16 
 
 		 327 aa  271  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  53.29 
 
 		 320 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  53.14 
 
 		 313 aa  271  1e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  52.27 
 
 		 307 aa  270  2e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  52.94 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  55.67 
 
 		 308 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  52.77 
 
 		 307 aa  270  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>