More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2921 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1109  cysteine synthase  94.97 
 
 		 358 aa  665    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0380662  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2921  cysteine synthase A  100 
 
 		 358 aa  728    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.328533  normal  0.359999 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2771  cysteine synthase A  94.97 
 
 		 358 aa  665    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0891  cysteine synthase A  77.62 
 
 		 360 aa  551  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.680164 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_94354  predicted protein  61.3 
 
 		 387 aa  454  1e-127  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.25713  hitchhiker  0.00194835 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1632  cysteine synthase A  64.12 
 
 		 349 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2316  cysteine synthase  63.53 
 
 		 349 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1557  cysteine synthase  63.82 
 
 		 349 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2901  cysteine synthase  56.19 
 
 		 317 aa  361  9e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2019  cysteine synthase  53.94 
 
 		 319 aa  339  4e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02123  cysteine synthase A  57.7 
 
 		 319 aa  339  5.9999999999999996e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3210  cysteine synthase A  56.8 
 
 		 319 aa  338  8e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112501  normal  0.950187 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1942  cysteine synthase A  53.64 
 
 		 319 aa  337  9.999999999999999e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1086  cysteine synthase  48.04 
 
 		 319 aa  295  8e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  45.31 
 
 		 310 aa  277  2e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  43.44 
 
 		 310 aa  270  4e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  43.44 
 
 		 310 aa  270  4e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  44.07 
 
 		 312 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  44.17 
 
 		 312 aa  262  6e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  45 
 
 		 305 aa  256  5e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  46.88 
 
 		 307 aa  256  6e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  47.84 
 
 		 306 aa  255  7e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  45.94 
 
 		 305 aa  255  8e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  46.54 
 
 		 307 aa  255  9e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  47.19 
 
 		 307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  44.14 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  44.06 
 
 		 305 aa  251  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  45 
 
 		 306 aa  250  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  48.02 
 
 		 311 aa  249  4e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  46.93 
 
 		 311 aa  249  7e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0537  cysteine synthase  45.05 
 
 		 321 aa  248  8e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00106309  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  41.64 
 
 		 306 aa  248  8e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0024  cysteine synthase A  45.37 
 
 		 307 aa  247  3e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  43.08 
 
 		 304 aa  246  3e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2362  cysteine synthase  46.63 
 
 		 307 aa  246  4e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306184  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  45.71 
 
 		 309 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3723  cysteine synthase  44.69 
 
 		 305 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3006  cysteine synthase A  44.69 
 
 		 305 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.599463  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  43.44 
 
 		 307 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  44.06 
 
 		 305 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  41.49 
 
 		 301 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  44.14 
 
 		 307 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  44.74 
 
 		 339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  41.77 
 
 		 321 aa  243  3e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  45.76 
 
 		 309 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  45.37 
 
 		 308 aa  242  6e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4297  cysteine synthase  44.06 
 
 		 321 aa  242  9e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  44.95 
 
 		 309 aa  241  1e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  44.78 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1210  cysteine synthase  44.89 
 
 		 305 aa  241  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.473529  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  44.38 
 
 		 306 aa  240  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  44.75 
 
 		 307 aa  241  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  44.75 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  45.73 
 
 		 308 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  46.2 
 
 		 311 aa  240  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  44.95 
 
 		 309 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0865  cysteine synthase  43.75 
 
 		 306 aa  239  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  44.27 
 
 		 316 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  44.98 
 
 		 309 aa  238  9e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  41.38 
 
 		 302 aa  238  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  44.14 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  44.44 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  44.17 
 
 		 310 aa  238  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  44.44 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  45.91 
 
 		 306 aa  238  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1224  cysteine synthase A  41.18 
 
 		 300 aa  237  2e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.47956e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  44.79 
 
 		 309 aa  237  2e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  44.98 
 
 		 309 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  42.38 
 
 		 311 aa  237  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1922  cysteine synthase A  43.38 
 
 		 307 aa  236  4e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  43.21 
 
 		 305 aa  236  4e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  44.14 
 
 		 307 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  44.14 
 
 		 307 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  44.14 
 
 		 307 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  45.87 
 
 		 311 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  44.14 
 
 		 307 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  43.83 
 
 		 307 aa  236  6e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  43.83 
 
 		 308 aa  236  6e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  45.26 
 
 		 311 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  44.14 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  45.57 
 
 		 311 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  45.71 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2361  cysteine synthase A  44 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  43.9 
 
 		 317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  42.64 
 
 		 311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  44.38 
 
 		 309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  41.03 
 
 		 311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2103  cysteine synthase  42.68 
 
 		 305 aa  234  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0401259  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  45.09 
 
 		 311 aa  233  3e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  43.25 
 
 		 304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  46.27 
 
 		 306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  44.28 
 
 		 316 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6147  cysteine synthase A  42.81 
 
 		 305 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6440  cysteine synthase A  42.81 
 
 		 305 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0902  cysteine synthase A  40.87 
 
 		 299 aa  232  8.000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000036612  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  44.82 
 
 		 309 aa  232  9e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  43.94 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  44.41 
 
 		 320 aa  231  1e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  40.18 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  40.8 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>