More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1922 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1922  cysteine synthase A  100 
 
 
307 aa  626  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2361  cysteine synthase A  90.23 
 
 
307 aa  523  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2362  cysteine synthase  74.1 
 
 
307 aa  448  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306184  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1438  cysteine synthase A  63.28 
 
 
305 aa  360  1e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.412307  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1919  cysteine synthase A  62.3 
 
 
305 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1678  cysteine synthase A  61.97 
 
 
305 aa  355  3.9999999999999996e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.423565  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1875  cysteine synthase A  61.97 
 
 
305 aa  355  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101872 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1837  cysteine synthase A  62.3 
 
 
305 aa  355  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1954  cysteine synthase A  61.97 
 
 
305 aa  355  5e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1691  cysteine synthase A  62.3 
 
 
305 aa  355  5.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3506  cysteine synthase A  62.3 
 
 
305 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1697  cysteine synthase A  61.97 
 
 
305 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1831  cysteine synthase A  61.97 
 
 
305 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1653  cysteine synthase A  62.3 
 
 
305 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  59.02 
 
 
306 aa  341  9e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  53.27 
 
 
312 aa  330  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  53.27 
 
 
312 aa  329  3e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  53.59 
 
 
310 aa  326  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  53.59 
 
 
310 aa  326  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  53.82 
 
 
310 aa  326  3e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  56.07 
 
 
307 aa  320  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  56.17 
 
 
308 aa  318  6e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  56.68 
 
 
309 aa  318  9e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  54.28 
 
 
308 aa  318  9e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  58.09 
 
 
306 aa  316  3e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  56.39 
 
 
309 aa  316  3e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  52.29 
 
 
304 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  56.07 
 
 
307 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  57.47 
 
 
309 aa  311  5.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  53.49 
 
 
320 aa  310  2e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  55.19 
 
 
309 aa  309  2.9999999999999997e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  53.16 
 
 
320 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  53.44 
 
 
305 aa  306  3e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  54.25 
 
 
308 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  50.81 
 
 
311 aa  305  9.000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  52.29 
 
 
308 aa  305  9.000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  50 
 
 
315 aa  303  3.0000000000000004e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  55.92 
 
 
308 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  49.35 
 
 
311 aa  302  6.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  56.25 
 
 
308 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  52.75 
 
 
311 aa  301  1e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  52.27 
 
 
307 aa  300  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  56.72 
 
 
307 aa  301  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  57.05 
 
 
307 aa  300  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  50.65 
 
 
310 aa  300  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  53.54 
 
 
320 aa  299  3e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  53.57 
 
 
318 aa  300  3e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  51.3 
 
 
309 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  56.72 
 
 
307 aa  299  4e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  50.65 
 
 
323 aa  299  4e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  49.35 
 
 
307 aa  299  5e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  56.39 
 
 
307 aa  298  7e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  56.39 
 
 
307 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  56.39 
 
 
307 aa  298  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  56.39 
 
 
307 aa  298  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  56.39 
 
 
307 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  56.39 
 
 
307 aa  297  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  56.39 
 
 
307 aa  296  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  50.5 
 
 
302 aa  297  2e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  52.75 
 
 
309 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  51.66 
 
 
307 aa  295  5e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  53.57 
 
 
310 aa  295  6e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  49.83 
 
 
303 aa  295  6e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  48.84 
 
 
306 aa  294  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  49.5 
 
 
305 aa  293  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  52.43 
 
 
309 aa  293  2e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  49.68 
 
 
308 aa  293  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  49.17 
 
 
305 aa  293  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1091  cysteine synthase  52.7 
 
 
303 aa  292  4e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000826995  decreased coverage  0.00308217 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  51.62 
 
 
309 aa  292  6e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  51.14 
 
 
317 aa  291  8e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  50.17 
 
 
305 aa  291  8e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  51.34 
 
 
306 aa  291  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  49.83 
 
 
305 aa  291  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  49.35 
 
 
304 aa  291  1e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0334  cysteine synthase A  53.77 
 
 
308 aa  290  2e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  53.05 
 
 
310 aa  290  2e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  51.62 
 
 
309 aa  289  3e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  51.78 
 
 
309 aa  289  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  50.16 
 
 
320 aa  289  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  48.68 
 
 
304 aa  289  4e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  50.81 
 
 
310 aa  289  4e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  51.46 
 
 
311 aa  289  5.0000000000000004e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  52.12 
 
 
310 aa  288  6e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  50.83 
 
 
309 aa  288  6e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  53.23 
 
 
310 aa  288  7e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  49.84 
 
 
309 aa  288  8e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  50.33 
 
 
307 aa  287  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  49.83 
 
 
307 aa  286  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0404  cysteine synthase  52.94 
 
 
308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  50.32 
 
 
308 aa  286  4e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  50.17 
 
 
301 aa  285  5e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  51.82 
 
 
302 aa  285  5e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  48.04 
 
 
311 aa  285  5e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  50 
 
 
317 aa  285  5.999999999999999e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  50 
 
 
302 aa  285  5.999999999999999e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  50.17 
 
 
321 aa  285  8e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0024  cysteine synthase A  50.65 
 
 
307 aa  285  8e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  50.49 
 
 
306 aa  285  8e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0902  cysteine synthase A  46.73 
 
 
299 aa  285  8e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000036612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>