More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1135 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  100 
 
 		 320 aa  642    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  84.69 
 
 		 320 aa  532  1e-150  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  83.75 
 
 		 320 aa  524  1e-148  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  62.79 
 
 		 308 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  60.26 
 
 		 309 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  59 
 
 		 308 aa  349  3e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  60.46 
 
 		 310 aa  348  7e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  59.47 
 
 		 309 aa  346  3e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  58.8 
 
 		 309 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  60.13 
 
 		 309 aa  342  4e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  61.46 
 
 		 310 aa  341  1e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  57.33 
 
 		 311 aa  340  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  59.67 
 
 		 309 aa  340  1e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  60.67 
 
 		 311 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  58.14 
 
 		 309 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  56.81 
 
 		 312 aa  340  2e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  60.13 
 
 		 308 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  60.67 
 
 		 311 aa  339  4e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  57.48 
 
 		 309 aa  339  5e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  56.39 
 
 		 312 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  59.46 
 
 		 318 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  56.33 
 
 		 304 aa  335  5.999999999999999e-91  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0452  cysteine synthases  61.59 
 
 		 308 aa  334  1e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  58 
 
 		 311 aa  334  1e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  60.67 
 
 		 311 aa  331  1e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  60.13 
 
 		 308 aa  330  2e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  55.81 
 
 		 304 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  59.34 
 
 		 309 aa  329  4e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  58.77 
 
 		 330 aa  328  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  57.05 
 
 		 311 aa  328  7e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  54.33 
 
 		 311 aa  328  9e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  58.09 
 
 		 317 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  58.67 
 
 		 309 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  56.95 
 
 		 310 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  62.46 
 
 		 309 aa  324  1e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  59.74 
 
 		 319 aa  324  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  55.74 
 
 		 311 aa  324  1e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  57.62 
 
 		 308 aa  324  1e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  55.88 
 
 		 308 aa  323  2e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  60.2 
 
 		 313 aa  323  2e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  56.52 
 
 		 309 aa  324  2e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  58.75 
 
 		 311 aa  323  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  57.48 
 
 		 311 aa  323  2e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  59 
 
 		 311 aa  323  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  58.55 
 
 		 320 aa  323  2e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  59.54 
 
 		 320 aa  323  2e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  59.33 
 
 		 310 aa  323  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  57.38 
 
 		 311 aa  322  4e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  58.88 
 
 		 320 aa  322  4e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  58.28 
 
 		 309 aa  322  5e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  55.08 
 
 		 311 aa  322  6e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  56.81 
 
 		 309 aa  322  6e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  56.95 
 
 		 309 aa  322  6e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  56.77 
 
 		 310 aa  322  7e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  57.79 
 
 		 320 aa  319  3e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  55.89 
 
 		 310 aa  319  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  59.47 
 
 		 309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  57.33 
 
 		 310 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  59.8 
 
 		 309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  59.48 
 
 		 309 aa  319  5e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  57.33 
 
 		 310 aa  318  7e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  57.84 
 
 		 311 aa  317  1e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  58.8 
 
 		 314 aa  317  2e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  56.55 
 
 		 322 aa  316  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  56.62 
 
 		 309 aa  316  4e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  54.13 
 
 		 310 aa  315  7e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  59.54 
 
 		 320 aa  315  7e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  54.13 
 
 		 310 aa  315  7e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  58.75 
 
 		 320 aa  315  8e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  56.72 
 
 		 317 aa  314  9.999999999999999e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  56.58 
 
 		 327 aa  314  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  57.43 
 
 		 323 aa  314  9.999999999999999e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  55.15 
 
 		 308 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2647  cysteine synthase A  56.86 
 
 		 310 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.100926  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  57.38 
 
 		 311 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  58.17 
 
 		 316 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  54.9 
 
 		 316 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4407  cysteine synthase A  56.58 
 
 		 328 aa  312  4.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119856 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  53.33 
 
 		 307 aa  311  5.999999999999999e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  53.33 
 
 		 304 aa  310  2e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  57.05 
 
 		 339 aa  310  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  50.65 
 
 		 310 aa  309  2.9999999999999997e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  54.15 
 
 		 308 aa  309  4e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  56.41 
 
 		 322 aa  308  5.9999999999999995e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  54.7 
 
 		 307 aa  308  5.9999999999999995e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1301  cysteine synthase A  53.95 
 
 		 309 aa  307  1.0000000000000001e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.568697 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1502  cysteine synthase A  58.42 
 
 		 321 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18267e-17 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  58.42 
 
 		 329 aa  306  2.0000000000000002e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  58.28 
 
 		 306 aa  306  3e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  55.92 
 
 		 322 aa  306  4.0000000000000004e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  55.12 
 
 		 309 aa  305  5.0000000000000004e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3653  cysteine synthase A  59.4 
 
 		 319 aa  305  8.000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528018  hitchhiker  1.6930700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  56.33 
 
 		 305 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  56.38 
 
 		 327 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  55.08 
 
 		 311 aa  303  3.0000000000000004e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  55.37 
 
 		 316 aa  303  3.0000000000000004e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3068  cysteine synthase A  53.35 
 
 		 316 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145676  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  59.48 
 
 		 309 aa  302  4.0000000000000003e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  56.71 
 
 		 327 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  54.79 
 
 		 317 aa  301  1e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>