More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1792 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  100 
 
 		 307 aa  610  9.999999999999999e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  62.3 
 
 		 310 aa  386  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  61.31 
 
 		 310 aa  381  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  61.31 
 
 		 310 aa  381  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  62.75 
 
 		 312 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  65.8 
 
 		 308 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  64.82 
 
 		 308 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  61.97 
 
 		 312 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0334  cysteine synthase A  64.17 
 
 		 308 aa  367  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  62.3 
 
 		 307 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0537  cysteine synthase  65.47 
 
 		 321 aa  357  9.999999999999999e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00106309  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  62.5 
 
 		 306 aa  355  5e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  62.95 
 
 		 307 aa  352  2.9999999999999997e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  58.31 
 
 		 306 aa  352  2.9999999999999997e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  62.62 
 
 		 307 aa  350  2e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  62.95 
 
 		 307 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0404  cysteine synthase  62.17 
 
 		 308 aa  350  2e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  62.62 
 
 		 307 aa  349  4e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  62.62 
 
 		 307 aa  349  4e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  62.62 
 
 		 307 aa  348  5e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  62.62 
 
 		 307 aa  348  5e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  62.62 
 
 		 307 aa  348  5e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  62.62 
 
 		 307 aa  348  5e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  62.3 
 
 		 307 aa  347  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  58.09 
 
 		 306 aa  343  2e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  58.63 
 
 		 307 aa  341  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  58.75 
 
 		 305 aa  326  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  56.62 
 
 		 307 aa  326  3e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  60.2 
 
 		 306 aa  324  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  58.44 
 
 		 308 aa  323  3e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  54.97 
 
 		 307 aa  322  4e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  56.86 
 
 		 309 aa  320  9.999999999999999e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  57.7 
 
 		 308 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  54.82 
 
 		 305 aa  317  2e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  53.44 
 
 		 304 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  54.64 
 
 		 321 aa  315  4e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  55.74 
 
 		 310 aa  315  7e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1922  cysteine synthase A  56.07 
 
 		 307 aa  315  7e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  53.14 
 
 		 304 aa  315  8e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  54.85 
 
 		 307 aa  314  9.999999999999999e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  55.52 
 
 		 310 aa  314  9.999999999999999e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1529  cysteine synthase A  56.58 
 
 		 300 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000033727  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  58.12 
 
 		 309 aa  311  5.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  52.58 
 
 		 311 aa  311  6.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1322  cysteine synthase A  56.58 
 
 		 300 aa  310  1e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353191  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  55.08 
 
 		 302 aa  309  4e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  53.49 
 
 		 305 aa  308  5e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  54.75 
 
 		 309 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  52.98 
 
 		 301 aa  308  1.0000000000000001e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0865  cysteine synthase  52.82 
 
 		 306 aa  307  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  56.17 
 
 		 309 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  54.34 
 
 		 327 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  55.26 
 
 		 309 aa  306  2.0000000000000002e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  53.82 
 
 		 305 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  55.59 
 
 		 318 aa  306  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  50.99 
 
 		 315 aa  306  4.0000000000000004e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  54.07 
 
 		 311 aa  305  5.0000000000000004e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  55.84 
 
 		 324 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  51.5 
 
 		 306 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  54.69 
 
 		 308 aa  305  6e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  54.22 
 
 		 309 aa  305  8.000000000000001e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1091  cysteine synthase  54.39 
 
 		 303 aa  305  8.000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000826995  decreased coverage  0.00308217 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6440  cysteine synthase A  53.16 
 
 		 305 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  54.52 
 
 		 310 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  53.49 
 
 		 302 aa  304  1.0000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2103  cysteine synthase  53.33 
 
 		 305 aa  304  1.0000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0401259  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3723  cysteine synthase  52.82 
 
 		 305 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  53.4 
 
 		 311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3006  cysteine synthase A  52.82 
 
 		 305 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.599463  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  54.4 
 
 		 310 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  53.29 
 
 		 309 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  53.57 
 
 		 311 aa  302  5.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  51.14 
 
 		 311 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  53.16 
 
 		 323 aa  301  8.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  53.72 
 
 		 310 aa  301  8.000000000000001e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  53.25 
 
 		 308 aa  301  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  53.59 
 
 		 309 aa  300  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  53.16 
 
 		 306 aa  300  1e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6147  cysteine synthase A  52.49 
 
 		 305 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  50.83 
 
 		 305 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  51.84 
 
 		 302 aa  300  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  55.63 
 
 		 311 aa  300  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2361  cysteine synthase A  55.41 
 
 		 307 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1697  cysteine synthase A  53.29 
 
 		 305 aa  299  3e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1831  cysteine synthase A  53.29 
 
 		 305 aa  299  3e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  54.72 
 
 		 326 aa  299  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  54.72 
 
 		 326 aa  299  3e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  56.57 
 
 		 309 aa  299  4e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1720  cysteine synthase  55.59 
 
 		 302 aa  299  4e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0556189 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  53.92 
 
 		 309 aa  299  4e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  52.41 
 
 		 317 aa  299  4e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0955  cysteine synthase A  59.27 
 
 		 305 aa  299  4e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  54.22 
 
 		 327 aa  299  4e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1438  cysteine synthase A  52.96 
 
 		 305 aa  298  5e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.412307  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1653  cysteine synthase A  52.96 
 
 		 305 aa  298  6e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1691  cysteine synthase A  52.96 
 
 		 305 aa  298  6e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  52.09 
 
 		 317 aa  298  8e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2286  cysteine synthase A  54.87 
 
 		 309 aa  298  1e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1875  cysteine synthase A  52.63 
 
 		 305 aa  297  1e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101872 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  49.02 
 
 		 304 aa  298  1e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>