More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1258 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  100 
 
 		 327 aa  666    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  72.82 
 
 		 311 aa  457  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  74.28 
 
 		 317 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  75.32 
 
 		 317 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  71.2 
 
 		 311 aa  420  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  70.49 
 
 		 310 aa  419  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  69.77 
 
 		 317 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  68.61 
 
 		 310 aa  412  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  71.7 
 
 		 309 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  68.93 
 
 		 308 aa  400  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  69.55 
 
 		 309 aa  392  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  69.58 
 
 		 309 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  62.9 
 
 		 309 aa  385  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  66.34 
 
 		 310 aa  384  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  68.91 
 
 		 309 aa  381  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  66.56 
 
 		 309 aa  381  1e-105  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  65.05 
 
 		 308 aa  378  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  64.61 
 
 		 308 aa  378  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  65.48 
 
 		 310 aa  376  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  62.87 
 
 		 309 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  62.95 
 
 		 308 aa  372  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  61.24 
 
 		 309 aa  371  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  61.56 
 
 		 309 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  60.71 
 
 		 312 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  62.62 
 
 		 311 aa  369  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  65.03 
 
 		 309 aa  370  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  60.91 
 
 		 309 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  63.19 
 
 		 311 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  59.74 
 
 		 312 aa  365  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  61.69 
 
 		 318 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  64.26 
 
 		 309 aa  366  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  59.22 
 
 		 310 aa  367  1e-100  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  63.02 
 
 		 309 aa  367  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  62.87 
 
 		 311 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  60.13 
 
 		 311 aa  362  3e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  62.9 
 
 		 310 aa  362  6e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1301  cysteine synthase A  59.93 
 
 		 309 aa  361  8e-99  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.568697 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  65.03 
 
 		 309 aa  361  8e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  63.73 
 
 		 311 aa  360  1e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  61.49 
 
 		 308 aa  360  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  59.8 
 
 		 304 aa  360  2e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  59.34 
 
 		 310 aa  359  3e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  59.09 
 
 		 320 aa  359  4e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  64.38 
 
 		 309 aa  358  5e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  63.76 
 
 		 308 aa  358  7e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2286  cysteine synthase A  62.87 
 
 		 309 aa  358  8e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  57.61 
 
 		 311 aa  358  8e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  58.5 
 
 		 307 aa  358  9e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  61.81 
 
 		 308 aa  358  9.999999999999999e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  58.17 
 
 		 310 aa  357  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  61.36 
 
 		 319 aa  356  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  58.17 
 
 		 310 aa  357  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  63.64 
 
 		 306 aa  357  1.9999999999999998e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  60.26 
 
 		 316 aa  357  1.9999999999999998e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  59.81 
 
 		 320 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  56.52 
 
 		 328 aa  356  2.9999999999999997e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0075  cysteine synthase A  62.21 
 
 		 328 aa  354  1e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  60.39 
 
 		 322 aa  354  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  60.06 
 
 		 329 aa  353  2e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  59.74 
 
 		 327 aa  353  2e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4407  cysteine synthase A  62.66 
 
 		 328 aa  353  2e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119856 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  62.87 
 
 		 311 aa  352  4e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  62.91 
 
 		 324 aa  352  5e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  61.92 
 
 		 327 aa  352  5e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  60.91 
 
 		 310 aa  352  5.9999999999999994e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  61.36 
 
 		 320 aa  352  7e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  59.74 
 
 		 320 aa  350  1e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  55.88 
 
 		 304 aa  350  2e-95  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  58.12 
 
 		 311 aa  349  3e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  59.09 
 
 		 320 aa  349  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  59.09 
 
 		 320 aa  348  7e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  62.09 
 
 		 305 aa  348  8e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  60.46 
 
 		 309 aa  348  8e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2647  cysteine synthase A  64.5 
 
 		 310 aa  347  1e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.100926  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  59.93 
 
 		 322 aa  347  2e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  60.06 
 
 		 330 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  58.63 
 
 		 313 aa  346  3e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0452  cysteine synthases  61.81 
 
 		 308 aa  345  6e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  60.7 
 
 		 322 aa  345  8e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  61.76 
 
 		 310 aa  345  8e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  60.59 
 
 		 309 aa  344  1e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  56.49 
 
 		 307 aa  344  1e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1466  cysteine synthase  60.83 
 
 		 334 aa  343  2e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00108529  normal  0.10478 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  58.25 
 
 		 307 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  59.35 
 
 		 309 aa  342  4e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  60.93 
 
 		 327 aa  342  5e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  56.03 
 
 		 339 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  61.11 
 
 		 314 aa  342  7e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  63.88 
 
 		 307 aa  341  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0178  cysteine synthase A  61.04 
 
 		 331 aa  340  2e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3068  cysteine synthase A  59.18 
 
 		 316 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145676  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  56.49 
 
 		 309 aa  339  2.9999999999999998e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  61.26 
 
 		 309 aa  338  5e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4605  cysteine synthase A  60.26 
 
 		 320 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3653  cysteine synthase A  58.65 
 
 		 319 aa  338  7e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528018  hitchhiker  1.6930700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  60.4 
 
 		 326 aa  338  9e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  60.4 
 
 		 326 aa  338  9e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  58.12 
 
 		 311 aa  338  9.999999999999999e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  62.42 
 
 		 307 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  53.27 
 
 		 304 aa  338  9.999999999999999e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>