More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1558 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  100 
 
 		 309 aa  620  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  76.45 
 
 		 311 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  79.15 
 
 		 309 aa  464  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  75.48 
 
 		 311 aa  434  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  71.2 
 
 		 317 aa  421  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  71.8 
 
 		 310 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  68.18 
 
 		 308 aa  414  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  69.26 
 
 		 317 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  69.16 
 
 		 308 aa  412  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  68.98 
 
 		 308 aa  414  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  68.61 
 
 		 317 aa  408  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  68.4 
 
 		 308 aa  402  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  66.34 
 
 		 318 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  68.65 
 
 		 311 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  67.1 
 
 		 310 aa  398  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  67.31 
 
 		 310 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  67.43 
 
 		 308 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  66.02 
 
 		 309 aa  397  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  67.32 
 
 		 309 aa  395  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  67.43 
 
 		 308 aa  393  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  66.34 
 
 		 309 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  69.74 
 
 		 309 aa  389  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  66.34 
 
 		 310 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  66.01 
 
 		 309 aa  384  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  68.09 
 
 		 310 aa  387  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  69.58 
 
 		 327 aa  385  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  66.34 
 
 		 309 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  61.56 
 
 		 311 aa  386  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  66.12 
 
 		 308 aa  387  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  61.49 
 
 		 311 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  63.49 
 
 		 304 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  66.88 
 
 		 309 aa  382  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  62.5 
 
 		 312 aa  383  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  65.69 
 
 		 309 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  69.35 
 
 		 309 aa  379  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  65.26 
 
 		 309 aa  380  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  66.67 
 
 		 311 aa  377  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  65.37 
 
 		 319 aa  378  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  65.91 
 
 		 309 aa  380  1e-104  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  69.35 
 
 		 309 aa  378  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  61.84 
 
 		 312 aa  378  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  63.96 
 
 		 311 aa  379  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  62.54 
 
 		 311 aa  375  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  63.11 
 
 		 313 aa  375  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  66.34 
 
 		 311 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  63.75 
 
 		 320 aa  372  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  62.78 
 
 		 320 aa  372  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  63.11 
 
 		 330 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  63.43 
 
 		 320 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  60.53 
 
 		 304 aa  373  1e-102  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  66.45 
 
 		 309 aa  368  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  63.96 
 
 		 329 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  65.9 
 
 		 310 aa  368  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  67.65 
 
 		 311 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  66.12 
 
 		 323 aa  369  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2647  cysteine synthase A  67.32 
 
 		 310 aa  368  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.100926  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  62.78 
 
 		 320 aa  368  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  66.45 
 
 		 309 aa  364  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  62.66 
 
 		 322 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  60 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  61.29 
 
 		 327 aa  364  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  64.71 
 
 		 314 aa  364  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  64.47 
 
 		 310 aa  364  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  63.64 
 
 		 311 aa  364  1e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  62.99 
 
 		 311 aa  363  2e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  59.48 
 
 		 307 aa  363  2e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0452  cysteine synthases  66.12 
 
 		 308 aa  363  2e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  68.3 
 
 		 306 aa  362  4e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3653  cysteine synthase A  64.71 
 
 		 319 aa  362  6e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528018  hitchhiker  1.6930700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4407  cysteine synthase A  63.23 
 
 		 328 aa  361  8e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119856 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0075  cysteine synthase A  63.84 
 
 		 328 aa  361  1e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  64.5 
 
 		 322 aa  360  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  64.08 
 
 		 320 aa  359  3e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  63.73 
 
 		 327 aa  359  3e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1466  cysteine synthase  66.02 
 
 		 334 aa  358  5e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00108529  normal  0.10478 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  61.92 
 
 		 309 aa  358  5e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  60.59 
 
 		 309 aa  358  7e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  58.69 
 
 		 320 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  63.31 
 
 		 311 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  59.74 
 
 		 311 aa  355  5e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  63.07 
 
 		 327 aa  355  5e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  62.9 
 
 		 320 aa  355  5e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1502  cysteine synthase A  63.11 
 
 		 321 aa  355  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18267e-17 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  60.67 
 
 		 310 aa  355  6.999999999999999e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0178  cysteine synthase A  63.64 
 
 		 331 aa  354  8.999999999999999e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  59.27 
 
 		 310 aa  354  1e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  59.27 
 
 		 310 aa  354  1e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4605  cysteine synthase A  63.96 
 
 		 320 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  62.42 
 
 		 322 aa  353  2e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  57.38 
 
 		 304 aa  353  2e-96  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  61.89 
 
 		 309 aa  353  2e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  59.15 
 
 		 320 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0559  cysteine synthase A  62.87 
 
 		 332 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.770107  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0444  cysteine synthase A  64.4 
 
 		 320 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00894315 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  60.9 
 
 		 316 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0433  cysteine synthase A  64.4 
 
 		 320 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  60.26 
 
 		 339 aa  351  8e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  57.76 
 
 		 307 aa  350  1e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  56.13 
 
 		 310 aa  350  1e-95  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  59.61 
 
 		 308 aa  351  1e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>