More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0889 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  100 
 
 
304 aa  615  1e-175  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  67.33 
 
 
304 aa  421  1e-117  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  62.05 
 
 
309 aa  374  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  58.09 
 
 
307 aa  362  6e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  57.33 
 
 
311 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  59.61 
 
 
310 aa  355  6.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  59.02 
 
 
310 aa  353  2e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  58.31 
 
 
309 aa  353  2e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  59.15 
 
 
318 aa  344  1e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0902  cysteine synthase A  57.43 
 
 
299 aa  342  5.999999999999999e-93  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000036612  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  56.07 
 
 
307 aa  342  7e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2286  cysteine synthase A  59.28 
 
 
309 aa  338  5e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  53.44 
 
 
311 aa  338  5.9999999999999996e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  57.7 
 
 
309 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  54.1 
 
 
304 aa  334  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  57.33 
 
 
311 aa  332  5e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  56.07 
 
 
310 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  58.03 
 
 
309 aa  331  7.000000000000001e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0990  cysteine synthase A  56.11 
 
 
299 aa  331  1e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.0058381  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  57 
 
 
309 aa  327  1.0000000000000001e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  57.38 
 
 
309 aa  326  3e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  57.05 
 
 
306 aa  325  6e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  55.88 
 
 
327 aa  324  9e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  54.79 
 
 
308 aa  320  9.999999999999999e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  54.52 
 
 
304 aa  319  3e-86  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  54.07 
 
 
317 aa  319  3e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2776  cysteine synthase A  57 
 
 
312 aa  320  3e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  56.07 
 
 
310 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  54.43 
 
 
308 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  51.97 
 
 
311 aa  318  7.999999999999999e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  54.75 
 
 
309 aa  318  9e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  54.79 
 
 
308 aa  317  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  52.3 
 
 
308 aa  316  3e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  51.96 
 
 
309 aa  315  5e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1301  cysteine synthase A  54.22 
 
 
309 aa  315  5e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.568697 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  54.28 
 
 
309 aa  315  6e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  51.63 
 
 
309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  53.75 
 
 
317 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  56.21 
 
 
305 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  52.61 
 
 
309 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  51.63 
 
 
309 aa  312  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  56.03 
 
 
311 aa  311  6.999999999999999e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  53.42 
 
 
317 aa  310  2e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  56.54 
 
 
311 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3080  cysteine synthase  54.1 
 
 
309 aa  310  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  53.29 
 
 
312 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  56.21 
 
 
311 aa  309  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  55.25 
 
 
306 aa  308  5e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1224  cysteine synthase A  51.49 
 
 
300 aa  308  9e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.47956e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  57.19 
 
 
309 aa  307  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  57.05 
 
 
309 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  56.25 
 
 
309 aa  306  3e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  51 
 
 
310 aa  306  4.0000000000000004e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  55.41 
 
 
308 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  53.33 
 
 
320 aa  305  5.0000000000000004e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  55.07 
 
 
308 aa  305  5.0000000000000004e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  53.29 
 
 
312 aa  305  6e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26961  O-acetylserinethiol lyase/cysteine synthase  57.45 
 
 
305 aa  305  6e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  53.72 
 
 
320 aa  305  7e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  53.9 
 
 
309 aa  305  7e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0162  cysteine synthase  51.83 
 
 
305 aa  305  8.000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  53.11 
 
 
308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  54.05 
 
 
330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  53.62 
 
 
311 aa  302  5.000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  53.27 
 
 
311 aa  302  6.000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  52.94 
 
 
310 aa  301  8.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  50.33 
 
 
310 aa  301  9e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  50.33 
 
 
310 aa  301  9e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  53.59 
 
 
309 aa  300  1e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  53.33 
 
 
320 aa  300  2e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  53.62 
 
 
311 aa  300  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  51.67 
 
 
320 aa  299  4e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  53.27 
 
 
307 aa  298  5e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  54.07 
 
 
323 aa  298  6e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  52.75 
 
 
320 aa  298  7e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  54.67 
 
 
307 aa  298  8e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  52.46 
 
 
308 aa  298  9e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  54.05 
 
 
319 aa  297  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  55.56 
 
 
311 aa  296  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  54.61 
 
 
311 aa  296  3e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  50.67 
 
 
302 aa  296  3e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  47.88 
 
 
315 aa  296  4e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1476  cysteine synthase A  51.13 
 
 
324 aa  296  4e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  53.23 
 
 
316 aa  296  4e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  51.63 
 
 
310 aa  296  4e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  53.44 
 
 
310 aa  295  7e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2658  cysteine synthase  52.79 
 
 
310 aa  295  7e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.556672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  53.07 
 
 
320 aa  295  9e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  52.79 
 
 
311 aa  295  9e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  52.61 
 
 
309 aa  293  2e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3653  cysteine synthase A  52.94 
 
 
319 aa  293  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528018  hitchhiker  1.6930700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  49.02 
 
 
310 aa  293  2e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  52.08 
 
 
317 aa  293  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  52.79 
 
 
314 aa  293  3e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  51.31 
 
 
327 aa  293  3e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  54.61 
 
 
311 aa  292  4e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  53.27 
 
 
307 aa  292  6e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0484  cysteine synthase A  51.46 
 
 
324 aa  292  6e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.261567  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3068  cysteine synthase A  50.32 
 
 
316 aa  292  6e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145676  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  52.94 
 
 
307 aa  291  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>