More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0178 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  100 
 
 
316 aa  623  1e-177  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  65.15 
 
 
311 aa  367  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  63.88 
 
 
309 aa  357  9.999999999999999e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  59.55 
 
 
311 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  61.72 
 
 
308 aa  352  2.9999999999999997e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  58.5 
 
 
308 aa  352  5e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  60 
 
 
310 aa  350  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  56.58 
 
 
311 aa  348  8e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  58.96 
 
 
309 aa  346  3e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  60.13 
 
 
308 aa  343  2.9999999999999997e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  55.7 
 
 
312 aa  341  8e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  58.63 
 
 
308 aa  341  9e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  58.84 
 
 
327 aa  341  1e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  59.6 
 
 
317 aa  340  2e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  62.87 
 
 
309 aa  340  2e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  61.24 
 
 
309 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  59.93 
 
 
317 aa  339  4e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  55.7 
 
 
309 aa  338  8e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  60.78 
 
 
308 aa  338  8e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  58.71 
 
 
320 aa  336  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  54.84 
 
 
312 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  55 
 
 
304 aa  334  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  57.76 
 
 
318 aa  332  3e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  58.67 
 
 
308 aa  333  3e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  57.7 
 
 
311 aa  332  5e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  56.41 
 
 
320 aa  331  1e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  57.95 
 
 
317 aa  330  1e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  58.63 
 
 
309 aa  330  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  56.86 
 
 
310 aa  331  1e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  57.24 
 
 
307 aa  331  1e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  57.38 
 
 
311 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  55.37 
 
 
307 aa  329  3e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  54.4 
 
 
309 aa  329  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  57.86 
 
 
320 aa  329  4e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  56.86 
 
 
320 aa  328  5.0000000000000004e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  58.17 
 
 
308 aa  328  6e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4407  cysteine synthase A  58.06 
 
 
328 aa  327  1.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.119856 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  56.31 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  57.7 
 
 
311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  53.75 
 
 
309 aa  326  3e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  57.52 
 
 
309 aa  326  4.0000000000000003e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  53.42 
 
 
309 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  56.82 
 
 
314 aa  325  5e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  59.74 
 
 
311 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  59.08 
 
 
320 aa  324  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  57.37 
 
 
320 aa  324  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  57.05 
 
 
311 aa  323  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  57.05 
 
 
322 aa  323  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  56.21 
 
 
309 aa  322  4e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  54.9 
 
 
320 aa  321  9.000000000000001e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2647  cysteine synthase A  57.33 
 
 
310 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.100926  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  57.1 
 
 
319 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  57.61 
 
 
310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  56.77 
 
 
330 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  57 
 
 
304 aa  319  3e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  59.74 
 
 
309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0241  cysteine synthase  54.75 
 
 
315 aa  318  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  49.19 
 
 
311 aa  318  9e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  56.77 
 
 
316 aa  318  9e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0452  cysteine synthases  55.48 
 
 
308 aa  317  1e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  56.91 
 
 
316 aa  317  1e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  60.8 
 
 
323 aa  317  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  57.43 
 
 
309 aa  316  3e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  58.42 
 
 
313 aa  316  3e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  53.92 
 
 
310 aa  316  4e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  58.44 
 
 
309 aa  316  4e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  56.29 
 
 
327 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  56.72 
 
 
329 aa  314  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  55.3 
 
 
327 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  54.49 
 
 
322 aa  313  1.9999999999999998e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  58.44 
 
 
309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  58.12 
 
 
309 aa  313  2.9999999999999996e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2623  cysteine synthase A  50.81 
 
 
329 aa  312  3.9999999999999997e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0075  cysteine synthase A  56.58 
 
 
328 aa  312  3.9999999999999997e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  58.2 
 
 
322 aa  312  4.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  56.49 
 
 
310 aa  312  5.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  52.12 
 
 
311 aa  311  6.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  52.63 
 
 
328 aa  310  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  55.96 
 
 
324 aa  309  4e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3653  cysteine synthase A  57.57 
 
 
319 aa  308  5e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528018  hitchhiker  1.6930700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  59.41 
 
 
305 aa  308  5.9999999999999995e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  58.22 
 
 
320 aa  308  6.999999999999999e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  55.45 
 
 
320 aa  308  8e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  54.69 
 
 
309 aa  307  2.0000000000000002e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0178  cysteine synthase A  57.7 
 
 
331 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  54.4 
 
 
311 aa  306  3e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  56.81 
 
 
327 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1502  cysteine synthase A  56.41 
 
 
321 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18267e-17 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01381  O-acetylserine (thiol)-lyase A  54.3 
 
 
322 aa  305  8.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  57.84 
 
 
306 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  53.92 
 
 
310 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  52.44 
 
 
311 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4360  cysteine synthase  57.57 
 
 
322 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  52.13 
 
 
310 aa  303  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  52.77 
 
 
309 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  52.13 
 
 
310 aa  303  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  52.17 
 
 
309 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  55.84 
 
 
309 aa  302  4.0000000000000003e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  51.97 
 
 
302 aa  302  5.000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2594  cysteine synthase A  55.92 
 
 
326 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.125918  normal  0.194019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>