More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1438 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1438  cysteine synthase A  100 
 
 
305 aa  614  1e-175  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  56.25 
 
 
308 aa  326  3e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  56.68 
 
 
311 aa  325  6e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  57.89 
 
 
306 aa  321  9.000000000000001e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  50.83 
 
 
312 aa  315  8e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  50.17 
 
 
312 aa  310  2e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  54.97 
 
 
306 aa  310  2e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  52.96 
 
 
308 aa  310  2e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  51.64 
 
 
310 aa  308  5e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  51.64 
 
 
310 aa  308  5e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  51.18 
 
 
302 aa  308  8e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  53.95 
 
 
307 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  50.67 
 
 
304 aa  302  5.000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  49.34 
 
 
310 aa  301  9e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  50.82 
 
 
310 aa  301  9e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  54.93 
 
 
305 aa  301  1e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  48.33 
 
 
303 aa  298  6e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  54.93 
 
 
307 aa  297  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  53.95 
 
 
307 aa  297  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  51.5 
 
 
306 aa  297  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  50.33 
 
 
321 aa  297  2e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  53.95 
 
 
307 aa  296  3e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1322  cysteine synthase A  52.81 
 
 
300 aa  296  3e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353191  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  53.95 
 
 
307 aa  295  5e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  53.95 
 
 
307 aa  295  5e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  53.95 
 
 
307 aa  295  5e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  53.95 
 
 
307 aa  295  5e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  49.02 
 
 
307 aa  295  5e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  53.95 
 
 
307 aa  295  5e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  53.77 
 
 
310 aa  294  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  53.62 
 
 
307 aa  294  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  49.67 
 
 
309 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1529  cysteine synthase A  53.14 
 
 
300 aa  294  1e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000033727  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  49.67 
 
 
309 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  47.06 
 
 
315 aa  293  2e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  51.15 
 
 
310 aa  293  3e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  52.96 
 
 
309 aa  291  7e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1438  cysteine synthase A  50.49 
 
 
305 aa  291  7e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.412307  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  50.65 
 
 
308 aa  291  8e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  47.87 
 
 
304 aa  291  8e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  50.33 
 
 
307 aa  291  1e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  49.35 
 
 
309 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  50.67 
 
 
320 aa  291  1e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  50.33 
 
 
311 aa  290  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  52.96 
 
 
307 aa  290  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  49.51 
 
 
309 aa  290  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  49.35 
 
 
309 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  50.17 
 
 
291 aa  290  3e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  49.01 
 
 
301 aa  289  3e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  48.03 
 
 
311 aa  289  4e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  50.5 
 
 
306 aa  288  8e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  49.66 
 
 
302 aa  288  9e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  49.67 
 
 
320 aa  286  2e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  51.63 
 
 
317 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3506  cysteine synthase A  49.84 
 
 
305 aa  286  4e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  50.33 
 
 
309 aa  285  5e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  49.32 
 
 
290 aa  285  8e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  45.9 
 
 
311 aa  285  8e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  50.83 
 
 
308 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  49.01 
 
 
316 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  52.12 
 
 
317 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1678  cysteine synthase A  49.18 
 
 
305 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.423565  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1653  cysteine synthase A  49.18 
 
 
305 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1691  cysteine synthase A  49.51 
 
 
305 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1875  cysteine synthase A  49.18 
 
 
305 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101872 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1954  cysteine synthase A  49.18 
 
 
305 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1837  cysteine synthase A  49.51 
 
 
305 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1697  cysteine synthase A  48.85 
 
 
305 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1831  cysteine synthase A  48.85 
 
 
305 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  48 
 
 
305 aa  283  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  52.81 
 
 
308 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  50.16 
 
 
311 aa  282  5.000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1919  cysteine synthase A  49.18 
 
 
305 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468327  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  52.48 
 
 
308 aa  281  7.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  48.52 
 
 
318 aa  281  7.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0990  cysteine synthase A  49.67 
 
 
299 aa  281  8.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.0058381  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  51.15 
 
 
308 aa  281  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2647  cysteine synthase A  50.33 
 
 
310 aa  279  4e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.100926  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  47 
 
 
305 aa  278  5e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  50.65 
 
 
309 aa  278  6e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  48 
 
 
305 aa  278  8e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  49.67 
 
 
302 aa  278  9e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  49.02 
 
 
310 aa  278  9e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  49.35 
 
 
320 aa  277  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  48.83 
 
 
307 aa  278  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  50.33 
 
 
317 aa  278  1e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  51.14 
 
 
310 aa  277  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  49.33 
 
 
320 aa  276  3e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  48.85 
 
 
307 aa  276  3e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  49.34 
 
 
309 aa  276  4e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  48.04 
 
 
311 aa  275  6e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  46.67 
 
 
306 aa  275  7e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0902  cysteine synthase A  48.68 
 
 
299 aa  275  8e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000036612  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  46.23 
 
 
306 aa  275  9e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  47.71 
 
 
311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  49.34 
 
 
309 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  47.33 
 
 
305 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0334  cysteine synthase A  51.8 
 
 
308 aa  273  3e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  49.67 
 
 
307 aa  273  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0537  cysteine synthase  52.79 
 
 
321 aa  273  3e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00106309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>