More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1235 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  100 
 
 
320 aa  644    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  77.6 
 
 
320 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1502  cysteine synthase A  78.8 
 
 
321 aa  474  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18267e-17 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  75.94 
 
 
319 aa  477  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  77.53 
 
 
320 aa  475  1e-133  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  78.21 
 
 
320 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0444  cysteine synthase A  79.62 
 
 
320 aa  461  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00894315 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0433  cysteine synthase A  79.62 
 
 
320 aa  461  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  76.6 
 
 
313 aa  463  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  75.24 
 
 
320 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  73.4 
 
 
330 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  73.08 
 
 
320 aa  442  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1466  cysteine synthase  75.24 
 
 
334 aa  429  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00108529  normal  0.10478 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  63.9 
 
 
310 aa  385  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  64.63 
 
 
309 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  65.38 
 
 
323 aa  378  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  64.42 
 
 
310 aa  375  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01381  O-acetylserine (thiol)-lyase A  64.1 
 
 
322 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  63.9 
 
 
309 aa  377  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  63.43 
 
 
322 aa  373  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  60.97 
 
 
311 aa  372  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  64.63 
 
 
311 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  65.48 
 
 
309 aa  371  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  64.31 
 
 
311 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  64.42 
 
 
311 aa  368  1e-101  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  63.23 
 
 
311 aa  366  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  64.08 
 
 
308 aa  366  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  65.05 
 
 
309 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  65.05 
 
 
309 aa  365  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  62.5 
 
 
309 aa  365  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01951  O-acetylserine (thiol)-lyase A  65.05 
 
 
322 aa  364  1e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.958038  normal  0.621094 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  61.74 
 
 
311 aa  364  1e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1490  cysteine synthase  65.37 
 
 
322 aa  363  2e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  61.54 
 
 
309 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  64.72 
 
 
309 aa  363  2e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  62.7 
 
 
311 aa  362  3e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  62.82 
 
 
322 aa  362  4e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  61.22 
 
 
309 aa  362  6e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  60.97 
 
 
339 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  63.99 
 
 
329 aa  361  9e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  60.9 
 
 
309 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  63.87 
 
 
309 aa  359  3e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  59.49 
 
 
311 aa  359  3e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  61.74 
 
 
310 aa  358  8e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  64.31 
 
 
311 aa  357  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26311  O-acetylserine (thiol)-lyase A  62.78 
 
 
328 aa  357  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  62.46 
 
 
327 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  59.87 
 
 
312 aa  356  1.9999999999999998e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  63.14 
 
 
310 aa  356  2.9999999999999997e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  61.74 
 
 
311 aa  356  2.9999999999999997e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  64.08 
 
 
308 aa  355  6.999999999999999e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  63.78 
 
 
322 aa  354  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  58.52 
 
 
318 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  60.65 
 
 
310 aa  352  4e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  62.34 
 
 
308 aa  352  4e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0178  cysteine synthase A  63.34 
 
 
331 aa  352  4e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  60.97 
 
 
316 aa  352  7e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  60.84 
 
 
309 aa  351  8.999999999999999e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  61.86 
 
 
310 aa  350  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  59.03 
 
 
312 aa  350  1e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  59.09 
 
 
311 aa  350  1e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  59.87 
 
 
309 aa  350  3e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  62.14 
 
 
309 aa  349  4e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4605  cysteine synthase A  63.46 
 
 
320 aa  349  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  61.81 
 
 
327 aa  348  6e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2647  cysteine synthase A  62.7 
 
 
310 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.100926  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  58.58 
 
 
317 aa  347  1e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  61.94 
 
 
311 aa  347  1e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4340  cysteine synthase A  63.46 
 
 
320 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.899822 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  60.77 
 
 
311 aa  347  2e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  56.27 
 
 
311 aa  347  2e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0325  cysteine synthase K/M/A  62.14 
 
 
322 aa  347  2e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  61.54 
 
 
324 aa  347  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  60.52 
 
 
309 aa  347  2e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  60.52 
 
 
317 aa  346  3e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  60.13 
 
 
308 aa  345  4e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  62.9 
 
 
309 aa  345  5e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  60.13 
 
 
309 aa  344  1e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  58.9 
 
 
308 aa  343  2e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0452  cysteine synthases  62.14 
 
 
308 aa  343  2e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  60.77 
 
 
311 aa  343  2e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1476  cysteine synthase A  59.03 
 
 
324 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  61.22 
 
 
326 aa  342  4e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  61.22 
 
 
326 aa  342  4e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  59.29 
 
 
309 aa  342  5.999999999999999e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  58.04 
 
 
317 aa  341  8e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  59.81 
 
 
327 aa  341  9e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  57.89 
 
 
310 aa  341  1e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  61.41 
 
 
316 aa  341  1e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01371  O-acetylserine (thiol)-lyase A  60.32 
 
 
322 aa  340  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.225049  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01401  O-acetylserine (thiol)-lyase A  61.61 
 
 
322 aa  341  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.171257  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  59.49 
 
 
308 aa  340  2e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  57.61 
 
 
310 aa  340  2e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  57.88 
 
 
309 aa  340  2e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  57.61 
 
 
310 aa  340  2e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  58.65 
 
 
309 aa  340  2e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0913  cysteine synthase A  60.9 
 
 
325 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  58.2 
 
 
309 aa  339  2.9999999999999998e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  60.53 
 
 
320 aa  339  4e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  59.74 
 
 
327 aa  338  7e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>