More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0241 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0241  cysteine synthase  100 
 
 
315 aa  629  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  64.52 
 
 
339 aa  391  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  63.96 
 
 
328 aa  383  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  64.08 
 
 
329 aa  378  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  64.72 
 
 
322 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  66.45 
 
 
322 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3653  cysteine synthase A  63.31 
 
 
319 aa  368  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528018  hitchhiker  1.6930700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4340  cysteine synthase A  66.02 
 
 
320 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.899822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4605  cysteine synthase A  65.37 
 
 
320 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0178  cysteine synthase A  63.43 
 
 
331 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  60.32 
 
 
316 aa  355  6.999999999999999e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0075  cysteine synthase A  62.99 
 
 
328 aa  354  8.999999999999999e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  59.09 
 
 
327 aa  350  2e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  58.77 
 
 
327 aa  349  3e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1015  cysteine synthase A  64.08 
 
 
328 aa  348  5e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  56.35 
 
 
311 aa  348  7e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  59.55 
 
 
320 aa  348  8e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4360  cysteine synthase  62.66 
 
 
322 aa  345  4e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  58.31 
 
 
309 aa  342  5e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1893  cysteine synthase A  62.78 
 
 
327 aa  341  9e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.480284  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  58.12 
 
 
327 aa  340  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0477  cysteine synthase  61.74 
 
 
332 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  59.22 
 
 
320 aa  339  2.9999999999999998e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1773  cysteine synthases  60.39 
 
 
325 aa  338  5.9999999999999996e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  59.22 
 
 
319 aa  338  8e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4407  cysteine synthase A  59.09 
 
 
328 aa  338  8e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.119856 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2177  cysteine synthase A  60.52 
 
 
328 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  59.09 
 
 
320 aa  335  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  57.05 
 
 
317 aa  334  1e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  57.57 
 
 
309 aa  334  1e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  60.06 
 
 
309 aa  334  1e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  55.7 
 
 
311 aa  334  1e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  58.77 
 
 
310 aa  333  2e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  57.79 
 
 
310 aa  333  2e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0556  cysteine synthases  60.39 
 
 
323 aa  333  2e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523099  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0559  cysteine synthase A  60.77 
 
 
332 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.770107  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  56.96 
 
 
320 aa  332  3e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  56.63 
 
 
330 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  58.96 
 
 
311 aa  332  4e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  63.07 
 
 
309 aa  332  5e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0343  cysteine synthase A  61.41 
 
 
332 aa  332  5e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.516891  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  58.63 
 
 
311 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  63.31 
 
 
309 aa  330  2e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2623  cysteine synthase A  54.22 
 
 
329 aa  329  3e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  57.79 
 
 
309 aa  328  6e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  59.28 
 
 
310 aa  328  9e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  57.47 
 
 
309 aa  327  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1794  cysteine synthase  60.39 
 
 
325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  unclonable  0.00000000492441  normal  0.123745 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  58.77 
 
 
311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  57 
 
 
308 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  57.47 
 
 
309 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  57.42 
 
 
320 aa  327  2.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  55.84 
 
 
326 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  55.84 
 
 
326 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  58.5 
 
 
320 aa  325  5e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2647  cysteine synthase A  60.59 
 
 
310 aa  325  7e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.100926  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  59.28 
 
 
311 aa  325  9e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0433  cysteine synthase A  59.22 
 
 
320 aa  324  9e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0444  cysteine synthase A  59.22 
 
 
320 aa  324  9e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00894315 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  55.08 
 
 
317 aa  324  1e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0913  cysteine synthase A  55.31 
 
 
325 aa  324  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  56.49 
 
 
311 aa  324  1e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  54.22 
 
 
324 aa  323  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  56.96 
 
 
313 aa  323  2e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  57.05 
 
 
308 aa  323  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  56.21 
 
 
309 aa  323  3e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  56.77 
 
 
308 aa  322  4e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  58.17 
 
 
309 aa  322  4e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2594  cysteine synthase A  58.52 
 
 
326 aa  322  4e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.125918  normal  0.194019 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  54.75 
 
 
316 aa  322  6e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  56.49 
 
 
311 aa  322  6e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  54.9 
 
 
308 aa  320  9.999999999999999e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  56.68 
 
 
308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  58.9 
 
 
316 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  58.44 
 
 
309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  54.75 
 
 
317 aa  319  3e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  57.79 
 
 
309 aa  319  3e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  55.84 
 
 
311 aa  319  5e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  55.37 
 
 
322 aa  318  6e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  58.12 
 
 
309 aa  317  1e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  54.55 
 
 
311 aa  317  1e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  56.49 
 
 
308 aa  317  2e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1502  cysteine synthase A  55.66 
 
 
321 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18267e-17 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  55.37 
 
 
310 aa  317  2e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  56.63 
 
 
323 aa  315  4e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  55.7 
 
 
308 aa  315  5e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  57.05 
 
 
309 aa  315  5e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  55.88 
 
 
309 aa  315  6e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  54.4 
 
 
311 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  57.14 
 
 
311 aa  314  9.999999999999999e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  56.49 
 
 
311 aa  314  9.999999999999999e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  57 
 
 
309 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  53.57 
 
 
311 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  51.47 
 
 
311 aa  312  3.9999999999999997e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  57.38 
 
 
314 aa  311  6.999999999999999e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  55.74 
 
 
327 aa  311  9e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1466  cysteine synthase  58.12 
 
 
334 aa  311  9e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00108529  normal  0.10478 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  53.57 
 
 
311 aa  308  8e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  58.67 
 
 
310 aa  308  8e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  54.4 
 
 
318 aa  308  9e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>