More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0149 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0149  cysteine synthase  100 
 
 		 306 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  55.81 
 
 		 308 aa  301  1e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  56.27 
 
 		 309 aa  296  4e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  51.33 
 
 		 311 aa  294  1e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  54.43 
 
 		 308 aa  294  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2658  cysteine synthase  56.11 
 
 		 310 aa  293  2e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.556672 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  49.34 
 
 		 311 aa  294  2e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09450  cysteine synthase  53.59 
 
 		 311 aa  291  7e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.424611  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  52.84 
 
 		 310 aa  291  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  48.16 
 
 		 304 aa  290  3e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  47.04 
 
 		 304 aa  286  2e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  52.84 
 
 		 309 aa  286  2.9999999999999996e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  51.14 
 
 		 309 aa  285  8e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  49.01 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  50.5 
 
 		 305 aa  283  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  50.17 
 
 		 312 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  52.81 
 
 		 320 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  52.51 
 
 		 309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  53 
 
 		 309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  46.67 
 
 		 310 aa  283  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  51.97 
 
 		 308 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  52.13 
 
 		 310 aa  282  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  46.53 
 
 		 310 aa  282  5.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  51.16 
 
 		 303 aa  282  5.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  46.53 
 
 		 310 aa  282  5.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3080  cysteine synthase  54.82 
 
 		 309 aa  281  7.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  52.84 
 
 		 306 aa  281  9e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  49.84 
 
 		 318 aa  281  9e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  47.18 
 
 		 304 aa  281  9e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  46.13 
 
 		 310 aa  281  1e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  51.99 
 
 		 327 aa  280  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  49.83 
 
 		 312 aa  280  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  51.16 
 
 		 320 aa  280  3e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  47.39 
 
 		 309 aa  278  1e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  49 
 
 		 309 aa  277  2e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  48.53 
 
 		 310 aa  276  4e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1301  cysteine synthase A  50 
 
 		 309 aa  275  5e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.568697 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  48.03 
 
 		 311 aa  275  5e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  53.67 
 
 		 309 aa  275  5e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  51.32 
 
 		 320 aa  275  8e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  48.17 
 
 		 307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  47.47 
 
 		 304 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  53.18 
 
 		 306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  51.66 
 
 		 327 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  49.5 
 
 		 305 aa  272  6e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  46.53 
 
 		 306 aa  271  7e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  50 
 
 		 311 aa  271  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  49.01 
 
 		 309 aa  271  1e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  49.19 
 
 		 316 aa  271  1e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0865  cysteine synthase  49.83 
 
 		 306 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  49.17 
 
 		 308 aa  270  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  50.51 
 
 		 317 aa  270  2e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  51.32 
 
 		 324 aa  270  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  50.17 
 
 		 311 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  48.49 
 
 		 305 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  50.84 
 
 		 317 aa  269  4e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  53.47 
 
 		 309 aa  269  5e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  49.02 
 
 		 311 aa  269  5e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0913  cysteine synthase A  51.32 
 
 		 325 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  48.18 
 
 		 308 aa  268  7e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0162  cysteine synthase  51.35 
 
 		 305 aa  268  8e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  49.67 
 
 		 311 aa  268  8.999999999999999e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  51.48 
 
 		 307 aa  268  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  48.49 
 
 		 305 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1210  cysteine synthase  50.17 
 
 		 305 aa  267  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.473529  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  50.99 
 
 		 326 aa  268  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  51.02 
 
 		 290 aa  268  1e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  50.99 
 
 		 326 aa  268  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6440  cysteine synthase A  47.18 
 
 		 305 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  51.32 
 
 		 309 aa  267  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  45.75 
 
 		 307 aa  267  2e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3593  cysteine synthase  52.82 
 
 		 309 aa  267  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4297  cysteine synthase  47.51 
 
 		 321 aa  266  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  51.02 
 
 		 291 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  51.15 
 
 		 309 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6147  cysteine synthase A  46.84 
 
 		 305 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  50.5 
 
 		 309 aa  265  8e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  47.23 
 
 		 309 aa  264  1e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  50.5 
 
 		 307 aa  264  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  48.37 
 
 		 311 aa  264  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  48.51 
 
 		 309 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  49.67 
 
 		 322 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  50.34 
 
 		 311 aa  263  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  49.5 
 
 		 305 aa  263  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0178  cysteine synthase A  50 
 
 		 331 aa  263  3e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  48.51 
 
 		 309 aa  262  4e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  49.67 
 
 		 306 aa  263  4e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  47.71 
 
 		 311 aa  263  4e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  48.84 
 
 		 308 aa  262  6.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  47.16 
 
 		 307 aa  261  8e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3006  cysteine synthase A  46.84 
 
 		 305 aa  260  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.599463  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  50.65 
 
 		 311 aa  260  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  51.52 
 
 		 327 aa  260  2e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  46 
 
 		 302 aa  260  2e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  49.34 
 
 		 309 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3723  cysteine synthase  46.84 
 
 		 305 aa  260  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0952  cysteine synthase  47.71 
 
 		 311 aa  259  4e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.820864  normal  0.859633 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  47.52 
 
 		 311 aa  259  5.0000000000000005e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  46.67 
 
 		 306 aa  258  6e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  49.35 
 
 		 317 aa  257  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>