More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0952 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0952  cysteine synthase  100 
 
 		 311 aa  615  1e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.820864  normal  0.859633 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  79.74 
 
 		 311 aa  481  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  79.42 
 
 		 311 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  78.46 
 
 		 311 aa  459  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  78.46 
 
 		 311 aa  456  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1111  cysteine synthase A  77.81 
 
 		 311 aa  456  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0492008  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  75 
 
 		 309 aa  440  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  69.58 
 
 		 311 aa  421  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  69.26 
 
 		 311 aa  418  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  69.81 
 
 		 309 aa  411  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  64.4 
 
 		 310 aa  379  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  64.61 
 
 		 309 aa  379  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  66.02 
 
 		 311 aa  373  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09450  cysteine synthase  61.49 
 
 		 311 aa  369  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.424611  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  59.93 
 
 		 309 aa  364  1e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  65.05 
 
 		 310 aa  363  2e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  60.71 
 
 		 310 aa  363  2e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  62.26 
 
 		 322 aa  362  6e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  60 
 
 		 330 aa  360  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  61.54 
 
 		 319 aa  358  8e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  62.38 
 
 		 320 aa  357  1.9999999999999998e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  60.26 
 
 		 313 aa  355  5e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  59.28 
 
 		 308 aa  355  7.999999999999999e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  59.03 
 
 		 320 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  57.79 
 
 		 308 aa  348  8e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  56.13 
 
 		 311 aa  347  2e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  56.86 
 
 		 309 aa  345  6e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  58.39 
 
 		 323 aa  344  8e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  60.59 
 
 		 309 aa  343  2.9999999999999997e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  57.7 
 
 		 308 aa  342  4e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  56.03 
 
 		 309 aa  342  5e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  59.55 
 
 		 320 aa  342  7e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  58.06 
 
 		 320 aa  341  7e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  57.74 
 
 		 320 aa  341  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  55.7 
 
 		 309 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  56.07 
 
 		 311 aa  340  2e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  58.82 
 
 		 327 aa  340  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  56.77 
 
 		 308 aa  340  2e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  58.42 
 
 		 311 aa  338  5e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  59.68 
 
 		 320 aa  338  5e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  56.77 
 
 		 329 aa  338  8e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  55.05 
 
 		 309 aa  337  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  59.87 
 
 		 309 aa  338  9.999999999999999e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  57.89 
 
 		 311 aa  337  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  57.61 
 
 		 328 aa  337  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  58.82 
 
 		 309 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  58.44 
 
 		 316 aa  337  9.999999999999999e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  57.57 
 
 		 311 aa  336  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  57.84 
 
 		 327 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  52.58 
 
 		 311 aa  335  5.999999999999999e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  54.13 
 
 		 310 aa  335  7e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  56.07 
 
 		 309 aa  335  7e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  60.91 
 
 		 309 aa  334  1e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  60 
 
 		 322 aa  333  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  60.59 
 
 		 309 aa  333  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  57.47 
 
 		 317 aa  332  3e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  55.88 
 
 		 339 aa  333  3e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2658  cysteine synthase  56.82 
 
 		 310 aa  333  3e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.556672 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  54 
 
 		 312 aa  332  5e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  54.18 
 
 		 312 aa  331  1e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4340  cysteine synthase A  59.68 
 
 		 320 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.899822 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  52.48 
 
 		 310 aa  330  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  52.48 
 
 		 310 aa  330  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  58.22 
 
 		 311 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  56.78 
 
 		 317 aa  330  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1502  cysteine synthase A  59.35 
 
 		 321 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18267e-17 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  56.91 
 
 		 311 aa  329  3e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  56.96 
 
 		 314 aa  330  3e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0075  cysteine synthase A  58.25 
 
 		 328 aa  329  3e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  56.82 
 
 		 309 aa  329  4e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  56.49 
 
 		 310 aa  329  4e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  52.94 
 
 		 311 aa  329  4e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  55.37 
 
 		 309 aa  328  8e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  56.86 
 
 		 326 aa  328  9e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  56.86 
 
 		 326 aa  328  9e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  56.77 
 
 		 310 aa  327  1.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4605  cysteine synthase A  58.39 
 
 		 320 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  58.63 
 
 		 310 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  55.08 
 
 		 308 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  53.05 
 
 		 327 aa  327  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  54.9 
 
 		 308 aa  326  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  56.03 
 
 		 309 aa  325  5e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0913  cysteine synthase A  56.54 
 
 		 325 aa  325  5e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1893  cysteine synthase A  60 
 
 		 327 aa  324  1e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.480284  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  55.74 
 
 		 320 aa  323  2e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  57.33 
 
 		 309 aa  323  2e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  52.58 
 
 		 310 aa  323  3e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  55.7 
 
 		 309 aa  323  3e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  54.61 
 
 		 310 aa  322  4e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  55.23 
 
 		 324 aa  322  5e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1015  cysteine synthase A  60 
 
 		 328 aa  322  7e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0559  cysteine synthase A  57.84 
 
 		 332 aa  321  8e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.770107  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  57.24 
 
 		 307 aa  321  8e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  56.54 
 
 		 308 aa  321  8e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1476  cysteine synthase A  54.92 
 
 		 324 aa  321  9.000000000000001e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0477  cysteine synthase  57.52 
 
 		 332 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3068  cysteine synthase A  53.16 
 
 		 316 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1832  cysteine synthase A  55.41 
 
 		 317 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.118091  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  54.05 
 
 		 308 aa  319  3e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  54.22 
 
 		 309 aa  318  5e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>