More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2658 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2658  cysteine synthase  100 
 
 		 310 aa  614  1e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.556672 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  76.72 
 
 		 308 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3080  cysteine synthase  75.49 
 
 		 309 aa  431  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  60.46 
 
 		 312 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  64.26 
 
 		 309 aa  369  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  60.26 
 
 		 311 aa  367  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  58.82 
 
 		 312 aa  358  4e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  58.44 
 
 		 311 aa  357  9.999999999999999e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  60.46 
 
 		 311 aa  357  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  60.97 
 
 		 309 aa  353  2e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  60.71 
 
 		 311 aa  352  4e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  58.82 
 
 		 311 aa  350  3e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  58.44 
 
 		 311 aa  349  3e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  55.7 
 
 		 307 aa  348  7e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  62.26 
 
 		 309 aa  348  7e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  57.79 
 
 		 311 aa  348  8e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  60.32 
 
 		 310 aa  347  1e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  57.74 
 
 		 310 aa  347  1e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  60.32 
 
 		 310 aa  347  2e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  58.06 
 
 		 309 aa  346  2e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  56.96 
 
 		 327 aa  346  4e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  59.28 
 
 		 318 aa  345  6e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  61.84 
 
 		 309 aa  345  6e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  54.72 
 
 		 307 aa  344  1e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  57.28 
 
 		 311 aa  343  2e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  60.26 
 
 		 309 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  58.63 
 
 		 310 aa  343  2e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  59.22 
 
 		 309 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  59.93 
 
 		 308 aa  342  2.9999999999999997e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  56.17 
 
 		 311 aa  342  5.999999999999999e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  60.06 
 
 		 309 aa  342  5.999999999999999e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  59.94 
 
 		 320 aa  342  5.999999999999999e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1111  cysteine synthase A  59.74 
 
 		 311 aa  341  1e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0492008  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  58.15 
 
 		 320 aa  341  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  64.05 
 
 		 309 aa  340  2e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  59.74 
 
 		 309 aa  339  4e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  58.79 
 
 		 319 aa  339  4e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  59.08 
 
 		 308 aa  339  4e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  60.84 
 
 		 311 aa  338  5e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  56.29 
 
 		 309 aa  338  5e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  58.06 
 
 		 320 aa  338  5e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  60.65 
 
 		 311 aa  338  5.9999999999999996e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  60.33 
 
 		 309 aa  338  9e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  60.52 
 
 		 311 aa  337  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  58.52 
 
 		 320 aa  337  9.999999999999999e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  59.74 
 
 		 309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  59.09 
 
 		 310 aa  336  2.9999999999999997e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  55.41 
 
 		 304 aa  336  2.9999999999999997e-91  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  59.74 
 
 		 311 aa  335  5.999999999999999e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  57.19 
 
 		 330 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  58.84 
 
 		 320 aa  333  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  55.59 
 
 		 320 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  56.91 
 
 		 313 aa  332  5e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  60 
 
 		 314 aa  332  6e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  59.6 
 
 		 309 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  56.91 
 
 		 323 aa  331  9e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  57 
 
 		 320 aa  331  1e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  57.89 
 
 		 308 aa  330  2e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1502  cysteine synthase A  58.84 
 
 		 321 aa  329  4e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18267e-17 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  58.61 
 
 		 324 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  61.76 
 
 		 309 aa  328  6e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  58.25 
 
 		 322 aa  328  6e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0952  cysteine synthase  56.82 
 
 		 311 aa  328  6e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.820864  normal  0.859633 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  59.87 
 
 		 311 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  59.93 
 
 		 309 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  56.96 
 
 		 309 aa  327  2.0000000000000001e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  62.3 
 
 		 306 aa  326  3e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  57.05 
 
 		 308 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  59.48 
 
 		 308 aa  326  4.0000000000000003e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  55.33 
 
 		 320 aa  325  5e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  57.38 
 
 		 309 aa  325  5e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0149  cysteine synthase  56.11 
 
 		 306 aa  325  5e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  61.76 
 
 		 309 aa  325  5e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  56.68 
 
 		 308 aa  325  7e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  55.74 
 
 		 317 aa  325  8.000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  58.25 
 
 		 311 aa  324  9e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  52.79 
 
 		 304 aa  324  1e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4407  cysteine synthase A  57.61 
 
 		 328 aa  324  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119856 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  61.51 
 
 		 309 aa  324  1e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  59.66 
 
 		 308 aa  323  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  55.67 
 
 		 320 aa  323  3e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26311  O-acetylserine (thiol)-lyase A  61.17 
 
 		 328 aa  323  3e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01951  O-acetylserine (thiol)-lyase A  58.01 
 
 		 322 aa  323  3e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.958038  normal  0.621094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  58.94 
 
 		 327 aa  323  3e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  57.33 
 
 		 316 aa  323  3e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  58.36 
 
 		 309 aa  322  5e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  58.94 
 
 		 327 aa  322  5e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1490  cysteine synthase  58.01 
 
 		 322 aa  322  7e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1466  cysteine synthase  59.68 
 
 		 334 aa  321  8e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00108529  normal  0.10478 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26961  O-acetylserinethiol lyase/cysteine synthase  58.9 
 
 		 305 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0325  cysteine synthase K/M/A  60.19 
 
 		 322 aa  319  3e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  58.47 
 
 		 326 aa  320  3e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  58.47 
 
 		 326 aa  320  3e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  56.35 
 
 		 310 aa  318  5e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  55.22 
 
 		 304 aa  318  1e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  56.72 
 
 		 305 aa  317  2e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  56.63 
 
 		 309 aa  317  2e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0913  cysteine synthase A  58.8 
 
 		 325 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  54.55 
 
 		 339 aa  316  4e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  57.74 
 
 		 310 aa  315  4e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>