More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1466 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1466  cysteine synthase  100 
 
 		 334 aa  671    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00108529  normal  0.10478 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  79.17 
 
 		 320 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  80.77 
 
 		 320 aa  482  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  78.39 
 
 		 320 aa  478  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1502  cysteine synthase A  79.56 
 
 		 321 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18267e-17 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  77.74 
 
 		 319 aa  476  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  76.6 
 
 		 320 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  75.48 
 
 		 313 aa  462  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0433  cysteine synthase A  78.44 
 
 		 320 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0444  cysteine synthase A  78.44 
 
 		 320 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00894315 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  72.33 
 
 		 320 aa  456  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  76.11 
 
 		 330 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  75.24 
 
 		 320 aa  456  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  67.74 
 
 		 310 aa  394  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  67.86 
 
 		 322 aa  394  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26311  O-acetylserine (thiol)-lyase A  67.7 
 
 		 328 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01381  O-acetylserine (thiol)-lyase A  65.7 
 
 		 322 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  66.35 
 
 		 310 aa  385  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  66.77 
 
 		 311 aa  384  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  62.46 
 
 		 311 aa  386  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  65.48 
 
 		 309 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0325  cysteine synthase K/M/A  66.88 
 
 		 322 aa  382  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  67.31 
 
 		 309 aa  384  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  66.45 
 
 		 311 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  67.31 
 
 		 323 aa  383  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  66.88 
 
 		 309 aa  381  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1490  cysteine synthase  66.23 
 
 		 322 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01951  O-acetylserine (thiol)-lyase A  65.91 
 
 		 322 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.958038  normal  0.621094 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  64.19 
 
 		 309 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  66.45 
 
 		 311 aa  373  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  63.55 
 
 		 309 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  66.02 
 
 		 309 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  63.87 
 
 		 309 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  66.77 
 
 		 311 aa  371  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  67.31 
 
 		 309 aa  372  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  63.55 
 
 		 339 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  63.43 
 
 		 308 aa  368  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  64.61 
 
 		 309 aa  368  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  66.23 
 
 		 309 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  62.34 
 
 		 317 aa  365  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  64.4 
 
 		 309 aa  365  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  64.61 
 
 		 310 aa  364  1e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  62.06 
 
 		 317 aa  363  2e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  65.91 
 
 		 309 aa  362  3e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  58.71 
 
 		 311 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2647  cysteine synthase A  65.48 
 
 		 310 aa  362  6e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.100926  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  63.43 
 
 		 308 aa  361  9e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01371  O-acetylserine (thiol)-lyase A  61.25 
 
 		 322 aa  361  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.225049  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  63.43 
 
 		 309 aa  361  1e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  61.81 
 
 		 311 aa  360  2e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  62.01 
 
 		 322 aa  358  9e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  61.17 
 
 		 311 aa  358  9e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  59.49 
 
 		 311 aa  358  9e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  61.41 
 
 		 311 aa  357  9.999999999999999e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  62.94 
 
 		 310 aa  357  9.999999999999999e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  61.56 
 
 		 311 aa  358  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  61.69 
 
 		 308 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  64.17 
 
 		 322 aa  357  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  61.56 
 
 		 308 aa  356  3.9999999999999996e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  61.49 
 
 		 329 aa  355  7.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01401  O-acetylserine (thiol)-lyase A  60.62 
 
 		 322 aa  355  7.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.171257  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  64.29 
 
 		 308 aa  355  7.999999999999999e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  61.29 
 
 		 308 aa  354  1e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  60.83 
 
 		 327 aa  353  2e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0126  cysteine synthase  60.62 
 
 		 322 aa  353  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.809486  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  59.55 
 
 		 311 aa  352  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  62.26 
 
 		 308 aa  352  5e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4605  cysteine synthase A  62.99 
 
 		 320 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  62.14 
 
 		 309 aa  351  8e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01411  O-acetylserine (thiol)-lyase A  59.69 
 
 		 322 aa  351  8.999999999999999e-96  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.652512  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  59.03 
 
 		 318 aa  350  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  62.14 
 
 		 311 aa  350  2e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4340  cysteine synthase A  63.96 
 
 		 320 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.899822 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  60.84 
 
 		 311 aa  350  3e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  63.11 
 
 		 311 aa  349  4e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  59.35 
 
 		 310 aa  348  5e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  61.04 
 
 		 317 aa  348  6e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0452  cysteine synthases  65.7 
 
 		 308 aa  348  8e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  61.41 
 
 		 316 aa  348  8e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  61.49 
 
 		 316 aa  348  8e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  57.14 
 
 		 312 aa  348  1e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  60.39 
 
 		 309 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  60 
 
 		 309 aa  344  1e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  57.79 
 
 		 304 aa  343  2e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  55.99 
 
 		 312 aa  343  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  58.9 
 
 		 309 aa  342  5e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  57.61 
 
 		 311 aa  342  5.999999999999999e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  58.58 
 
 		 327 aa  342  8e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3653  cysteine synthase A  61.04 
 
 		 319 aa  341  1e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528018  hitchhiker  1.6930700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  56.73 
 
 		 307 aa  340  2e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  56.96 
 
 		 310 aa  340  2e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0556  cysteine synthases  60.39 
 
 		 323 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523099  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  58.62 
 
 		 324 aa  339  5e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  58.75 
 
 		 320 aa  338  5.9999999999999996e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  59.11 
 
 		 310 aa  338  5.9999999999999996e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  61.69 
 
 		 327 aa  338  7e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  61.69 
 
 		 327 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  56.23 
 
 		 320 aa  335  7e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  58.12 
 
 		 308 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  60.32 
 
 		 314 aa  334  1e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>