More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1490 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_01951  O-acetylserine (thiol)-lyase A  98.45 
 
 		 322 aa  647    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.958038  normal  0.621094 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1490  cysteine synthase  100 
 
 		 322 aa  656    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01381  O-acetylserine (thiol)-lyase A  75.16 
 
 		 322 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26311  O-acetylserine (thiol)-lyase A  73.29 
 
 		 328 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  69.25 
 
 		 322 aa  444  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0325  cysteine synthase K/M/A  70.98 
 
 		 322 aa  427  1e-118  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01371  O-acetylserine (thiol)-lyase A  66.77 
 
 		 322 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.225049  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  65.26 
 
 		 320 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  64.95 
 
 		 319 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01401  O-acetylserine (thiol)-lyase A  66.46 
 
 		 322 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.171257  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0126  cysteine synthase  66.77 
 
 		 322 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.809486  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  64.47 
 
 		 320 aa  395  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  63.14 
 
 		 330 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  63.67 
 
 		 313 aa  391  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01411  O-acetylserine (thiol)-lyase A  65.84 
 
 		 322 aa  391  1e-108  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.652512  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  62.66 
 
 		 320 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1502  cysteine synthase A  65.19 
 
 		 321 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18267e-17 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  64.74 
 
 		 320 aa  382  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  63.69 
 
 		 320 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  61.09 
 
 		 320 aa  375  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1466  cysteine synthase  66.23 
 
 		 334 aa  370  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00108529  normal  0.10478 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0444  cysteine synthase A  63.67 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00894315 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0433  cysteine synthase A  63.67 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  59.49 
 
 		 310 aa  352  4e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  57.84 
 
 		 312 aa  349  3e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  57.52 
 
 		 312 aa  348  6e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  60.46 
 
 		 309 aa  348  7e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  61.41 
 
 		 323 aa  348  8e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  58.2 
 
 		 310 aa  348  1e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  56.49 
 
 		 311 aa  348  1e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  55.88 
 
 		 311 aa  347  2e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  59.22 
 
 		 327 aa  346  4e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  57.83 
 
 		 311 aa  345  8e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  57.51 
 
 		 311 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  58.82 
 
 		 317 aa  343  2e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  58.84 
 
 		 309 aa  343  2e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  59.87 
 
 		 322 aa  343  2.9999999999999997e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  60.13 
 
 		 309 aa  342  4e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  58.96 
 
 		 308 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  58.5 
 
 		 308 aa  338  5.9999999999999996e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  55.95 
 
 		 309 aa  338  8e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  56.59 
 
 		 322 aa  338  9e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  58.79 
 
 		 311 aa  337  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  58.69 
 
 		 327 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  57.84 
 
 		 339 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  55.84 
 
 		 309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  59.49 
 
 		 311 aa  335  3.9999999999999995e-91  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  57.74 
 
 		 308 aa  336  3.9999999999999995e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  55.63 
 
 		 309 aa  335  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  57.84 
 
 		 329 aa  335  5e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  59.09 
 
 		 309 aa  335  5e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  55.63 
 
 		 309 aa  335  5e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  57.76 
 
 		 320 aa  335  7.999999999999999e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  58.77 
 
 		 309 aa  334  1e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  56.96 
 
 		 310 aa  333  3e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  57.61 
 
 		 324 aa  332  6e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4340  cysteine synthase A  59.48 
 
 		 320 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.899822 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  56.77 
 
 		 320 aa  331  1e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  58.17 
 
 		 309 aa  331  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4605  cysteine synthase A  58.5 
 
 		 320 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  58.63 
 
 		 309 aa  330  2e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  57.19 
 
 		 311 aa  330  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  57.61 
 
 		 326 aa  330  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  57.61 
 
 		 326 aa  330  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  57.14 
 
 		 309 aa  330  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2647  cysteine synthase A  59.74 
 
 		 310 aa  329  3e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.100926  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  57.19 
 
 		 317 aa  328  8e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2658  cysteine synthase  58.01 
 
 		 310 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.556672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0913  cysteine synthase A  57.28 
 
 		 325 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  55.66 
 
 		 311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  52.92 
 
 		 311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  54.4 
 
 		 310 aa  325  4.0000000000000003e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  53.25 
 
 		 304 aa  325  5e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  56.91 
 
 		 310 aa  325  6e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  55.19 
 
 		 318 aa  325  6e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  57.84 
 
 		 309 aa  325  9e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  53.72 
 
 		 311 aa  324  1e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  55.52 
 
 		 308 aa  324  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  57.61 
 
 		 309 aa  324  1e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0178  cysteine synthase A  57.19 
 
 		 331 aa  324  1e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  55.02 
 
 		 311 aa  324  1e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  55.02 
 
 		 311 aa  323  2e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  53.57 
 
 		 309 aa  323  2e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26961  O-acetylserinethiol lyase/cysteine synthase  57.77 
 
 		 305 aa  323  2e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  55.77 
 
 		 309 aa  322  4e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  55.34 
 
 		 311 aa  322  4e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  55.81 
 
 		 308 aa  322  5e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  57.76 
 
 		 311 aa  322  5e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  55.34 
 
 		 311 aa  322  6e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0559  cysteine synthase A  58.67 
 
 		 332 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.770107  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0075  cysteine synthase A  57.52 
 
 		 328 aa  321  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0343  cysteine synthase A  58.58 
 
 		 332 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.516891  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  52.94 
 
 		 328 aa  321  9.999999999999999e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0452  cysteine synthases  57.98 
 
 		 308 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0556  cysteine synthases  54.05 
 
 		 323 aa  321  9.999999999999999e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523099  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  54.55 
 
 		 308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  55.77 
 
 		 309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0477  cysteine synthase  57.28 
 
 		 332 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3653  cysteine synthase A  57.19 
 
 		 319 aa  320  3e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528018  hitchhiker  1.6930700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  55.52 
 
 		 308 aa  319  3e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>