More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0325 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0325  cysteine synthase K/M/A  100 
 
 
322 aa  641    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  84.47 
 
 
322 aa  525  1e-148  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26311  O-acetylserine (thiol)-lyase A  79.5 
 
 
328 aa  468  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01381  O-acetylserine (thiol)-lyase A  69.88 
 
 
322 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1490  cysteine synthase  70.66 
 
 
322 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01951  O-acetylserine (thiol)-lyase A  70.03 
 
 
322 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.958038  normal  0.621094 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  66.56 
 
 
319 aa  400  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  66.56 
 
 
320 aa  395  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  65.58 
 
 
320 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  65.58 
 
 
313 aa  389  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  62.9 
 
 
320 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1502  cysteine synthase A  65.26 
 
 
321 aa  381  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18267e-17 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1466  cysteine synthase  66.88 
 
 
334 aa  382  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00108529  normal  0.10478 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  64.61 
 
 
320 aa  383  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  66.23 
 
 
320 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01371  O-acetylserine (thiol)-lyase A  62.11 
 
 
322 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.225049  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  62.78 
 
 
330 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01401  O-acetylserine (thiol)-lyase A  61.8 
 
 
322 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.171257  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0444  cysteine synthase A  65.58 
 
 
320 aa  368  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00894315 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0433  cysteine synthase A  65.58 
 
 
320 aa  368  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  63.73 
 
 
311 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01411  O-acetylserine (thiol)-lyase A  60.56 
 
 
322 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.652512  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  62.14 
 
 
320 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0126  cysteine synthase  60.87 
 
 
322 aa  364  1e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.809486  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  63.55 
 
 
310 aa  360  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  63.75 
 
 
310 aa  360  2e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  63.73 
 
 
309 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  58.82 
 
 
311 aa  357  9.999999999999999e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  58.31 
 
 
312 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  65.15 
 
 
309 aa  356  2.9999999999999997e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  58.31 
 
 
312 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  64.84 
 
 
309 aa  355  7.999999999999999e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  62.54 
 
 
308 aa  348  8e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  60.59 
 
 
322 aa  347  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  60.39 
 
 
323 aa  347  2e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  62.66 
 
 
309 aa  347  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  63.75 
 
 
311 aa  346  3e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  62.42 
 
 
309 aa  345  5e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  61.18 
 
 
339 aa  345  7e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  58.39 
 
 
310 aa  344  1e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  59.15 
 
 
322 aa  344  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  62.01 
 
 
308 aa  344  1e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  61.76 
 
 
327 aa  344  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  61.56 
 
 
309 aa  343  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  62.01 
 
 
309 aa  343  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  60.78 
 
 
316 aa  343  2e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  57.61 
 
 
311 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  61.76 
 
 
327 aa  342  4e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  60.78 
 
 
329 aa  342  5.999999999999999e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  60.26 
 
 
309 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  59.74 
 
 
309 aa  342  5.999999999999999e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  56.13 
 
 
311 aa  342  7e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  59.61 
 
 
308 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  60.91 
 
 
309 aa  339  4e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  58.9 
 
 
308 aa  338  7e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  58.58 
 
 
317 aa  337  9.999999999999999e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  60.71 
 
 
311 aa  337  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  57.14 
 
 
310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  60.39 
 
 
309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  60.71 
 
 
309 aa  336  2.9999999999999997e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  59.22 
 
 
308 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  60.39 
 
 
311 aa  336  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0556  cysteine synthases  59.8 
 
 
323 aa  335  3.9999999999999995e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523099  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  61.04 
 
 
309 aa  335  5e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  57.33 
 
 
327 aa  335  5e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  59.8 
 
 
324 aa  335  7e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  61.04 
 
 
309 aa  335  7e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0075  cysteine synthase A  63.25 
 
 
328 aa  335  7.999999999999999e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  57.14 
 
 
304 aa  334  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  58.96 
 
 
311 aa  334  1e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  56.86 
 
 
310 aa  333  2e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  58.96 
 
 
311 aa  333  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  60.13 
 
 
327 aa  333  2e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  56.86 
 
 
310 aa  333  2e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  61.56 
 
 
311 aa  333  3e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  61.49 
 
 
310 aa  333  3e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  57.98 
 
 
311 aa  333  3e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  59.61 
 
 
311 aa  332  5e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  60.71 
 
 
309 aa  332  5e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4340  cysteine synthase A  57.84 
 
 
320 aa  332  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.899822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4605  cysteine synthase A  57.52 
 
 
320 aa  331  8e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  57.93 
 
 
311 aa  331  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  58.9 
 
 
308 aa  330  1e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  57.43 
 
 
320 aa  330  2e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  56.63 
 
 
309 aa  330  2e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0559  cysteine synthase A  63.3 
 
 
332 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.770107  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  57.93 
 
 
308 aa  330  3e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  57.1 
 
 
320 aa  329  4e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  57 
 
 
311 aa  329  5.0000000000000004e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2658  cysteine synthase  60.19 
 
 
310 aa  328  7e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.556672 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  59.87 
 
 
309 aa  328  8e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  56.35 
 
 
311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  59.09 
 
 
309 aa  326  3e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  55.41 
 
 
310 aa  326  3e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26961  O-acetylserinethiol lyase/cysteine synthase  58.16 
 
 
305 aa  326  3e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  57.93 
 
 
318 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0477  cysteine synthase  62.96 
 
 
332 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3080  cysteine synthase  59.22 
 
 
309 aa  325  5e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  56.54 
 
 
317 aa  325  6e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  54.58 
 
 
310 aa  325  7e-88  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>