More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0343 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0343  cysteine synthase A  100 
 
 		 332 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.516891  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0477  cysteine synthase  93.98 
 
 		 332 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0559  cysteine synthase A  90.66 
 
 		 332 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.770107  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4360  cysteine synthase  83.02 
 
 		 322 aa  493  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2594  cysteine synthase A  81.5 
 
 		 326 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.125918  normal  0.194019 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1773  cysteine synthases  77.53 
 
 		 325 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0075  cysteine synthase A  74.92 
 
 		 328 aa  448  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  72.73 
 
 		 329 aa  441  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1794  cysteine synthase  77.46 
 
 		 325 aa  441  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  unclonable  0.00000000492441  normal  0.123745 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  70.03 
 
 		 322 aa  435  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  69.16 
 
 		 327 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  66.87 
 
 		 327 aa  430  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0178  cysteine synthase A  71.52 
 
 		 331 aa  426  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  67.08 
 
 		 328 aa  418  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  67.07 
 
 		 339 aa  418  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  69.4 
 
 		 322 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  67.92 
 
 		 324 aa  411  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3653  cysteine synthase A  70.25 
 
 		 319 aa  413  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528018  hitchhiker  1.6930700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  66.15 
 
 		 326 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  66.15 
 
 		 326 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4605  cysteine synthase A  68.14 
 
 		 320 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  65.8 
 
 		 311 aa  403  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  66.77 
 
 		 316 aa  403  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0913  cysteine synthase A  64.81 
 
 		 325 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4340  cysteine synthase A  67.51 
 
 		 320 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.899822 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1015  cysteine synthase A  69.01 
 
 		 328 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1893  cysteine synthase A  67.82 
 
 		 327 aa  391  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.480284  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  62.21 
 
 		 311 aa  382  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  65.35 
 
 		 311 aa  382  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  67.1 
 
 		 309 aa  374  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  63.55 
 
 		 330 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  63.55 
 
 		 319 aa  373  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  62.87 
 
 		 317 aa  371  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  62.46 
 
 		 309 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  66.34 
 
 		 310 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  62.54 
 
 		 309 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  64.71 
 
 		 311 aa  368  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  62.78 
 
 		 309 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  66.88 
 
 		 309 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  63.28 
 
 		 308 aa  364  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  61.81 
 
 		 309 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  63.43 
 
 		 327 aa  367  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  62.75 
 
 		 308 aa  364  1e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  65.15 
 
 		 311 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  66.12 
 
 		 309 aa  362  3e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  62.42 
 
 		 311 aa  362  4e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  64.82 
 
 		 311 aa  362  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  62.87 
 
 		 317 aa  360  2e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  60.84 
 
 		 311 aa  360  2e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  66.12 
 
 		 309 aa  360  2e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  63.28 
 
 		 308 aa  360  3e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4407  cysteine synthase A  65.36 
 
 		 328 aa  359  3e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119856 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  62.34 
 
 		 320 aa  359  4e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  58.17 
 
 		 311 aa  358  6e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  62.01 
 
 		 313 aa  358  6e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  63.19 
 
 		 310 aa  358  6e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  62.75 
 
 		 308 aa  358  9e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  62.46 
 
 		 320 aa  357  9.999999999999999e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  62.21 
 
 		 308 aa  357  1.9999999999999998e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  62.01 
 
 		 310 aa  356  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  61.17 
 
 		 309 aa  355  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  63.11 
 
 		 308 aa  355  5e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  63.84 
 
 		 309 aa  355  5e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  61.89 
 
 		 309 aa  355  5e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  61.04 
 
 		 309 aa  354  1e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  61.24 
 
 		 311 aa  353  2e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  62.3 
 
 		 309 aa  353  2e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  60.65 
 
 		 320 aa  353  2.9999999999999997e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0241  cysteine synthase  61.41 
 
 		 315 aa  352  4e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  59.55 
 
 		 311 aa  352  4e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  63.23 
 
 		 320 aa  352  5e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  61.76 
 
 		 310 aa  351  8e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  65.55 
 
 		 310 aa  351  1e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  62.21 
 
 		 309 aa  351  1e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  61.44 
 
 		 309 aa  350  2e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  61.69 
 
 		 309 aa  349  4e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  61.76 
 
 		 311 aa  348  6e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  59.8 
 
 		 310 aa  348  8e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  60.32 
 
 		 320 aa  348  9e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  64.5 
 
 		 311 aa  348  9e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  60.65 
 
 		 320 aa  348  9e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  62.09 
 
 		 311 aa  346  3e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  59.55 
 
 		 309 aa  345  5e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2177  cysteine synthase A  60.58 
 
 		 328 aa  343  2e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  61.89 
 
 		 327 aa  343  2e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  59.61 
 
 		 317 aa  343  2e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  60.97 
 
 		 308 aa  344  2e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0452  cysteine synthases  61.81 
 
 		 308 aa  343  2e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1502  cysteine synthase A  61.69 
 
 		 321 aa  342  7e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18267e-17 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2647  cysteine synthase A  63.19 
 
 		 310 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.100926  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  56.82 
 
 		 312 aa  341  1e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  60.91 
 
 		 314 aa  340  2e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  56.86 
 
 		 312 aa  339  4e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26961  O-acetylserinethiol lyase/cysteine synthase  65.2 
 
 		 305 aa  338  7e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0556  cysteine synthases  58.68 
 
 		 323 aa  338  7e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523099  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  61.44 
 
 		 311 aa  338  7e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  58.31 
 
 		 309 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  60.94 
 
 		 322 aa  336  2.9999999999999997e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  56.03 
 
 		 310 aa  336  3.9999999999999995e-91  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  57.84 
 
 		 318 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>