More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2776 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2776  cysteine synthase A  100 
 
 		 312 aa  634    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  60.33 
 
 		 311 aa  358  5e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  61.56 
 
 		 310 aa  351  1e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  58.88 
 
 		 311 aa  349  3e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  63.82 
 
 		 309 aa  347  1e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  60.39 
 
 		 339 aa  345  4e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  62.09 
 
 		 309 aa  343  2e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  61.97 
 
 		 309 aa  341  7e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  57 
 
 		 304 aa  341  1e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  58.39 
 
 		 328 aa  337  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  59.74 
 
 		 311 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  60.19 
 
 		 316 aa  337  1.9999999999999998e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  60.32 
 
 		 309 aa  336  3.9999999999999995e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  60.19 
 
 		 310 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  58.69 
 
 		 318 aa  334  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  57.79 
 
 		 310 aa  334  1e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  62.3 
 
 		 309 aa  334  1e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  61.44 
 
 		 311 aa  333  2e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  59.81 
 
 		 327 aa  332  3e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  56.81 
 
 		 307 aa  333  3e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  59.8 
 
 		 309 aa  332  4e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3653  cysteine synthase A  60.97 
 
 		 319 aa  330  1e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528018  hitchhiker  1.6930700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  59.93 
 
 		 308 aa  330  1e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  60.46 
 
 		 309 aa  328  5.0000000000000004e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  58.09 
 
 		 309 aa  328  5.0000000000000004e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  60.2 
 
 		 308 aa  328  8e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  55.08 
 
 		 307 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  59.74 
 
 		 311 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  60.77 
 
 		 329 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  60.78 
 
 		 308 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0075  cysteine synthase A  60.32 
 
 		 328 aa  326  3e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  58.69 
 
 		 309 aa  326  3e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  60.19 
 
 		 323 aa  325  5e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  57.1 
 
 		 310 aa  325  7e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  58.52 
 
 		 320 aa  325  8.000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3068  cysteine synthase A  56.59 
 
 		 316 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145676  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  60.45 
 
 		 320 aa  324  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  57.98 
 
 		 309 aa  324  1e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  57.74 
 
 		 320 aa  324  1e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0452  cysteine synthases  59.61 
 
 		 308 aa  323  2e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  58.71 
 
 		 324 aa  323  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  58.25 
 
 		 319 aa  323  3e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1832  cysteine synthase A  55.45 
 
 		 317 aa  322  4e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.118091  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  56.25 
 
 		 308 aa  322  5e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  58.28 
 
 		 317 aa  322  5e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  57.98 
 
 		 308 aa  322  5e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  55.45 
 
 		 310 aa  322  6e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  56.23 
 
 		 317 aa  322  6e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  55.45 
 
 		 310 aa  322  6e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  53.14 
 
 		 304 aa  322  6e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  54.13 
 
 		 311 aa  322  6e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  55.92 
 
 		 304 aa  322  7e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  55.59 
 
 		 312 aa  321  8e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  58.77 
 
 		 327 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  59.09 
 
 		 327 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  57 
 
 		 309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  58.12 
 
 		 326 aa  319  3e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  58.12 
 
 		 326 aa  319  3e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4605  cysteine synthase A  60.38 
 
 		 320 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  59.34 
 
 		 309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  57.95 
 
 		 309 aa  318  5e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  57.65 
 
 		 309 aa  318  5e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  58.2 
 
 		 322 aa  319  5e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  56.58 
 
 		 308 aa  318  6e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  58.12 
 
 		 320 aa  318  7.999999999999999e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0913  cysteine synthase A  58.44 
 
 		 325 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  58.25 
 
 		 330 aa  318  9e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  54.82 
 
 		 310 aa  317  1e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4340  cysteine synthase A  60.06 
 
 		 320 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.899822 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  58.5 
 
 		 310 aa  317  2e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  61.15 
 
 		 306 aa  317  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  55.7 
 
 		 309 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0178  cysteine synthase A  59.81 
 
 		 331 aa  316  3e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1476  cysteine synthase A  54.63 
 
 		 324 aa  316  3e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  58.28 
 
 		 317 aa  316  4e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  55.37 
 
 		 309 aa  316  4e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  60.13 
 
 		 322 aa  315  5e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  56.63 
 
 		 316 aa  315  5e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  56.82 
 
 		 309 aa  315  6e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  55.37 
 
 		 309 aa  315  9e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  58.69 
 
 		 309 aa  315  9e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  55.78 
 
 		 309 aa  314  9.999999999999999e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  54.25 
 
 		 312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  55.52 
 
 		 311 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  56.21 
 
 		 308 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  54.72 
 
 		 311 aa  312  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  56.59 
 
 		 320 aa  312  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1502  cysteine synthase A  57.56 
 
 		 321 aa  312  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18267e-17 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  57.42 
 
 		 327 aa  312  4.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  57.05 
 
 		 310 aa  312  4.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  57.1 
 
 		 307 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  57.84 
 
 		 311 aa  311  5.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  55.23 
 
 		 311 aa  311  6.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2903  cysteine synthase A  59.16 
 
 		 322 aa  311  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  55.99 
 
 		 320 aa  310  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  57.7 
 
 		 308 aa  311  1e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1111  cysteine synthase A  57.19 
 
 		 311 aa  310  2e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0492008  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0433  cysteine synthase A  59.03 
 
 		 320 aa  309  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0444  cysteine synthase A  59.03 
 
 		 320 aa  309  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00894315 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  56.17 
 
 		 309 aa  310  2.9999999999999997e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>