More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_02140 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_02140  cysteine synthase  100 
 
 		 317 aa  632  1e-180  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.445604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1832  cysteine synthase A  54.05 
 
 		 317 aa  290  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.118091  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3068  cysteine synthase A  52.29 
 
 		 316 aa  288  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145676  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  52.12 
 
 		 317 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  46.77 
 
 		 312 aa  277  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  46.77 
 
 		 310 aa  273  3e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1476  cysteine synthase A  49.35 
 
 		 324 aa  273  3e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  46.77 
 
 		 310 aa  271  8.000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  46.77 
 
 		 310 aa  271  8.000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  50.81 
 
 		 308 aa  270  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  48.71 
 
 		 305 aa  270  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  46.33 
 
 		 304 aa  269  4e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1210  cysteine synthase  49.36 
 
 		 305 aa  269  4e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.473529  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  49.35 
 
 		 305 aa  269  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  51.49 
 
 		 308 aa  269  5e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  48.71 
 
 		 305 aa  268  5.9999999999999995e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  45.48 
 
 		 312 aa  268  7e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2103  cysteine synthase  48.55 
 
 		 305 aa  268  7e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0401259  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  48.89 
 
 		 310 aa  268  8e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  49.19 
 
 		 304 aa  267  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  46.18 
 
 		 307 aa  265  7e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  47.91 
 
 		 306 aa  265  8.999999999999999e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2177  cysteine synthase A  50.16 
 
 		 328 aa  264  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  50.16 
 
 		 319 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  49.52 
 
 		 322 aa  264  2e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  48.43 
 
 		 320 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  47.21 
 
 		 311 aa  263  4e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  47.42 
 
 		 305 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  46.6 
 
 		 301 aa  262  6.999999999999999e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  48.2 
 
 		 310 aa  262  6.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2664  cysteine synthase  52.52 
 
 		 329 aa  261  8e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.211268  normal  0.363932 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0484  cysteine synthase A  47.73 
 
 		 324 aa  261  8e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.261567  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02314  cysteine synthase A, O-acetylserine sulfhydrolase A subunit  51.63 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000113698  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1247  cysteine synthase A  51.63 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000402338  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02275  hypothetical protein  51.63 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000749692  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0489  cysteine synthase A  52.1 
 
 		 322 aa  261  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000338281  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2569  cysteine synthase A  51.63 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00204709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1264  cysteine synthase A  51.63 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000422758  decreased coverage  0.000025009 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2766  cysteine synthase A  51.63 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163561  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2549  cysteine synthase A  51.63 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000853816  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  46.98 
 
 		 311 aa  261  1e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3645  cysteine synthase A  51.63 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00108358  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  49.03 
 
 		 320 aa  260  2e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2701  cysteine synthase A  51.31 
 
 		 323 aa  260  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000531344  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  49.52 
 
 		 320 aa  260  2e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0865  cysteine synthase  46.13 
 
 		 306 aa  259  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  48.7 
 
 		 307 aa  259  4e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004156  cysteine synthase  52.27 
 
 		 322 aa  259  4e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000187133  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  49.84 
 
 		 320 aa  259  5.0000000000000005e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  50.48 
 
 		 306 aa  259  6e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  43.95 
 
 		 304 aa  258  6e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  48.51 
 
 		 302 aa  258  7e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0556  cysteine synthases  49.04 
 
 		 323 aa  258  9e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523099  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  50.63 
 
 		 309 aa  258  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32850  Cysteine synthase K/M:Cysteine synthase K  49.51 
 
 		 325 aa  257  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2574  cysteine synthase A  50.65 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000179096  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  49.84 
 
 		 310 aa  257  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2665  cysteine synthase A  50.65 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1983  cysteine synthase A  51.79 
 
 		 317 aa  257  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000049928  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  48.39 
 
 		 309 aa  257  2e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2623  cysteine synthase A  50.65 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0860266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2689  cysteine synthase A  50.65 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  48.24 
 
 		 318 aa  256  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1734  cysteine synthase  49.17 
 
 		 301 aa  256  4e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.30022  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6147  cysteine synthase A  47.57 
 
 		 305 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  49.2 
 
 		 309 aa  255  7e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2795  cysteine synthase A  50.33 
 
 		 323 aa  255  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.774508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  48.25 
 
 		 330 aa  255  8e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6440  cysteine synthase A  47.9 
 
 		 305 aa  255  8e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  48.03 
 
 		 323 aa  254  9e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  49.04 
 
 		 307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0433  cysteine synthase A  49.21 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2942  cysteine synthase A  49.67 
 
 		 323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000452572  normal  0.122645 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  47.85 
 
 		 307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0444  cysteine synthase A  49.21 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00894315 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1790  cysteine synthase  49.68 
 
 		 323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.475157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  46.98 
 
 		 320 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  50 
 
 		 308 aa  254  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  46.77 
 
 		 306 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2658  cysteine synthase  48.56 
 
 		 310 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.556672 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0325  cysteine synthase K/M/A  51.11 
 
 		 322 aa  253  3e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  49.84 
 
 		 307 aa  253  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  45.16 
 
 		 306 aa  253  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01371  O-acetylserine (thiol)-lyase A  47.78 
 
 		 322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.225049  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  46.84 
 
 		 320 aa  253  4.0000000000000004e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  47.39 
 
 		 310 aa  252  5.000000000000001e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  49.68 
 
 		 320 aa  252  5.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  47.6 
 
 		 305 aa  252  6e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  47.15 
 
 		 323 aa  252  6e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  45.13 
 
 		 321 aa  252  6e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  43.23 
 
 		 304 aa  252  6e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  43.61 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3639  cysteine synthase A  50.16 
 
 		 325 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0668301  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01309  cysteine synthase A  52.27 
 
 		 322 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1467  cysteine synthase  50.65 
 
 		 323 aa  251  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0369  cysteine synthase  46.1 
 
 		 316 aa  251  1e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.425105  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  48.18 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21201  O-acetylserine (thiol)-lyase A  51.13 
 
 		 328 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.872322 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  48.72 
 
 		 339 aa  250  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1502  cysteine synthase A  48.89 
 
 		 321 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18267e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>