More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1674 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1674  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 
324 aa  643    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2995  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  86.2 
 
 
327 aa  535  1e-151  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.511755  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0509  cysteine synthase  70.15 
 
 
302 aa  432  1e-120  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.445859  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2310  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  63.3 
 
 
308 aa  373  1e-102  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.775083 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1358  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  62.15 
 
 
305 aa  362  3e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.695081  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  47.4 
 
 
310 aa  258  1e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  44.55 
 
 
310 aa  252  6e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  44.55 
 
 
310 aa  252  6e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  47.55 
 
 
315 aa  252  6e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  45.94 
 
 
312 aa  245  8e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  47.15 
 
 
303 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  44.69 
 
 
312 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  46.03 
 
 
307 aa  229  5e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  44.95 
 
 
307 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  48.87 
 
 
306 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  43.52 
 
 
305 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1657  cysteine synthase A  47.5 
 
 
322 aa  228  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  42.14 
 
 
304 aa  227  2e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  41.54 
 
 
301 aa  227  2e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  46.25 
 
 
306 aa  226  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  40.12 
 
 
304 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  44 
 
 
305 aa  225  7e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1210  cysteine synthase  44.44 
 
 
305 aa  225  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.473529  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  41.54 
 
 
321 aa  225  1e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1734  cysteine synthase  48.25 
 
 
301 aa  223  2e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.30022  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  48.5 
 
 
302 aa  223  3e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  43.83 
 
 
305 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  43.65 
 
 
306 aa  222  7e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3006  cysteine synthase A  45.99 
 
 
305 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.599463  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3723  cysteine synthase  45.99 
 
 
305 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  42.5 
 
 
304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  44.72 
 
 
309 aa  219  5e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  44.63 
 
 
311 aa  219  6e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  44.92 
 
 
320 aa  218  1e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1720  cysteine synthase  42.46 
 
 
302 aa  218  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0556189 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4297  cysteine synthase  45.68 
 
 
321 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  43.69 
 
 
306 aa  218  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  46.2 
 
 
291 aa  218  1e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  42.86 
 
 
305 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  41.03 
 
 
307 aa  218  2e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  45.09 
 
 
323 aa  216  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  41.16 
 
 
302 aa  216  4e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0865  cysteine synthase  41.72 
 
 
306 aa  216  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  45.79 
 
 
308 aa  216  5e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1476  cysteine synthase A  43.11 
 
 
324 aa  215  9e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  44 
 
 
320 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  41.28 
 
 
306 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004156  cysteine synthase  46.2 
 
 
322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000187133  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  44.86 
 
 
309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1922  cysteine synthase A  43.37 
 
 
307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  43.6 
 
 
309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  45.25 
 
 
290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3608  cysteine synthase  49.23 
 
 
324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0650049  hitchhiker  0.00838778 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  43.9 
 
 
307 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  38.25 
 
 
304 aa  213  3.9999999999999995e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  43.73 
 
 
307 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  44.55 
 
 
309 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  42.59 
 
 
307 aa  212  7e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  44.55 
 
 
309 aa  212  9e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  45.31 
 
 
305 aa  211  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  45.45 
 
 
304 aa  211  1e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  40.98 
 
 
298 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  43.9 
 
 
307 aa  210  2e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  43.77 
 
 
318 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0858  cysteine synthase B  41.44 
 
 
300 aa  210  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.947605 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0489  cysteine synthase A  44.38 
 
 
322 aa  209  5e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000338281  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0484  cysteine synthase A  41.32 
 
 
324 aa  209  6e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.261567  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  47.87 
 
 
314 aa  209  7e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2103  cysteine synthase  41.23 
 
 
305 aa  208  9e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0401259  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0731  cysteine synthase B  41.09 
 
 
311 aa  208  9e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  46.15 
 
 
322 aa  208  1e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  43.2 
 
 
310 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  43.29 
 
 
307 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0787  cysteine synthase B  40.84 
 
 
300 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.280782 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2361  cysteine synthase A  44.07 
 
 
307 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  43.83 
 
 
320 aa  206  4e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3068  cysteine synthase A  43.03 
 
 
316 aa  206  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145676  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  42.2 
 
 
302 aa  206  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6147  cysteine synthase A  43.52 
 
 
305 aa  205  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02140  cysteine synthase  41.19 
 
 
317 aa  205  8e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.445604  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  46.65 
 
 
308 aa  205  8e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0822  cysteine synthase A  41.82 
 
 
308 aa  205  9e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.326455 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  46.34 
 
 
308 aa  205  9e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  42.77 
 
 
310 aa  204  1e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  42.73 
 
 
309 aa  205  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3031  cysteine synthase B  41.1 
 
 
296 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0917  cysteine synthase B  39.88 
 
 
300 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  48.35 
 
 
307 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2286  cysteine synthase A  46.13 
 
 
309 aa  204  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6440  cysteine synthase A  43.21 
 
 
305 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2304  cysteine synthase  41.95 
 
 
310 aa  203  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  48.35 
 
 
307 aa  203  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  44.28 
 
 
326 aa  203  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  44.55 
 
 
311 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  43.2 
 
 
310 aa  203  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  44.55 
 
 
311 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1646  cysteine synthase B  41.14 
 
 
303 aa  203  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  44.28 
 
 
326 aa  203  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2560  cysteine synthase B  40.18 
 
 
300 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  48.35 
 
 
307 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>