More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1358 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1358  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 305 aa  607  1e-173  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.695081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2310  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  75.57 
 
 		 308 aa  426  1e-118  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.775083 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0509  cysteine synthase  71.38 
 
 		 302 aa  425  1e-118  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.445859  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2995  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  64.22 
 
 		 327 aa  377  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.511755  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1674  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  62.15 
 
 		 324 aa  363  2e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  47.67 
 
 		 310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  47.67 
 
 		 310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  49.82 
 
 		 310 aa  264  1e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  49.68 
 
 		 315 aa  263  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  48.06 
 
 		 312 aa  258  8e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  49.83 
 
 		 303 aa  257  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  52.84 
 
 		 306 aa  251  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  50.16 
 
 		 307 aa  249  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  49.66 
 
 		 291 aa  249  5e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  46.45 
 
 		 312 aa  247  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  49.34 
 
 		 307 aa  245  6e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  47.74 
 
 		 305 aa  245  8e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  53.09 
 
 		 306 aa  242  6e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  47.95 
 
 		 290 aa  241  9e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  47.42 
 
 		 305 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  47.54 
 
 		 306 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  48.87 
 
 		 307 aa  239  5e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  47.59 
 
 		 305 aa  239  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  46.95 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6440  cysteine synthase A  48.86 
 
 		 305 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6147  cysteine synthase A  48.53 
 
 		 305 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1210  cysteine synthase  46.89 
 
 		 305 aa  236  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.473529  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  42.12 
 
 		 304 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0865  cysteine synthase  45.78 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  46.77 
 
 		 305 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  44.98 
 
 		 302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  44.52 
 
 		 321 aa  231  1e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4297  cysteine synthase  48.71 
 
 		 321 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3006  cysteine synthase A  48.71 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.599463  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3723  cysteine synthase  48.71 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  45.18 
 
 		 301 aa  229  4e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  47.1 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  42.72 
 
 		 304 aa  228  1e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2103  cysteine synthase  44.66 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0401259  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  43.18 
 
 		 306 aa  226  3e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  47.16 
 
 		 307 aa  226  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  47.49 
 
 		 307 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  45.39 
 
 		 320 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  44.92 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  45.33 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1657  cysteine synthase A  49.67 
 
 		 322 aa  224  1e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  46.77 
 
 		 309 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  47.16 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0822  cysteine synthase A  45.71 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.326455 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  50.98 
 
 		 308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  50 
 
 		 314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  42.26 
 
 		 304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  47.83 
 
 		 307 aa  219  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  47.16 
 
 		 307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  48.98 
 
 		 305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  46.82 
 
 		 307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  46.82 
 
 		 307 aa  219  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  46.82 
 
 		 307 aa  219  6e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  46.82 
 
 		 307 aa  219  6e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  46.82 
 
 		 307 aa  219  6e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  46.82 
 
 		 307 aa  219  6e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  50.33 
 
 		 308 aa  219  7e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  45.51 
 
 		 302 aa  218  8.999999999999998e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  45.27 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  47.49 
 
 		 323 aa  217  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  46.77 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  46.77 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  43.15 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  46.45 
 
 		 309 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  46.77 
 
 		 309 aa  216  4e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1734  cysteine synthase  46.59 
 
 		 301 aa  216  5e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.30022  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  43.81 
 
 		 311 aa  216  5e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  45.83 
 
 		 311 aa  215  7e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0731  cysteine synthase B  42.35 
 
 		 311 aa  215  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2712  cysteine synthase  52.12 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.470857  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  45.51 
 
 		 311 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3608  cysteine synthase  49.84 
 
 		 324 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0650049  hitchhiker  0.00838778 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  48.06 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1476  cysteine synthase A  44.06 
 
 		 324 aa  214  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  46.45 
 
 		 311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  48.05 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0964  cysteine synthase B  42.57 
 
 		 297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  41.16 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09450  cysteine synthase  48.03 
 
 		 311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.424611  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0917  cysteine synthase B  42.86 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  45.22 
 
 		 308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  40.07 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  42.81 
 
 		 298 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1026  cysteine synthase B  43.51 
 
 		 300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  49.16 
 
 		 308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  44.84 
 
 		 307 aa  212  4.9999999999999996e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0858  cysteine synthase B  41.23 
 
 		 300 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.947605 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  46.33 
 
 		 309 aa  211  1e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1287  cysteine synthase B  41.53 
 
 		 299 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.257463 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  45.14 
 
 		 311 aa  210  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  39.94 
 
 		 307 aa  210  2e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1438  cysteine synthase A  40.19 
 
 		 305 aa  210  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3031  cysteine synthase B  41.28 
 
 		 296 aa  211  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1861  cysteine synthase B  41.18 
 
 		 295 aa  210  3e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0787  cysteine synthase B  40.91 
 
 		 300 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.280782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>