More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1337 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1337  cysteine synthase A  100 
 
 
310 aa  613  9.999999999999999e-175  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.241539  normal  0.869018 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0783  cysteine synthase A  74.16 
 
 
315 aa  392  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2712  cysteine synthase  59.2 
 
 
304 aa  293  2e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.470857  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  53.75 
 
 
311 aa  290  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  50.33 
 
 
310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  53.16 
 
 
304 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  49.34 
 
 
310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  49.34 
 
 
310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  53.97 
 
 
308 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  56.25 
 
 
310 aa  281  9e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0369  cysteine synthase  49.5 
 
 
316 aa  279  4e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.425105  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  54.13 
 
 
308 aa  279  5e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  50.98 
 
 
311 aa  278  1e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  54.61 
 
 
309 aa  276  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  54.93 
 
 
310 aa  276  3e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  55.59 
 
 
307 aa  276  4e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  50.99 
 
 
312 aa  275  9e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  51.15 
 
 
317 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  51.95 
 
 
313 aa  272  5.000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  52.94 
 
 
310 aa  271  8.000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  51.66 
 
 
318 aa  271  9e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3068  cysteine synthase A  50.66 
 
 
316 aa  271  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1832  cysteine synthase A  50.16 
 
 
317 aa  271  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.118091  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0902  cysteine synthase A  46.8 
 
 
299 aa  270  2e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000036612  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  53.29 
 
 
309 aa  270  2e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  50.33 
 
 
312 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  53.82 
 
 
309 aa  269  4e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  50.97 
 
 
320 aa  269  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  49.84 
 
 
317 aa  268  5.9999999999999995e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  50.16 
 
 
317 aa  268  8.999999999999999e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  53.47 
 
 
309 aa  267  2e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  51.48 
 
 
309 aa  267  2e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  50.49 
 
 
320 aa  267  2e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  51.5 
 
 
320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0990  cysteine synthase A  46.13 
 
 
299 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.0058381  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  52.44 
 
 
311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1476  cysteine synthase A  50.16 
 
 
324 aa  266  4e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  46.2 
 
 
304 aa  266  4e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  49.84 
 
 
311 aa  265  5.999999999999999e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  45.54 
 
 
304 aa  264  1e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  50.65 
 
 
330 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  51.3 
 
 
320 aa  264  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  53.14 
 
 
308 aa  263  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  50.97 
 
 
320 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  52.65 
 
 
309 aa  263  3e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  52.27 
 
 
319 aa  263  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  52.13 
 
 
310 aa  263  3e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  49.34 
 
 
311 aa  263  3e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  46.2 
 
 
307 aa  263  3e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  50.47 
 
 
339 aa  263  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  52.63 
 
 
309 aa  263  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  47.67 
 
 
304 aa  263  4e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  53.11 
 
 
309 aa  262  6e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  53.44 
 
 
309 aa  262  6e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  48.69 
 
 
310 aa  261  8e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  51.32 
 
 
328 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1790  cysteine synthase  52.3 
 
 
323 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.475157  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  51.14 
 
 
307 aa  261  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1224  cysteine synthase A  44.52 
 
 
300 aa  260  2e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.47956e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  54.61 
 
 
309 aa  260  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  47.54 
 
 
307 aa  260  2e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  53.47 
 
 
306 aa  260  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  50.82 
 
 
309 aa  259  3e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  52.46 
 
 
310 aa  260  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  50.81 
 
 
305 aa  259  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  52.48 
 
 
307 aa  259  4e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  52.19 
 
 
309 aa  258  7e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0952  cysteine synthase  52.82 
 
 
311 aa  258  9e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.820864  normal  0.859633 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2520  cysteine synthase A  50.67 
 
 
341 aa  258  9e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  52.12 
 
 
327 aa  257  1e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  51.3 
 
 
320 aa  257  2e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  49.83 
 
 
311 aa  257  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  47.83 
 
 
321 aa  257  2e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  51.5 
 
 
308 aa  256  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  49.5 
 
 
307 aa  256  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0484  cysteine synthase A  48.52 
 
 
324 aa  256  3e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.261567  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  51.32 
 
 
310 aa  256  4e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3871  cysteine synthase A  53.29 
 
 
324 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.674292  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  53.62 
 
 
310 aa  255  6e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  53.04 
 
 
306 aa  255  6e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1413  cysteine synthase  51.49 
 
 
324 aa  255  8e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  47.56 
 
 
317 aa  254  9e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0024  cysteine synthase A  52.53 
 
 
307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  53.11 
 
 
309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  50.98 
 
 
323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  51.83 
 
 
311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  54.82 
 
 
311 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4092  cysteine synthase A  52.63 
 
 
324 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  50.83 
 
 
308 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  53.11 
 
 
309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  49.83 
 
 
320 aa  253  3e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2356  cysteine synthase A  50.66 
 
 
322 aa  253  3e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  50.16 
 
 
316 aa  253  3e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  51.68 
 
 
308 aa  253  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2903  cysteine synthase A  51.32 
 
 
322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  53.97 
 
 
314 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3639  cysteine synthase A  52.46 
 
 
325 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0668301  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  52.63 
 
 
308 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  51.95 
 
 
320 aa  252  5.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  51.49 
 
 
309 aa  252  5.000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>