More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0783 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0783  cysteine synthase A  100 
 
 
315 aa  622  1e-177  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1337  cysteine synthase A  74.16 
 
 
310 aa  412  1e-114  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.241539  normal  0.869018 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2712  cysteine synthase  58.28 
 
 
304 aa  294  1e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.470857  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  53.57 
 
 
311 aa  291  1e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  56.35 
 
 
309 aa  290  3e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  48.69 
 
 
304 aa  288  7e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  55.37 
 
 
310 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0369  cysteine synthase  50.66 
 
 
316 aa  281  1e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.425105  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1832  cysteine synthase A  51.8 
 
 
317 aa  281  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.118091  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  54.72 
 
 
310 aa  279  6e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  49.35 
 
 
311 aa  275  6e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  51.8 
 
 
317 aa  275  9e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  54.02 
 
 
330 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  52.65 
 
 
320 aa  273  3e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  50.81 
 
 
310 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  51.95 
 
 
310 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  53.4 
 
 
309 aa  273  4.0000000000000004e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  53.05 
 
 
313 aa  273  4.0000000000000004e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3068  cysteine synthase A  50.99 
 
 
316 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145676  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  48.05 
 
 
307 aa  271  9e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  50.16 
 
 
304 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  50.65 
 
 
308 aa  271  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  54.1 
 
 
311 aa  270  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  50 
 
 
318 aa  269  4e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  50 
 
 
312 aa  268  8e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  51.14 
 
 
311 aa  268  8.999999999999999e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  49.67 
 
 
310 aa  268  1e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  53.18 
 
 
308 aa  267  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  53.05 
 
 
320 aa  268  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  56.04 
 
 
311 aa  267  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0902  cysteine synthase A  47.18 
 
 
299 aa  268  1e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000036612  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  53.05 
 
 
319 aa  266  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004156  cysteine synthase  54.3 
 
 
322 aa  267  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000187133  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09450  cysteine synthase  53.27 
 
 
311 aa  266  2e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.424611  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  50.99 
 
 
320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  51.95 
 
 
309 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  52.56 
 
 
327 aa  266  4e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  48.69 
 
 
310 aa  266  5e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  48.69 
 
 
310 aa  266  5e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  51.13 
 
 
309 aa  265  5e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  51.79 
 
 
309 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  53.42 
 
 
311 aa  265  7e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  52.1 
 
 
311 aa  265  8e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  53.38 
 
 
320 aa  265  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0990  cysteine synthase A  46.51 
 
 
299 aa  264  1e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.0058381  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  52.79 
 
 
308 aa  264  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  49.84 
 
 
312 aa  265  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  53.42 
 
 
309 aa  264  2e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  47.67 
 
 
304 aa  264  2e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0489  cysteine synthase A  53.64 
 
 
322 aa  262  6e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000338281  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  49.68 
 
 
339 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01309  cysteine synthase A  54.82 
 
 
322 aa  261  8e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  51.95 
 
 
309 aa  261  8e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1466  cysteine synthase  54.11 
 
 
334 aa  261  1e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00108529  normal  0.10478 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  56.48 
 
 
311 aa  260  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2356  cysteine synthase A  51.61 
 
 
322 aa  260  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  53.27 
 
 
306 aa  260  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  52.13 
 
 
309 aa  260  2e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  52.12 
 
 
308 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  49.51 
 
 
320 aa  259  4e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  52.6 
 
 
311 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  49.51 
 
 
305 aa  259  4e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1790  cysteine synthase  53.62 
 
 
323 aa  259  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.475157  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  51.62 
 
 
309 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  45.1 
 
 
304 aa  259  4e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  52.6 
 
 
311 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  52.49 
 
 
309 aa  259  5.0000000000000005e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  51.63 
 
 
311 aa  259  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  52.61 
 
 
309 aa  259  5.0000000000000005e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  50.65 
 
 
317 aa  259  6e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  49.68 
 
 
317 aa  258  7e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2701  cysteine synthase A  51.5 
 
 
323 aa  258  7e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000531344  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  50 
 
 
309 aa  258  7e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  53.11 
 
 
309 aa  258  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  51.3 
 
 
309 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  50.16 
 
 
311 aa  258  1e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02314  cysteine synthase A, O-acetylserine sulfhydrolase A subunit  51.16 
 
 
323 aa  257  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000113698  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1247  cysteine synthase A  51.16 
 
 
323 aa  257  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000402338  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1264  cysteine synthase A  51.16 
 
 
323 aa  257  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000422758  decreased coverage  0.000025009 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02168  cysteine synthase A  53.16 
 
 
321 aa  257  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2776  cysteine synthase A  52.61 
 
 
312 aa  256  2e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2549  cysteine synthase A  51.16 
 
 
323 aa  257  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000853816  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02275  hypothetical protein  51.16 
 
 
323 aa  257  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000749692  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2569  cysteine synthase A  51.16 
 
 
323 aa  257  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00204709  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1502  cysteine synthase A  52.09 
 
 
321 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18267e-17 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3645  cysteine synthase A  51.16 
 
 
323 aa  257  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00108358  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  51.13 
 
 
309 aa  256  2e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2766  cysteine synthase A  51.16 
 
 
323 aa  257  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163561  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2903  cysteine synthase A  52.98 
 
 
322 aa  256  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2370  cysteine synthase A  52.98 
 
 
322 aa  256  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  52.6 
 
 
309 aa  256  3e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  50.16 
 
 
320 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  51.8 
 
 
311 aa  256  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1413  cysteine synthase  53.14 
 
 
324 aa  256  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1476  cysteine synthase A  47.23 
 
 
324 aa  255  5e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  52.09 
 
 
320 aa  256  5e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  50.16 
 
 
328 aa  255  8e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2520  cysteine synthase A  50.83 
 
 
341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1567  cysteine synthase  52.32 
 
 
322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  50.98 
 
 
311 aa  253  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>