More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1287 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1287  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  100 
 
 
304 aa  615  1e-175  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.870324  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0885  cysteine synthase  71.95 
 
 
303 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1759  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  66.56 
 
 
303 aa  392  1e-108  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4269  O-acetylserine lyase  59.67 
 
 
307 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4506  O-acetylserine lyase  59.67 
 
 
307 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0207318  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4106  cysteine synthase  59.67 
 
 
307 aa  365  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4117  cysteine synthase  59.67 
 
 
307 aa  365  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4601  O-acetylserine lyase  59.67 
 
 
307 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4453  O-acetylserine lyase  59.67 
 
 
307 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4455  O-acetylserine lyase  59.67 
 
 
307 aa  364  1e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4492  O-acetylserine lyase  59.67 
 
 
307 aa  364  1e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.986798  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0744  O-acetylserine lyase  59.67 
 
 
307 aa  364  1e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4220  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  59.33 
 
 
307 aa  363  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2475  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  60 
 
 
307 aa  361  8e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3085  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  57.62 
 
 
307 aa  360  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.520498  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1553  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  64.57 
 
 
304 aa  355  3.9999999999999996e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222613  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0978  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  59 
 
 
307 aa  353  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  47.19 
 
 
302 aa  276  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0094  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  48.82 
 
 
302 aa  275  9e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1228  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  47.19 
 
 
302 aa  272  4.0000000000000004e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0481  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  48.31 
 
 
318 aa  271  8.000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000231361  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0494  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  48.31 
 
 
318 aa  271  8.000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00183291  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  47.16 
 
 
302 aa  266  4e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  43.67 
 
 
315 aa  252  7e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  43.23 
 
 
311 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0166  cysteine synthase family protein  47.83 
 
 
302 aa  242  7e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  40.52 
 
 
304 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1013  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.49 
 
 
326 aa  239  5e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  40.07 
 
 
306 aa  238  9e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  43.05 
 
 
302 aa  236  3e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.53 
 
 
326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.629074  normal  0.0111881 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  39.02 
 
 
304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  43 
 
 
304 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  41.12 
 
 
310 aa  232  6e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  41.12 
 
 
310 aa  232  6e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3195  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.09 
 
 
326 aa  232  7.000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421019  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  44.37 
 
 
308 aa  231  8.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0932  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.23 
 
 
327 aa  231  9e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  43.09 
 
 
312 aa  231  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  41.75 
 
 
306 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  42.95 
 
 
308 aa  230  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  39.87 
 
 
307 aa  229  4e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  40.92 
 
 
304 aa  229  4e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  42.57 
 
 
318 aa  229  6e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  44.44 
 
 
310 aa  229  6e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  40.46 
 
 
310 aa  228  7e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  43.05 
 
 
461 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  43.61 
 
 
305 aa  228  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  43 
 
 
308 aa  226  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  38.51 
 
 
315 aa  225  6e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  39.14 
 
 
311 aa  225  9e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  44.81 
 
 
311 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  42.11 
 
 
312 aa  224  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  40.68 
 
 
290 aa  224  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  43.97 
 
 
317 aa  224  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  39.53 
 
 
303 aa  224  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  41.33 
 
 
304 aa  223  3e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  41.36 
 
 
291 aa  223  3e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1438  cysteine synthase A  39.6 
 
 
305 aa  221  9e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  44.44 
 
 
309 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  41.72 
 
 
298 aa  220  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  41.91 
 
 
307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  39.47 
 
 
301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2623  cysteine synthase A  39.68 
 
 
329 aa  219  5e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  40.92 
 
 
307 aa  219  7e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  41.75 
 
 
307 aa  218  7e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  41 
 
 
306 aa  218  8.999999999999998e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  40.67 
 
 
306 aa  218  8.999999999999998e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  44.12 
 
 
317 aa  218  1e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  41.83 
 
 
310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0162  cysteine synthase  39.22 
 
 
305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  45.7 
 
 
327 aa  216  4e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  38.16 
 
 
321 aa  215  9e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0902  cysteine synthase A  40.27 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000036612  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  42.63 
 
 
309 aa  213  1.9999999999999998e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  39.87 
 
 
310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  39.87 
 
 
306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2103  cysteine synthase  40.53 
 
 
305 aa  212  5.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0401259  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  40.46 
 
 
302 aa  212  7e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  39.4 
 
 
307 aa  211  1e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  41.12 
 
 
309 aa  210  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  42.19 
 
 
310 aa  210  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0990  cysteine synthase A  39.6 
 
 
299 aa  209  5e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.0058381  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  40 
 
 
309 aa  209  5e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  43.42 
 
 
309 aa  209  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  40.13 
 
 
310 aa  209  6e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0537  cysteine synthase  41.06 
 
 
321 aa  209  6e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00106309  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  41.16 
 
 
309 aa  209  6e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1734  cysteine synthase  36.88 
 
 
301 aa  208  7e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.30022  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  37.01 
 
 
332 aa  209  7e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  43 
 
 
322 aa  207  1e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  44.44 
 
 
317 aa  207  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1720  cysteine synthase  39.93 
 
 
302 aa  207  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0556189 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  39.87 
 
 
310 aa  207  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  38.74 
 
 
305 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  39.2 
 
 
302 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  38.51 
 
 
323 aa  207  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  40.2 
 
 
307 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2286  cysteine synthase A  42.02 
 
 
309 aa  206  3e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  43.28 
 
 
308 aa  206  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>