More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3195 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3195  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 
326 aa  658    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421019  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1013  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  82.72 
 
 
326 aa  519  1e-146  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  74.07 
 
 
326 aa  476  1e-133  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.629074  normal  0.0111881 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0932  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  62.04 
 
 
327 aa  377  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3085  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  49.36 
 
 
307 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.520498  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2475  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  47.94 
 
 
307 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4455  O-acetylserine lyase  48.41 
 
 
307 aa  273  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4506  O-acetylserine lyase  48.09 
 
 
307 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0207318  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4269  O-acetylserine lyase  48.09 
 
 
307 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4106  cysteine synthase  48.09 
 
 
307 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4117  cysteine synthase  48.09 
 
 
307 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4601  O-acetylserine lyase  48.09 
 
 
307 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4453  O-acetylserine lyase  48.09 
 
 
307 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0744  O-acetylserine lyase  47.77 
 
 
307 aa  271  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0978  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  47.62 
 
 
307 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4220  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  47.77 
 
 
307 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4492  O-acetylserine lyase  47.45 
 
 
307 aa  268  7e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.986798  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  48.08 
 
 
302 aa  252  7e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  42.31 
 
 
302 aa  242  7.999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0885  cysteine synthase  45.05 
 
 
303 aa  241  1e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1287  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  44.09 
 
 
304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.870324  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1759  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  47.92 
 
 
303 aa  233  4.0000000000000004e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1228  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.59 
 
 
302 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0166  cysteine synthase family protein  42.95 
 
 
302 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  41.08 
 
 
311 aa  216  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  39.51 
 
 
315 aa  215  7e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  41.49 
 
 
310 aa  215  8e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  39.68 
 
 
304 aa  212  7e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  42.55 
 
 
318 aa  212  9e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0162  cysteine synthase  44.48 
 
 
305 aa  210  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  39.81 
 
 
310 aa  210  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  39.81 
 
 
310 aa  210  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  40.62 
 
 
461 aa  210  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  39.03 
 
 
304 aa  210  3e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  39.81 
 
 
332 aa  209  7e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  40.63 
 
 
321 aa  207  2e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  39.81 
 
 
311 aa  206  4e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  39.1 
 
 
307 aa  206  4e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  38.99 
 
 
312 aa  206  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  40.32 
 
 
301 aa  206  5e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  41.07 
 
 
302 aa  206  6e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  38.99 
 
 
312 aa  204  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1790  cysteine synthase  43.23 
 
 
323 aa  203  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.475157  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  40.19 
 
 
310 aa  203  3e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  39.81 
 
 
307 aa  203  3e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  42.99 
 
 
308 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  41.23 
 
 
320 aa  199  7e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  41.08 
 
 
463 aa  198  9e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  37.34 
 
 
304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  41.38 
 
 
308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  40.56 
 
 
326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0481  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  41.35 
 
 
318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000231361  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1476  cysteine synthase A  39.74 
 
 
324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0494  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.35 
 
 
318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00183291  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  40.76 
 
 
310 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0094  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  37.78 
 
 
302 aa  196  7e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  42.99 
 
 
310 aa  195  7e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  41.01 
 
 
456 aa  195  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.77 
 
 
459 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2623  cysteine synthase A  40.75 
 
 
329 aa  194  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  39.94 
 
 
320 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  39.23 
 
 
304 aa  194  2e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2430  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family protein  38.82 
 
 
327 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00735557  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  41.72 
 
 
306 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  41.53 
 
 
307 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  39.42 
 
 
303 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1553  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  44.16 
 
 
304 aa  193  3e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222613  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0478  cysteine synthases  39.81 
 
 
773 aa  193  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00249553  hitchhiker  0.000140585 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  36.33 
 
 
298 aa  193  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  39.68 
 
 
304 aa  192  5e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  39.94 
 
 
307 aa  192  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  39.62 
 
 
309 aa  192  5e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1337  cysteine synthase A  45.48 
 
 
310 aa  192  5e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.241539  normal  0.869018 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2286  cysteine synthase A  43.17 
 
 
309 aa  192  7e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  39.94 
 
 
310 aa  192  8e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1697  cysteine synthase A  40.13 
 
 
305 aa  192  9e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1831  cysteine synthase A  40.13 
 
 
305 aa  192  9e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  41.4 
 
 
305 aa  192  9e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1653  cysteine synthase A  39.81 
 
 
305 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  38.46 
 
 
458 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2712  cysteine synthase  45.22 
 
 
304 aa  191  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.470857  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1678  cysteine synthase A  40.13 
 
 
305 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.423565  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  41.9 
 
 
309 aa  190  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1875  cysteine synthase A  40.13 
 
 
305 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101872 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0509  cysteine synthase  45.4 
 
 
302 aa  191  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.445859  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1954  cysteine synthase A  40.13 
 
 
305 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  42.95 
 
 
306 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  40.74 
 
 
317 aa  191  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1691  cysteine synthase A  39.81 
 
 
305 aa  190  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  36.91 
 
 
306 aa  191  2e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1832  cysteine synthase A  40.89 
 
 
317 aa  191  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.118091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3506  cysteine synthase A  39.81 
 
 
305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  40.89 
 
 
308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  39.44 
 
 
311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  40.45 
 
 
310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1919  cysteine synthase A  39.49 
 
 
305 aa  189  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468327  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2832  cysteine synthase B  39.29 
 
 
294 aa  189  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2454  cysteine synthase  39.29 
 
 
294 aa  189  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0944548  normal  0.580019 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.46 
 
 
459 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  37.16 
 
 
459 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>