More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0094 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0094  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  100 
 
 		 302 aa  617  1e-176  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0494  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  71.48 
 
 		 318 aa  442  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00183291  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0481  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  71.48 
 
 		 318 aa  442  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000231361  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2475  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  52.36 
 
 		 307 aa  279  5e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0978  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  52.7 
 
 		 307 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4455  O-acetylserine lyase  52.03 
 
 		 307 aa  275  8e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4269  O-acetylserine lyase  51.69 
 
 		 307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4106  cysteine synthase  51.69 
 
 		 307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4117  cysteine synthase  51.69 
 
 		 307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4601  O-acetylserine lyase  51.69 
 
 		 307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4453  O-acetylserine lyase  51.69 
 
 		 307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4506  O-acetylserine lyase  51.69 
 
 		 307 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0207318  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4220  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  51.35 
 
 		 307 aa  271  7e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0885  cysteine synthase  51.85 
 
 		 303 aa  271  9e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0744  O-acetylserine lyase  51.01 
 
 		 307 aa  271  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4492  O-acetylserine lyase  51.01 
 
 		 307 aa  270  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.986798  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3085  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  50.68 
 
 		 307 aa  268  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.520498  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  49.66 
 
 		 302 aa  259  4e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1287  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  48.82 
 
 		 304 aa  254  9e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.870324  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1553  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  47.97 
 
 		 304 aa  241  1e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222613  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0166  cysteine synthase family protein  50 
 
 		 302 aa  237  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  43.88 
 
 		 302 aa  236  4e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  43.81 
 
 		 315 aa  230  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1759  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  47.32 
 
 		 303 aa  229  5e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1228  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.16 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  41.92 
 
 		 301 aa  215  9e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  43.39 
 
 		 312 aa  215  9e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  43.05 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  40.89 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  40.4 
 
 		 310 aa  209  4e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  39.73 
 
 		 310 aa  205  9e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  39.73 
 
 		 310 aa  205  9e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  41.55 
 
 		 461 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  39 
 
 		 307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  39.19 
 
 		 304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1438  cysteine synthase A  42.09 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  40.4 
 
 		 298 aa  195  7e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  40.07 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  37.17 
 
 		 455 aa  191  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  42.52 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  38.38 
 
 		 304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0932  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.37 
 
 		 327 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  37.87 
 
 		 302 aa  189  5e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  39.93 
 
 		 320 aa  189  7e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0149  cysteine synthase  36.39 
 
 		 306 aa  188  8e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  39.31 
 
 		 291 aa  187  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  41.28 
 
 		 307 aa  187  1e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  40.41 
 
 		 320 aa  187  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  42.57 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  39.93 
 
 		 307 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  39.46 
 
 		 311 aa  187  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  38.97 
 
 		 290 aa  186  5e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  39.93 
 
 		 320 aa  185  7e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_94354  predicted protein  35.49 
 
 		 387 aa  185  8e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.25713  hitchhiker  0.00194835 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1632  cysteine synthase A  34.6 
 
 		 349 aa  185  9e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  41.89 
 
 		 310 aa  185  9e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  36.82 
 
 		 311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  37.93 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  35.69 
 
 		 306 aa  183  3e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  39.53 
 
 		 308 aa  183  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1557  cysteine synthase  34.29 
 
 		 349 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1013  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.94 
 
 		 326 aa  182  8.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.01 
 
 		 479 aa  182  9.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0162  cysteine synthase  39.73 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.26 
 
 		 326 aa  181  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.629074  normal  0.0111881 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  41.53 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2316  cysteine synthase  34.29 
 
 		 349 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  41.02 
 
 		 307 aa  180  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  40.27 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  40.27 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  40.27 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  40.13 
 
 		 311 aa  180  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  40.68 
 
 		 307 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  40.27 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1322  cysteine synthase A  41.44 
 
 		 300 aa  180  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  40.27 
 
 		 307 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3195  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.78 
 
 		 326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  38.11 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2901  cysteine synthase  38.91 
 
 		 317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1529  cysteine synthase A  41.1 
 
 		 300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000033727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  37.54 
 
 		 456 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  39.93 
 
 		 307 aa  179  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  40.47 
 
 		 308 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1720  cysteine synthase  39.12 
 
 		 302 aa  179  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0556189 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  42.11 
 
 		 306 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3210  cysteine synthase A  38.31 
 
 		 319 aa  179  5.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112501  normal  0.950187 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  37.46 
 
 		 307 aa  179  5.999999999999999e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  40.6 
 
 		 307 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  40.88 
 
 		 307 aa  179  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  40.27 
 
 		 307 aa  178  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1091  cysteine synthase  41.22 
 
 		 303 aa  178  8e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000826995  decreased coverage  0.00308217 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  41.61 
 
 		 308 aa  178  9e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  39.34 
 
 		 460 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  37.54 
 
 		 456 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  41.22 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  41.75 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  41.2 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  36.54 
 
 		 455 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  39.93 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  35.65 
 
 		 463 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>