More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0170 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  100 
 
 		 302 aa  597  1e-169  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0166  cysteine synthase family protein  97.68 
 
 		 302 aa  555  1e-157  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1228  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  63.88 
 
 		 302 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  61.54 
 
 		 302 aa  391  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2475  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  54.46 
 
 		 307 aa  324  1e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0978  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  53.8 
 
 		 307 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3085  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  51.82 
 
 		 307 aa  318  1e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.520498  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4455  O-acetylserine lyase  52.48 
 
 		 307 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4453  O-acetylserine lyase  52.15 
 
 		 307 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4269  O-acetylserine lyase  52.15 
 
 		 307 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4106  cysteine synthase  52.15 
 
 		 307 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4117  cysteine synthase  52.15 
 
 		 307 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4601  O-acetylserine lyase  52.15 
 
 		 307 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4506  O-acetylserine lyase  52.15 
 
 		 307 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0207318  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4492  O-acetylserine lyase  52.15 
 
 		 307 aa  311  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.986798  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0744  O-acetylserine lyase  51.82 
 
 		 307 aa  311  9e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4220  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  51.82 
 
 		 307 aa  311  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  49.83 
 
 		 315 aa  308  5.9999999999999995e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  47.02 
 
 		 461 aa  276  4e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  45.54 
 
 		 312 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  44.52 
 
 		 312 aa  269  4e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0885  cysteine synthase  50 
 
 		 303 aa  266  5e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  47.35 
 
 		 304 aa  265  8.999999999999999e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  45.72 
 
 		 306 aa  263  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  45.48 
 
 		 302 aa  262  4.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  44.92 
 
 		 307 aa  262  6e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  44.74 
 
 		 308 aa  261  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0094  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  49.66 
 
 		 302 aa  259  4e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  45.1 
 
 		 311 aa  259  4e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  46.73 
 
 		 308 aa  258  8e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  45.48 
 
 		 298 aa  258  8e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  47.18 
 
 		 302 aa  258  8e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  42.16 
 
 		 315 aa  257  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  43.81 
 
 		 310 aa  257  2e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0494  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  47.62 
 
 		 318 aa  255  5e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00183291  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0481  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  47.62 
 
 		 318 aa  255  5e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000231361  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  41.97 
 
 		 332 aa  255  8e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  47.67 
 
 		 306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  43.28 
 
 		 304 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  44.74 
 
 		 311 aa  253  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.42 
 
 		 459 aa  252  6e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1301  cysteine synthase A  44.81 
 
 		 309 aa  252  7e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.568697 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  42.95 
 
 		 310 aa  251  8.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  42.95 
 
 		 308 aa  251  8.000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  42.95 
 
 		 310 aa  251  8.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5286  cystathionine beta-synthase  43.71 
 
 		 459 aa  251  9.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.153908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  40.66 
 
 		 309 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2361  cysteine synthase A  44.92 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  43.28 
 
 		 304 aa  251  1e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  46.71 
 
 		 316 aa  250  2e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  43.62 
 
 		 320 aa  250  2e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  46.84 
 
 		 317 aa  250  2e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  41.95 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  45.81 
 
 		 316 aa  250  2e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  43.28 
 
 		 310 aa  250  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  46.38 
 
 		 309 aa  250  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  40.26 
 
 		 455 aa  249  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  47.51 
 
 		 317 aa  249  3e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  43.23 
 
 		 456 aa  250  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  45.6 
 
 		 309 aa  249  3e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  43.28 
 
 		 456 aa  249  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1922  cysteine synthase A  43.93 
 
 		 307 aa  249  4e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1759  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  49.33 
 
 		 303 aa  249  4e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  43.62 
 
 		 320 aa  249  5e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  47.84 
 
 		 317 aa  249  5e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  44.85 
 
 		 321 aa  248  6e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  43.23 
 
 		 463 aa  249  6e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  43.51 
 
 		 319 aa  248  8e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  38.36 
 
 		 311 aa  247  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  43.09 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0478  cysteine synthases  40.26 
 
 		 773 aa  248  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00249553  hitchhiker  0.000140585 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  42.62 
 
 		 318 aa  246  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  40.98 
 
 		 309 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  42.95 
 
 		 309 aa  247  2e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  42.62 
 
 		 309 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  46.05 
 
 		 305 aa  246  3e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  44.26 
 
 		 314 aa  246  3e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  41 
 
 		 303 aa  246  3e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  40.98 
 
 		 309 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3005  cysteine synthase B  41.55 
 
 		 308 aa  246  4e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.951108  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  44.81 
 
 		 307 aa  246  4e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  43.79 
 
 		 311 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  43.23 
 
 		 456 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  43.38 
 
 		 308 aa  245  6e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  44.37 
 
 		 308 aa  245  6e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.81 
 
 		 459 aa  245  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1438  cysteine synthase A  43.42 
 
 		 305 aa  245  6.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1287  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  47.16 
 
 		 304 aa  245  6.999999999999999e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.870324  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  45.1 
 
 		 323 aa  244  9e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  45.21 
 
 		 291 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.48 
 
 		 459 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  45.25 
 
 		 309 aa  244  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  43.65 
 
 		 309 aa  244  9.999999999999999e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  44.26 
 
 		 311 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  43.75 
 
 		 311 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  44.52 
 
 		 301 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  44.08 
 
 		 311 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  43.54 
 
 		 306 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  43.75 
 
 		 454 aa  243  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  44.75 
 
 		 307 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>