More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2475 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2475  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 307 aa  625  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0978  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  86.6 
 
 		 307 aa  559  1e-158  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4455  O-acetylserine lyase  74.75 
 
 		 307 aa  484  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4220  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  74.75 
 
 		 307 aa  484  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0744  O-acetylserine lyase  74.43 
 
 		 307 aa  482  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4269  O-acetylserine lyase  74.43 
 
 		 307 aa  481  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4106  cysteine synthase  74.43 
 
 		 307 aa  481  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4117  cysteine synthase  74.43 
 
 		 307 aa  481  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4492  O-acetylserine lyase  74.75 
 
 		 307 aa  483  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.986798  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4601  O-acetylserine lyase  74.43 
 
 		 307 aa  481  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4506  O-acetylserine lyase  74.43 
 
 		 307 aa  482  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0207318  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4453  O-acetylserine lyase  74.43 
 
 		 307 aa  481  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3085  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  73.44 
 
 		 307 aa  481  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.520498  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0885  cysteine synthase  60.33 
 
 		 303 aa  343  2e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1287  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  60 
 
 		 304 aa  340  1e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.870324  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  54.46 
 
 		 302 aa  324  1e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1759  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  57.67 
 
 		 303 aa  314  9.999999999999999e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1228  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  50.34 
 
 		 302 aa  305  7e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  48.5 
 
 		 302 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  51.79 
 
 		 310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  47.85 
 
 		 315 aa  300  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0166  cysteine synthase family protein  55.12 
 
 		 302 aa  300  2e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  48.53 
 
 		 311 aa  300  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  49.19 
 
 		 317 aa  292  5e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  49.51 
 
 		 317 aa  288  7e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  50 
 
 		 310 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1553  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  54.46 
 
 		 304 aa  286  4e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222613  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  46.08 
 
 		 304 aa  285  8e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  46.25 
 
 		 310 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  51.15 
 
 		 305 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  47.88 
 
 		 309 aa  280  3e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0094  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  52.36 
 
 		 302 aa  279  5e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  50 
 
 		 327 aa  276  4e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  49.84 
 
 		 317 aa  275  5e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  48.51 
 
 		 308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0494  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  51.18 
 
 		 318 aa  274  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00183291  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0481  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  51.18 
 
 		 318 aa  274  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000231361  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1301  cysteine synthase A  47.08 
 
 		 309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.568697 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  46.23 
 
 		 308 aa  269  5e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  47.9 
 
 		 311 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  45.45 
 
 		 318 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  45.15 
 
 		 310 aa  267  2e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  44.26 
 
 		 304 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  43.46 
 
 		 304 aa  265  5.999999999999999e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  47.54 
 
 		 309 aa  263  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  46.38 
 
 		 311 aa  263  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3195  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  47.94 
 
 		 326 aa  263  3e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421019  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1919  cysteine synthase A  47.21 
 
 		 305 aa  263  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468327  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  44.44 
 
 		 461 aa  263  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  44.3 
 
 		 308 aa  263  3e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  45.9 
 
 		 308 aa  263  3e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  44.63 
 
 		 312 aa  263  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1954  cysteine synthase A  47.21 
 
 		 305 aa  263  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  45.6 
 
 		 309 aa  263  4e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1438  cysteine synthase A  46.89 
 
 		 305 aa  263  4e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.412307  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1837  cysteine synthase A  47.21 
 
 		 305 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1678  cysteine synthase A  46.89 
 
 		 305 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.423565  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1875  cysteine synthase A  46.89 
 
 		 305 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101872 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3506  cysteine synthase A  47.21 
 
 		 305 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1653  cysteine synthase A  46.89 
 
 		 305 aa  262  6e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  42.81 
 
 		 307 aa  262  6e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1697  cysteine synthase A  46.56 
 
 		 305 aa  261  8e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  44.67 
 
 		 310 aa  261  8e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1831  cysteine synthase A  46.56 
 
 		 305 aa  261  8e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  46.05 
 
 		 309 aa  261  8e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  44.67 
 
 		 310 aa  261  8e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  44.55 
 
 		 309 aa  261  8e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1691  cysteine synthase A  46.89 
 
 		 305 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1013  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  48.08 
 
 		 326 aa  261  1e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  46.43 
 
 		 316 aa  260  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2286  cysteine synthase A  47.56 
 
 		 309 aa  260  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  43.81 
 
 		 312 aa  259  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  43.52 
 
 		 304 aa  259  4e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  45.67 
 
 		 298 aa  259  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  45.57 
 
 		 309 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  46.56 
 
 		 307 aa  258  6e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  45.93 
 
 		 311 aa  258  7e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  44.75 
 
 		 306 aa  257  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  43.46 
 
 		 307 aa  256  3e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  44.63 
 
 		 306 aa  256  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  41.64 
 
 		 311 aa  256  4e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  45.42 
 
 		 310 aa  255  7e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.51 
 
 		 326 aa  255  7e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.629074  normal  0.0111881 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  44.34 
 
 		 322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  43.37 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2361  cysteine synthase A  45.9 
 
 		 307 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  47.54 
 
 		 309 aa  253  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  47.21 
 
 		 307 aa  253  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  41.64 
 
 		 308 aa  253  3e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  47.21 
 
 		 307 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  42.16 
 
 		 310 aa  252  6e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  45 
 
 		 307 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2623  cysteine synthase A  42.16 
 
 		 329 aa  251  8.000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  47.21 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  42.39 
 
 		 320 aa  251  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  43.71 
 
 		 311 aa  251  1e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  43.79 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0162  cysteine synthase  43.71 
 
 		 305 aa  251  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  45.28 
 
 		 309 aa  251  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  47.39 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>